More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0186 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_0186  transport system permease protein  100 
 
 		 362 aa  721    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129161  normal  0.828954 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0443  transport system permease protein  56.36 
 
 		 355 aa  376  1e-103  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2099  transport system permease protein  50.15 
 
 		 350 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1318  transport system permease protein  45.13 
 
 		 360 aa  301  1e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.398807  normal  0.0129823 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1094  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  41.4 
 
 		 373 aa  300  4e-80  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0044816  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2398  hypothetical protein  44.97 
 
 		 361 aa  289  4e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.384157 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1638  transport system permease protein  42.74 
 
 		 383 aa  276  4e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.250999  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  41.64 
 
 		 367 aa  267  2e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0431  transport system permease protein  37.36 
 
 		 374 aa  264  1e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0408  transport system permease protein  38.87 
 
 		 348 aa  264  2e-69  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.586002  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0429  transport system permease protein  39.44 
 
 		 348 aa  263  3e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0498  transport system permease protein  38.76 
 
 		 349 aa  263  4e-69  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0506043  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1194  transport system permease protein  41.83 
 
 		 357 aa  263  4e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1491  transport system permease protein  39.15 
 
 		 348 aa  262  6e-69  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.105364  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1217  transport system permease protein  42.34 
 
 		 362 aa  262  8.999999999999999e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00189959  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0466  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  41.79 
 
 		 347 aa  259  4e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1465  transport system permease protein  39.66 
 
 		 357 aa  258  1e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0250  transport system permease protein  40.99 
 
 		 340 aa  256  3e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1133  transport system permease protein  39.78 
 
 		 354 aa  256  3e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00204897  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1186  transport system permease protein  42.7 
 
 		 369 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2330  transport system permease protein  40.77 
 
 		 370 aa  253  3e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.970298  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1219  ABC transporter membrane spanning protein (iron)  42 
 
 		 360 aa  251  1e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.11373  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1089  hypothetical protein  45.15 
 
 		 355 aa  248  1e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0247  transport system permease protein  44.37 
 
 		 359 aa  248  2e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0151644  normal  0.610007 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0734  transport system permease protein  39.94 
 
 		 344 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000599785  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1871  iron(III) dicitrate transport system permease protein  44.71 
 
 		 356 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71238  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0758  transport system permease protein  40.8 
 
 		 344 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0240676  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2250  transport system permease protein  39.15 
 
 		 356 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.235988 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1041  transport system permease protein  45.96 
 
 		 301 aa  238  1e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2028  transport system permease protein  38.59 
 
 		 356 aa  237  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1695  transport system permease protein  42.14 
 
 		 354 aa  237  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.347986  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1353  transport system permease protein  45 
 
 		 363 aa  236  3e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2425  transport system permease protein  41.84 
 
 		 356 aa  236  4e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1173  iron ABC transporter, permease protein  36.77 
 
 		 356 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1048  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  44.33 
 
 		 336 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.522195  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2734  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  43.23 
 
 		 347 aa  233  3e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000167037  hitchhiker  0.000165993 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3530  transport system permease protein  40.93 
 
 		 365 aa  233  4.0000000000000004e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4419  transport system permease protein  40.35 
 
 		 355 aa  233  6e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.347706 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1822  transport system permease protein  40.22 
 
 		 350 aa  231  2e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1153  hypothetical protein  36.24 
 
 		 375 aa  228  1e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0290  transport system permease protein  38.19 
 
 		 361 aa  228  2e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.602088  normal  0.107419 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4241  transport system permease protein  40.12 
 
 		 381 aa  226  3e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.2131 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  36.66 
 
 		 337 aa  224  2e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1473  transport system permease protein  39.4 
 
 		 359 aa  224  2e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.766975  normal  0.204191 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0575  transport system permease protein  42.11 
 
 		 357 aa  224  3e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0274  transport system permease protein  35.26 
 
 		 358 aa  222  8e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00246015  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1623  iron(III) dicitrate transport system permease protein  40.28 
 
 		 356 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0877318  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0220  transport system permease protein  40.45 
 
 		 356 aa  218  2e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3090  transport system permease protein  40.82 
 
 		 360 aa  217  2e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0402  transport system permease protein  39.26 
 
 		 352 aa  218  2e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2166  transport system permease protein  42.07 
 
 		 334 aa  216  4e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.514643  normal  0.141154 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0621  transport system permease protein  39.61 
 
 		 363 aa  216  5.9999999999999996e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.050627  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1738  transport system permease protein  37.72 
 
 		 330 aa  215  8e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.922017  normal  0.205881 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3058  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  38.64 
 
 		 346 aa  215  9.999999999999999e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7623  ABC transporter membrane spanning protein (iron)  36.18 
 
 		 354 aa  215  9.999999999999999e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  38.89 
 
 		 330 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3892  transport system permease protein  40.07 
 
 		 334 aa  212  7e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3804  hemin ABC transporter, permease protein HmuU  40.07 
 
 		 334 aa  212  7e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0647  hemin transport system permease HmuU  40.07 
 
 		 334 aa  212  7e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.466649 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_589  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, permease component  41.88 
 
 		 363 aa  211  1e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0262833  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1652  transport system permease protein  39.06 
 
 		 357 aa  211  1e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2163  transport system permease protein  41.7 
 
 		 336 aa  211  2e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  41.32 
 
 		 330 aa  210  3e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0026  transport system permease protein  38.21 
 
 		 331 aa  210  3e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1703  heme/hemin ABC transporter, permease protein  38.6 
 
 		 352 aa  209  8e-53  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0076  transport system permease protein  37.16 
 
 		 452 aa  208  1e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  39.72 
 
 		 354 aa  208  1e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0557  transport system permease protein  43.64 
 
 		 355 aa  207  2e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1709  transport system permease protein  38.41 
 
 		 319 aa  207  2e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0562  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system protein  40.25 
 
 		 348 aa  207  3e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3306  transport system permease protein  40.59 
 
 		 354 aa  207  3e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.205104  hitchhiker  0.000395648 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4830  transport system permease protein  41.07 
 
 		 341 aa  206  5e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0561  transport system permease protein  41.44 
 
 		 346 aa  206  6e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1420  transport system permease protein  37.64 
 
 		 361 aa  205  9e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0651  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  41.56 
 
 		 334 aa  205  1e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0685  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  41.56 
 
 		 334 aa  205  1e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0125  transport system permease protein  40.14 
 
 		 356 aa  205  1e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0132273  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  40.97 
 
 		 370 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1606  transport system permease protein  37.24 
 
 		 368 aa  204  2e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000330558 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1316  transport system permease protein  42.76 
 
 		 338 aa  204  2e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  40 
 
 		 358 aa  203  3e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0865  ABC transporter permease  36.93 
 
 		 359 aa  203  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0897  ABC transporter permease  36.93 
 
 		 359 aa  204  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.660141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0920  ABC transporter permease  36.65 
 
 		 359 aa  203  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.421925 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0806  ABC transporter permease  36.65 
 
 		 359 aa  203  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.129539  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2385  FecCD-family membrane transport protein  36.19 
 
 		 367 aa  202  5e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.567541  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0834  ABC transporter permease  36.93 
 
 		 359 aa  202  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1116  ABC transporter permease  35.86 
 
 		 343 aa  202  8e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3381  transport system permease protein  35.49 
 
 		 351 aa  202  9e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2100  transport system permease protein  37.18 
 
 		 334 aa  202  9e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4085  transport system permease protein  37.81 
 
 		 345 aa  200  3e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.569301 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0583  transport system permease protein  38.64 
 
 		 331 aa  200  3e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.777741  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1942  transport system permease protein  37.24 
 
 		 347 aa  200  3.9999999999999996e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543931  normal  0.0358565 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4501  iron compound ABC transporter, permease protein  36.39 
 
 		 342 aa  199  5e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2568  transport system permease protein  41.55 
 
 		 344 aa  199  5e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0538415  normal  0.392221 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3610  transport system permease protein  39.93 
 
 		 360 aa  199  7e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.137689 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0744  transport system permease protein  39.08 
 
 		 345 aa  199  7e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.290337 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3756  transport system permease protein  40.39 
 
 		 343 aa  199  7.999999999999999e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3536  transport system permease protein  40.13 
 
 		 368 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764032  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0282  transport system permease protein  40.07 
 
 		 371 aa  198  1.0000000000000001e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.669954  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>