More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0243 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_0243  hypothetical protein  100 
 
 		 251 aa  484  1e-136  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.021198  normal  0.905832 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0022  ABC-2 type transporter  57.77 
 
 		 251 aa  298  4e-80  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1227  ABC-2 type transporter  44.49 
 
 		 249 aa  229  2e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1576  hypothetical protein  45.18 
 
 		 256 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2468  ABC-2 type transporter  38.71 
 
 		 248 aa  172  5e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2485  hypothetical protein  40.85 
 
 		 255 aa  170  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.410986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2221  ABC-2 type transporter  35.71 
 
 		 241 aa  166  5e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0188043 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0633  ABC-2 type transporter  35.98 
 
 		 259 aa  165  8e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2256  ABC-2 type transporter  40.27 
 
 		 247 aa  147  1.0000000000000001e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.038902 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2321  ABC-2 type transporter  30 
 
 		 245 aa  102  5e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0987  ABC-2 type transporter  30.84 
 
 		 247 aa  99.8  4e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0449521 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1170  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  31.47 
 
 		 253 aa  86.3  5e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0271  ABC-2 type transporter  28.5 
 
 		 245 aa  83.6  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0843829  hitchhiker  0.000145713 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1593  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  30.65 
 
 		 255 aa  81.6  0.00000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.327285  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0785  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  29.08 
 
 		 253 aa  80.5  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1165  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.72 
 
 		 253 aa  76.3  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1510  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.72 
 
 		 253 aa  75.9  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.525568  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0363  ABC-2 type transporter  24.37 
 
 		 289 aa  71.6  0.00000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1126  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  25 
 
 		 254 aa  71.2  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.339371  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  27.02 
 
 		 360 aa  70.1  0.00000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  24.69 
 
 		 249 aa  68.2  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  27.02 
 
 		 360 aa  67.8  0.0000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3574  ABC transporter, permease protein  24.5 
 
 		 254 aa  67  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.426841  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0388  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.77 
 
 		 249 aa  67  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.169706  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1078  ABC-2 type transporter  25.5 
 
 		 260 aa  66.2  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  26.21 
 
 		 339 aa  64.7  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0037  ABC-2 type transporter  27.27 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  22.18 
 
 		 249 aa  63.5  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3995  ABC-2 type transporter  26.63 
 
 		 256 aa  63.5  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2864  ABC-2 type transporter  26.9 
 
 		 290 aa  63.2  0.000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19160  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  29.77 
 
 		 319 aa  62.8  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.338631 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1142  ABC transporter permease protein  24.87 
 
 		 257 aa  62.8  0.000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0101435  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1012  ABC transporter, permease protein  24.87 
 
 		 257 aa  62.8  0.000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000447992  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4150  hypothetical protein  23.08 
 
 		 261 aa  62.8  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000233601  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27780  putative ABC transporter, permease protein  26.04 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.235012 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2323  ABC transporter, permease  31.56 
 
 		 339 aa  61.6  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00174786  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2599  putative ABC transporter, permease protein  31.97 
 
 		 339 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2346  ABC transporter  25.52 
 
 		 259 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0982615  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2544  ABC transporter, permease protein, putative  32.69 
 
 		 339 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0951215  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5840  ABC-2 type transporter  25.37 
 
 		 367 aa  59.7  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.564028 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1721  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  25.22 
 
 		 380 aa  59.7  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.759741  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2365  ABC transporter permease  31.15 
 
 		 339 aa  59.3  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1206  ABC-2 type transporter  28.43 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2542  ABC transporter permease  31.15 
 
 		 339 aa  59.3  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3328  ABC-2 type transporter  27.68 
 
 		 281 aa  59.3  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.45338  normal  0.334159 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2816  putative ABC transporter, permease protein  32.08 
 
 		 339 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000326896 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0906  ABC-2 type transporter  24.07 
 
 		 253 aa  58.9  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000570099 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1380  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.93 
 
 		 256 aa  58.9  0.00000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000932687  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1426  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.93 
 
 		 256 aa  58.9  0.00000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0562869  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0639  ABC-2 type transporter  28.21 
 
 		 253 aa  58.9  0.00000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0379  ABC-2 type transporter  27.81 
 
 		 259 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.8814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07250  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  28.66 
 
 		 265 aa  58.5  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.307058 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0411  ABC-2 type transporter  27.81 
 
 		 259 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.164581 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0447  ABC-2 type transporter  27.22 
 
 		 259 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2561  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  25.13 
 
 		 249 aa  58.2  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.760407 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1491  ABC transporter  29.17 
 
 		 277 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.898445  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0121  ABC transporter, permease protein  26.37 
 
 		 256 aa  58.2  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2769  ABC-2 type transporter  31.3 
 
 		 413 aa  58.2  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.160651  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2556  putative ABC transporter, permease protein  32.21 
 
 		 339 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0674400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1459  ABC-2 type transporter  26.02 
 
 		 249 aa  58.2  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2477  ABC-2 type transporter  28.78 
 
 		 286 aa  58.2  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299444 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1896  ABC transporter  23.68 
 
 		 259 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.312969  hitchhiker  0.0000781572 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0426  ABC-2 type transporter  24.81 
 
 		 256 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1471  ABC-2 type transporter  24.21 
 
 		 259 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1511  ABC transporter  28.57 
 
 		 277 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0121444  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3121  ABC-2 type transporter  25.63 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1453  ABC-2 type transporter  22.62 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0427  ABC transporter, inner membrane subunit  23.68 
 
 		 257 aa  57  0.0000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1438  ABC-2 type transporter  32.09 
 
 		 273 aa  57  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2458  ABC transporter  23.94 
 
 		 285 aa  57  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504776  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  30.49 
 
 		 376 aa  57  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1826  ABC-2 type transporter  29.88 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.805602  normal  0.102256 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1714  ABC-2 type transporter  26.4 
 
 		 253 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.42149  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3854  ABC transporter, permease protein  23.5 
 
 		 262 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.605289  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1631  hypothetical protein  23.12 
 
 		 262 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000356157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1016  ABC transporter permease  25.5 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.875005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2276  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.51 
 
 		 253 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0123592  normal  0.410533 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0734  ABC-2 type transporter  27.05 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00105629  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1098  ABC-2 type transporter  26.56 
 
 		 257 aa  56.6  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1192  ABC-2 type transporter  28.93 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2356  ABC-2 type transporter  27.89 
 
 		 286 aa  56.2  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.328671  normal  0.119199 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_718  ABC transporter, permease protein  27.42 
 
 		 260 aa  56.2  0.0000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000115983  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0478  ABC-2 type transporter  27.22 
 
 		 253 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.704988  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4733  ABC efflux pump, inner membrane subunit, NodJ  28.57 
 
 		 277 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5132  ABC-2 type transporter  27.32 
 
 		 358 aa  55.8  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.033585  normal  0.150856 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0057  ABC-2 type transporter  23.56 
 
 		 387 aa  55.8  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0461  hypothetical protein  23.16 
 
 		 257 aa  55.8  0.0000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0612935  normal  0.787561 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  24.81 
 
 		 371 aa  55.8  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  28.86 
 
 		 370 aa  55.5  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3348  ABC transporter, permease protein  25.5 
 
 		 256 aa  55.5  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0192428  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3476  ABC-2 type transporter  25.5 
 
 		 256 aa  55.5  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00127  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  26.37 
 
 		 256 aa  55.5  0.0000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3474  ABC-2 type transporter  26.37 
 
 		 256 aa  55.5  0.0000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00126  hypothetical protein  26.37 
 
 		 256 aa  55.5  0.0000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0130  ABC transporter, permease protein  26.37 
 
 		 256 aa  55.5  0.0000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0138  ABC transporter, permease protein  26.37 
 
 		 256 aa  55.5  0.0000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0881  ABC-2 type transporter  26.87 
 
 		 276 aa  55.5  0.0000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3531  ABC-2 type transporter  26.37 
 
 		 256 aa  55.5  0.0000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0136  ABC transporter, permease protein  26.37 
 
 		 256 aa  55.5  0.0000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0132  ABC transporter, permease protein  26.37 
 
 		 256 aa  55.5  0.0000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>