More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0202 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_0202  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
313 aa  629  1e-179  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.650812  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0211  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  67.96 
 
 
311 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000854239  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1978  oligopeptide ABC transporter, permease protein  56.23 
 
 
314 aa  372  1e-102  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0386  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.69 
 
 
312 aa  269  5e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2404  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.94 
 
 
308 aa  259  5.0000000000000005e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311261  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0369  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.79 
 
 
316 aa  257  2e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0350  nickel ABC transporter, permease subunit NikB  41.61 
 
 
310 aa  249  5e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2031  ABC transporter, permease protein  42.72 
 
 
313 aa  247  2e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.381274  normal  0.768388 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0511  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.16 
 
 
314 aa  245  8e-64  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.69 
 
 
306 aa  244  9.999999999999999e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0719  hypothetical protein  40.13 
 
 
316 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.870853 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0449  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.1 
 
 
316 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.143195 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0644  oligopeptide ABC transporter, permease protein  39.1 
 
 
314 aa  232  6e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.87 
 
 
313 aa  229  6e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00533013  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0959  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.34 
 
 
311 aa  228  1e-58  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2789  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.74 
 
 
306 aa  227  2e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6075  nickel transporter permease NikB  38.22 
 
 
319 aa  227  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4049  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.1 
 
 
313 aa  226  5.0000000000000005e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1223  Nickel-transporting ATPase  38.28 
 
 
339 aa  225  7e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0308435 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3675  oligopeptide ABC transporter, permease  37.5 
 
 
316 aa  224  1e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0490538 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1031  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.65 
 
 
312 aa  223  3e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0169288  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2407  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.94 
 
 
306 aa  223  3e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.333133  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7614  nickel transporter permease NikB  38.06 
 
 
314 aa  222  4.9999999999999996e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0982  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  37.22 
 
 
306 aa  222  7e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.91 
 
 
308 aa  222  7e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1184  dipeptide ABC transporter, permease protein  35.01 
 
 
333 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0134333  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.79 
 
 
334 aa  220  1.9999999999999999e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0859  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.09 
 
 
333 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000322853  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1325  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.66 
 
 
311 aa  220  1.9999999999999999e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.642024 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3104  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.89 
 
 
306 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4104  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.49 
 
 
315 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1136  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.74 
 
 
309 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195869  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2408  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.1 
 
 
316 aa  220  1.9999999999999999e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00798  predicted peptide transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  36.89 
 
 
306 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.472093  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0902  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  36.89 
 
 
306 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2811  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.89 
 
 
306 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.473558  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2813  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.89 
 
 
306 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0889  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  36.89 
 
 
306 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.952014  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00815  hypothetical protein  36.89 
 
 
306 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.558182  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0856  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  36.89 
 
 
306 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.61 
 
 
334 aa  219  6e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.57 
 
 
306 aa  219  6e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.740963 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2276  nickel transporter permease NikB  35.99 
 
 
314 aa  218  7e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.293593  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0918  inner membrane ABC transporter permease protein YddR  35.92 
 
 
306 aa  219  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.145156  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1001  glutathione ABC transporter permease  35.92 
 
 
306 aa  218  7.999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0891  glutathione ABC transporter, permease protein  35.92 
 
 
306 aa  218  7.999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.976092  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1409  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.85 
 
 
313 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0709141  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4233  oligopeptide transport, system permease  37.22 
 
 
306 aa  218  1e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4245  oligopeptide ABC transporter, permease  37.22 
 
 
306 aa  218  1e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0627  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.6 
 
 
306 aa  218  1e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.579769  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3004  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.54 
 
 
306 aa  218  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0951  glutathione ABC transporter permease  35.6 
 
 
306 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.258662  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0980  glutathione ABC transporter permease  35.6 
 
 
306 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0803  nickel transporter permease NikB  36.42 
 
 
314 aa  217  2e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.226349  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.2 
 
 
336 aa  217  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0980  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.59 
 
 
313 aa  217  2e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0910692  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4610  oligopeptide ABC transporter, permease protein  37.22 
 
 
306 aa  217  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0581  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 
318 aa  217  2e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.448412  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0753  nickel transporter permease NikB  36.42 
 
 
314 aa  217  2.9999999999999998e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0538  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.46 
 
 
311 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.396259 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0021  nickel ABC transporter, permease subunit NikB  34.94 
 
 
311 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00143513  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.13 
 
 
314 aa  216  2.9999999999999998e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2517  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  36.57 
 
 
306 aa  216  4e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.503163  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0138  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.57 
 
 
306 aa  216  4e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.535733 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0089  dipeptide transporter permease DppB  37.35 
 
 
339 aa  215  5.9999999999999996e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.297234  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0183  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  38.05 
 
 
336 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4074  dipeptide transporter permease DppB  37.35 
 
 
339 aa  215  5.9999999999999996e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7327  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  35.92 
 
 
306 aa  215  7e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4392  oligopeptide ABC transporter permease  36.89 
 
 
306 aa  215  8e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0139  dipeptide transporter permease DppB  36.47 
 
 
351 aa  215  8e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4732  oligopeptide ABC transporter permease protein  36.89 
 
 
306 aa  215  8e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0547  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.03 
 
 
306 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.472252  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2209  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.12 
 
 
313 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.459958  normal  0.0393248 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0622  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.03 
 
 
306 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000653909  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.71 
 
 
332 aa  214  9.999999999999999e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5358  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  37.62 
 
 
315 aa  214  9.999999999999999e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2797  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.27 
 
 
319 aa  214  1.9999999999999998e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0754  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.38 
 
 
313 aa  214  1.9999999999999998e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0546452  normal  0.293815 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2849  ABC transporter permease protein  37.11 
 
 
313 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.585703  normal  0.643564 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4215  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.7 
 
 
315 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0270  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.24 
 
 
321 aa  213  2.9999999999999995e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.350596  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2685  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.05 
 
 
315 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000049983  normal  0.670386 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3753  Alkaline phosphatase  37.76 
 
 
336 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.634321 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0942  nickel-transporting ATPase  38.71 
 
 
305 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.541988  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1197  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.22 
 
 
313 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03326  nickel transporter subunit  36.62 
 
 
314 aa  212  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0238  nickel ABC transporter, permease subunit NikB  36.62 
 
 
314 aa  212  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3959  nickel transporter permease NikB  36.62 
 
 
314 aa  212  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3841  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.59 
 
 
316 aa  213  4.9999999999999996e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00994535  normal  0.14386 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2812  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.5 
 
 
336 aa  213  4.9999999999999996e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.532586  normal  0.117752 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2973  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.92 
 
 
306 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.628351  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3676  nickel transporter permease NikB  36.62 
 
 
314 aa  212  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0239  nickel transporter permease NikB  36.62 
 
 
314 aa  212  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3844  nickel transporter permease NikB  36.62 
 
 
314 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1251  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.69 
 
 
313 aa  213  4.9999999999999996e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0714175 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03279  hypothetical protein  36.62 
 
 
314 aa  212  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2913  nickel-transporting ATPase  37.06 
 
 
337 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4817  nickel transporter permease NikB  36.62 
 
 
314 aa  212  7e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3728  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.59 
 
 
319 aa  212  7e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1381  transmembrane ABC transporter protein  35.28 
 
 
307 aa  212  7.999999999999999e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.796345  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>