More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0129 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_0129  GrpE protein  100 
 
 		 183 aa  374  1e-103  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.628751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1062  GrpE protein  54.17 
 
 		 169 aa  155  4e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0506342  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2350  GrpE protein  46.43 
 
 		 185 aa  136  2e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.190024 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1206  GrpE protein  48.08 
 
 		 180 aa  134  6.0000000000000005e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.390676  hitchhiker  0.00686163 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0944  hypothetical protein  43.54 
 
 		 201 aa  132  3e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.104305  normal  0.177983 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0012  heat shock protein GrpE  35.6 
 
 		 208 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.976347  hitchhiker  0.000405819 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0008  heat shock protein GrpE  37.91 
 
 		 210 aa  112  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000108771 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0008  heat shock protein GrpE  37.91 
 
 		 210 aa  111  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0916725 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0399  heat shock protein GrpE  34.04 
 
 		 204 aa  107  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0171  heat shock protein GrpE  36.71 
 
 		 230 aa  106  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4019  heat shock protein GrpE  34.83 
 
 		 222 aa  106  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.925805  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0165  heat shock protein GrpE  36.71 
 
 		 230 aa  105  4e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.507974  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0180  heat shock protein GrpE  36.18 
 
 		 228 aa  104  7e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0599175  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1334  heat shock protein GrpE  38.89 
 
 		 222 aa  103  1e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0785  GrpE protein  42.86 
 
 		 207 aa  102  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3544  ribulose-phosphate 3-epimerase  37.25 
 
 		 204 aa  102  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.741634 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0327  heat shock protein GrpE  36.81 
 
 		 205 aa  101  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3434  heat shock protein GrpE  39.07 
 
 		 209 aa  101  7e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.398988  normal  0.0620931 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0971  GrpE protein  36.75 
 
 		 187 aa  100  8e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0383  Ribulose-phosphate 3-epimerase  33.51 
 
 		 202 aa  99.8  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0929159  normal  0.322075 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00201  heat shock protein GrpE  38.51 
 
 		 237 aa  99.4  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0336  ribulose-phosphate 3-epimerase  35.81 
 
 		 202 aa  98.6  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1146  GrpE protein  37.33 
 
 		 226 aa  98.6  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  34.97 
 
 		 213 aa  98.2  5e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  35.23 
 
 		 190 aa  98.6  5e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  36.73 
 
 		 210 aa  98.2  6e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  34.27 
 
 		 208 aa  98.2  6e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0648  GrpE protein  37.24 
 
 		 188 aa  97.8  7e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00161  heat shock protein GrpE  39.07 
 
 		 247 aa  97.8  7e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0174287 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3004  GrpE protein  35.67 
 
 		 210 aa  97.8  7e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0799  GrpE protein  41.96 
 
 		 203 aa  97.4  9e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3461  GrpE protein  33.88 
 
 		 204 aa  97.1  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.704807  normal  0.0101104 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2800  GrpE protein  36.42 
 
 		 187 aa  97.1  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00151  heat shock protein GrpE  37.84 
 
 		 239 aa  96.7  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1973  GrpE protein  34.25 
 
 		 223 aa  96.7  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.268651  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0188  heat shock protein GrpE  35.58 
 
 		 206 aa  96.7  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2533  ribulose-phosphate 3-epimerase  38 
 
 		 217 aa  96.3  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0415  GrpE protein  35.37 
 
 		 202 aa  96.3  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4974  GrpE protein  35.44 
 
 		 211 aa  95.9  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0161859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4181  GrpE protein  35.71 
 
 		 286 aa  95.9  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.321411 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4166  heat shock protein GrpE  32.75 
 
 		 188 aa  95.5  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177219  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1343  heat shock protein GrpE  34.39 
 
 		 259 aa  95.5  3e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0023  heat shock protein GrpE  36.42 
 
 		 225 aa  95.9  3e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00151  heat shock protein GrpE  34.39 
 
 		 259 aa  95.9  3e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.948871 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4214  heat shock protein GrpE  34.48 
 
 		 188 aa  95.5  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.121908  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4052  heat shock protein GrpE  34.48 
 
 		 188 aa  95.5  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4062  heat shock protein GrpE  34.48 
 
 		 188 aa  95.5  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4540  heat shock protein GrpE  34.48 
 
 		 188 aa  95.5  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0016  heat shock protein GrpE  36.49 
 
 		 239 aa  95.5  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00151  heat shock protein GrpE  35.81 
 
 		 239 aa  95.5  4e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  decreased coverage  0.00526535  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4337  heat shock protein GrpE  34.48 
 
 		 188 aa  95.5  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21014e-34 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0802  heat shock protein GrpE  34.48 
 
 		 188 aa  95.1  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000114529  hitchhiker  2.29846e-19 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4434  heat shock protein GrpE  34.48 
 
 		 188 aa  95.1  5e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0153  heat shock protein GrpE  36.36 
 
 		 203 aa  95.1  5e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3363  GrpE protein  32.69 
 
 		 245 aa  94.4  9e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00347236  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1253  GrpE protein  35.37 
 
 		 181 aa  93.6  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.329053 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0334  heat shock protein GrpE  34.36 
 
 		 207 aa  94  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0184084  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2184  ribulose-phosphate 3-epimerase  36.81 
 
 		 207 aa  94  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0403299  normal  0.673418 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3625  heat shock protein GrpE  33.7 
 
 		 189 aa  94  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.42288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1520  GrpE protein  32.73 
 
 		 206 aa  92.8  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0812159  normal  0.974035 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0019  heat shock protein GrpE  35.76 
 
 		 224 aa  92.8  2e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0869  GrpE protein  33.51 
 
 		 186 aa  92.8  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.555049  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0337  GrpE protein  36.31 
 
 		 201 aa  92.8  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.387309  normal  0.17968 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2635  heat shock protein GrpE  36.57 
 
 		 181 aa  92.8  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3330  heat shock protein GrpE  34.59 
 
 		 209 aa  92.4  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000166428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4391  GrpE protein  36.11 
 
 		 204 aa  92.8  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.322098  normal  0.302959 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2881  GrpE protein  35.92 
 
 		 181 aa  92  4e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.274349  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2656  GrpE protein  38.18 
 
 		 186 aa  92  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4448  heat shock protein GrpE  33.91 
 
 		 192 aa  91.7  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000207397  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2497  GrpE protein  36.67 
 
 		 192 aa  91.7  5e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127852  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2880  Fis family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 186 aa  91.3  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4694  GrpE protein  36.3 
 
 		 246 aa  91.3  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2126  GrpE protein  32.97 
 
 		 200 aa  91.3  7e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.743495  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0427  heat shock protein GrpE  33.74 
 
 		 206 aa  91.3  7e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1040  heat shock protein GrpE  35.48 
 
 		 184 aa  91.3  8e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1219  putative chaperone protein GrpE (heat shock protein)  38.18 
 
 		 189 aa  91.3  8e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1770  heat shock protein GrpE  37.86 
 
 		 184 aa  90.9  9e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_24940  chloroplast GrpE-like protein  38.24 
 
 		 274 aa  90.5  1e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.167019  normal  0.369132 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0195  heat shock protein GrpE  32.79 
 
 		 197 aa  90.1  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.721857  normal  0.870484 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0377  heat shock protein GrpE  32.87 
 
 		 248 aa  90.5  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3042  heat shock protein GrpE  37.41 
 
 		 207 aa  90.5  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.27806  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0393  heat shock protein GrpE  32.43 
 
 		 206 aa  90.5  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1485  heat shock protein GrpE  37.14 
 
 		 182 aa  89.4  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2240  GrpE protein  37.88 
 
 		 193 aa  89.7  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0231109  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42980  heat shock protein GrpE  36.69 
 
 		 187 aa  89.4  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3837  heat shock protein GrpE  35.07 
 
 		 181 aa  89  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4475  GrpE protein  36.24 
 
 		 224 aa  89  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.323495  normal  0.188028 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0627  co-chaperone protein GrpE  36.49 
 
 		 247 aa  89  4e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0327836  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1306  heat shock protein GrpE  35.07 
 
 		 178 aa  88.6  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2572  heat shock protein GrpE  36.03 
 
 		 201 aa  88.6  4e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000957049  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2570  heat shock protein GrpE  35 
 
 		 178 aa  89  4e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14947  mitochondrial GrpE-like protein  34.67 
 
 		 240 aa  88.6  5e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0088904  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1639  heat shock protein GrpE  32.5 
 
 		 208 aa  88.6  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.980219  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1673  heat shock protein GrpE  32.5 
 
 		 208 aa  88.6  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0666687  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1348  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  33.33 
 
 		 189 aa  88.6  5e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00499702  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0509  GrpE protein  31.71 
 
 		 210 aa  88.2  5e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.552704  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2924  GrpE protein  34.64 
 
 		 173 aa  88.2  6e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1274  heat shock protein GrpE  35.29 
 
 		 206 aa  88.2  6e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125429  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0667  heat shock protein GrpE  35.07 
 
 		 181 aa  88.2  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.151401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0644  heat shock protein GrpE  35.07 
 
 		 181 aa  88.2  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>