282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0219 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_0219  periplasmic binding protein  100 
 
 		 370 aa  758    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1869  iron(III) dicitrate-binding protein  51.14 
 
 		 401 aa  355  1e-96  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.444655  normal  0.203849 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1868  iron(III) dicitrate-binding protein  49.43 
 
 		 401 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.311818 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0248  periplasmic binding protein  47.24 
 
 		 375 aa  337  9.999999999999999e-92  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0774691  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1870  iron(III) dicitrate-binding protein  48.56 
 
 		 403 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.874813  normal  0.198975 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2328  periplasmic binding protein  49.28 
 
 		 384 aa  334  2e-90  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2329  periplasmic binding protein  50.14 
 
 		 384 aa  330  3e-89  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2147  periplasmic binding protein  48.41 
 
 		 387 aa  329  5.0000000000000004e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.985671  normal  0.111935 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1047  Fe3+-hydroxamate binding protein  47.08 
 
 		 370 aa  318  7e-86  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.271921  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1622  iron transport periplasmic binding protein  44.57 
 
 		 370 aa  318  9e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000308392  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1653  periplasmic binding protein  44.3 
 
 		 386 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0998  iron ABC transporter, solute-binding protein  45.76 
 
 		 373 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1093  V-type ATPase, 116 kDa subunit  40.92 
 
 		 376 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0427  periplasmic binding protein  44.12 
 
 		 373 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0496  periplasmic binding protein  43.48 
 
 		 372 aa  271  9e-72  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0410  periplasmic binding protein  43.02 
 
 		 373 aa  271  2e-71  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.579049  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0411  periplasmic binding protein  43.44 
 
 		 374 aa  269  7e-71  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1493  periplasmic binding protein  41.4 
 
 		 386 aa  268  1e-70  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.277986  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1195  periplasmic binding protein  42.36 
 
 		 374 aa  263  3e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0327  hypothetical protein  41.5 
 
 		 381 aa  260  2e-68  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0425  periplasmic binding protein  43.02 
 
 		 365 aa  261  2e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.264248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0424  periplasmic binding protein  42.73 
 
 		 373 aa  258  1e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.212243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1494  periplasmic binding protein  40.94 
 
 		 374 aa  251  2e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00826016  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3056  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  39.22 
 
 		 369 aa  249  7e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1466  periplasmic binding protein  39.77 
 
 		 369 aa  246  4.9999999999999997e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0759  periplasmic binding protein  39.28 
 
 		 358 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00294843  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0735  periplasmic binding protein  40.17 
 
 		 358 aa  241  1e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243949  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1092  hypothetical protein  36.39 
 
 		 378 aa  239  8e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0495  periplasmic binding protein  40 
 
 		 372 aa  233  3e-60  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0117562  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1132  periplasmic binding protein  38.6 
 
 		 378 aa  232  1e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0148173  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1091  hypothetical protein  38.94 
 
 		 337 aa  228  9e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0426  periplasmic binding protein  36.44 
 
 		 375 aa  225  8e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0409  periplasmic binding protein  36.04 
 
 		 375 aa  223  6e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.14115  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0273  periplasmic binding protein  37.54 
 
 		 381 aa  222  7e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000312893  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0343  periplasmic binding protein  40.06 
 
 		 373 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1492  periplasmic binding protein  37.2 
 
 		 362 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104614  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0428  periplasmic binding protein  35.23 
 
 		 375 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0494  periplasmic binding protein  38.98 
 
 		 390 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0203786  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1823  periplasmic binding protein  37 
 
 		 366 aa  205  1e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.717749  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1283  periplasmic binding protein  33.33 
 
 		 409 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.907  normal  0.591849 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0388  periplasmic binding protein  32.75 
 
 		 396 aa  194  2e-48  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0978  periplasmic binding protein  32.74 
 
 		 689 aa  189  7e-47  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.194046 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0216  periplasmic binding protein  33.43 
 
 		 393 aa  188  2e-46  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.941778  normal  0.148136 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0059  periplasmic binding protein  33.63 
 
 		 688 aa  187  3e-46  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.932595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0251  periplasmic binding protein  34.3 
 
 		 369 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0497  periplasmic binding protein  29.6 
 
 		 377 aa  182  9.000000000000001e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.292133  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1424  periplasmic binding protein  33.23 
 
 		 374 aa  168  2e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.813522  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1174  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  33.96 
 
 		 367 aa  160  5e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00124091  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0991  periplasmic binding protein  30.3 
 
 		 359 aa  143  6e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.960819  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0816  periplasmic binding protein  30 
 
 		 344 aa  136  6.0000000000000005e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3324  periplasmic binding protein  29.82 
 
 		 350 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3315  periplasmic binding protein  29.53 
 
 		 350 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000205912  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3389  periplasmic binding protein  29.24 
 
 		 350 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.47835 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3395  periplasmic binding protein  28.65 
 
 		 350 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.182926  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2847  periplasmic binding protein  26.85 
 
 		 354 aa  119  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1424  periplasmic binding protein  26.78 
 
 		 354 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3396  periplasmic binding protein  28.2 
 
 		 350 aa  117  3.9999999999999997e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1422  periplasmic binding protein  27.3 
 
 		 333 aa  115  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.158314 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1481  periplasmic binding protein  26.43 
 
 		 354 aa  103  4e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0890  ABC-transporter periplasmic-binding component  23.88 
 
 		 344 aa  101  2e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00338938  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1168  periplasmic binding protein  27.11 
 
 		 353 aa  100  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0428  periplasmic binding protein  26.46 
 
 		 375 aa  99.4  1e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0029  periplasmic binding protein  25.36 
 
 		 361 aa  98.6  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1093  Fe3+-hydroxamate binding protein  25 
 
 		 426 aa  98.2  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000629133  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0024  periplasmic binding protein  26.63 
 
 		 360 aa  95.9  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5706  periplasmic binding protein  25.14 
 
 		 351 aa  95.5  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1372  periplasmic binding protein  23.9 
 
 		 349 aa  94.7  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  26.76 
 
 		 478 aa  95.1  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1042  periplasmic binding protein  27.7 
 
 		 354 aa  94.7  2e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1185  periplasmic binding protein  27.62 
 
 		 354 aa  94.4  3e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.306422  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2669  putative ABC transporter, periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  25.55 
 
 		 389 aa  91.7  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2617  periplasmic binding protein  26.83 
 
 		 380 aa  92  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1538  putative ABC transporter periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  25.55 
 
 		 381 aa  91.7  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.204367 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2751  periplasmic binding protein  25.55 
 
 		 389 aa  91.7  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.369256  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1995  periplasmic binding protein  25.6 
 
 		 360 aa  90.1  6e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2567  periplasmic binding protein  25.66 
 
 		 365 aa  87.4  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0204616  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0500  ABC Fe3+-siderophore transporter, substrate binding subunit  27.39 
 
 		 362 aa  86.7  6e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0513  ABC transporter, solute-binding protein  25.51 
 
 		 365 aa  85.9  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1419  periplasmic binding protein  26.44 
 
 		 375 aa  84.7  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.364808  normal  0.918075 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4137  ferrichrome/ferrioxamine B periplasmic transporter  28.1 
 
 		 365 aa  85.1  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0816  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.93 
 
 		 366 aa  84  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0816  periplasmic binding protein  23.93 
 
 		 366 aa  84  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0919646  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0154  hypothetical protein  23.93 
 
 		 366 aa  84  0.000000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000656293 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  25.59 
 
 		 315 aa  83.2  0.000000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2696  periplasmic binding protein  26.24 
 
 		 377 aa  83.2  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.773462  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  26.01 
 
 		 483 aa  83.2  0.000000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1675  hypothetical protein  27.47 
 
 		 368 aa  83.2  0.000000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2260  hypothetical protein  25.55 
 
 		 378 aa  82.8  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.032453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  25.25 
 
 		 315 aa  82.8  0.000000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1747  periplasmic binding protein  26.55 
 
 		 334 aa  82.8  0.000000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2735  putative iron complex transport system substrate-binding protein  24.78 
 
 		 427 aa  82  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0180927  decreased coverage  0.0000609348 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1285  periplasmic binding protein  25.15 
 
 		 346 aa  82  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1999  periplasmic binding protein  22.85 
 
 		 348 aa  82.4  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.205186 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1687  periplasmic binding protein  26.59 
 
 		 378 aa  82.8  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.372146  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1690  periplasmic binding protein  24.72 
 
 		 366 aa  82.8  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00951352  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1221  ABC transporter substrate binding protein (iron)  26.44 
 
 		 406 aa  82.8  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0033  periplasmic binding protein  25.58 
 
 		 351 aa  81.6  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1286  ABC transporter, solute-binding protein  25.08 
 
 		 370 aa  80.1  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1015  periplasmic binding protein  22.45 
 
 		 371 aa  79  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.543354 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4771  periplasmic binding protein  22.59 
 
 		 370 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>