227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0075 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_0075  formate/nitrite transporter  100 
 
 
286 aa  556  1e-157  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00341405  normal  0.480537 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1811  formate/nitrite transporter  50.35 
 
 
290 aa  271  1e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1621  formate/nitrite transporter  45.95 
 
 
290 aa  249  3e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2136  formate/nitrite transporter  45.97 
 
 
295 aa  242  3.9999999999999997e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1503  hypothetical protein  39.3 
 
 
284 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.48908  normal  0.406493 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1504  hypothetical protein  42.54 
 
 
251 aa  181  9.000000000000001e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.870795  normal  0.369594 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1373  formate/nitrite transporter  35.29 
 
 
274 aa  169  5e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0581  formate/nitrite transporter  35.96 
 
 
274 aa  169  5e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0611  formate/nitrite transporter  34.36 
 
 
275 aa  169  6e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0292  formate/nitrite transporter  34.6 
 
 
274 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0248284  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0546  formate/nitrite transporter  34.6 
 
 
274 aa  150  2e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0683482  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1906  formate/nitrite transporter  36.06 
 
 
269 aa  149  4e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0937381  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0917  formate/nitrite transporter  33.81 
 
 
282 aa  144  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45982e-32 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0234  FNT family protein  33.57 
 
 
270 aa  143  3e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.316359  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2194  formate/nitrite transporter  31.85 
 
 
301 aa  138  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0306752  normal  0.415669 
 
 
-
 
NC_002950  PG0209  formate/nitrite transporter  35.04 
 
 
261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4660  formate/nitrite transporter  34.98 
 
 
271 aa  133  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0091  formate/nitrate transporter  30 
 
 
293 aa  129  4.0000000000000003e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2663  formate/nitrite transporter  30.47 
 
 
283 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000134322  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1736  formate/nitrite transporter  30.72 
 
 
284 aa  125  5e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0151  formate/nitrite transporter  33.11 
 
 
280 aa  125  1e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0999  formate/nitrite transporter  31.01 
 
 
278 aa  122  6e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0554  formate/nitrite transporter  30.6 
 
 
301 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3485  formate transporter  32.04 
 
 
271 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000339994  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1605  formate/nitrite transporter  32.99 
 
 
289 aa  119  7e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0135158  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1475  putative formate transporter  30.63 
 
 
271 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000668667  hitchhiker  0.0000156273 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3755  formate transporter, putative  31.69 
 
 
271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130548  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3826  putative formate transporter  30.63 
 
 
271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000257156  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3573  formate transporter  31.69 
 
 
271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000029484  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3472  formate transporter  31.69 
 
 
271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000183902  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3857  formate transporter  31.69 
 
 
271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000122376  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3739  putative formate transporter  31.69 
 
 
271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000466346 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1325  formate/nitrite transporter  30.18 
 
 
285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3777  putative formate transporter  31.34 
 
 
271 aa  117  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000331666  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3493  formate/nitrite transporter  30.99 
 
 
271 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000349448  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1844  formate/nitrite transporter  27.62 
 
 
279 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.274179 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1299  formate and nitrite transporters  29.19 
 
 
303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21721  formate and nitrite transporters  29.19 
 
 
303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  decreased coverage  0.00925864  normal  0.239969 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3185  formate/nitrite transporter  26.39 
 
 
280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0135134  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08647  formate/nitrate family transporter (Eurofung)  29.54 
 
 
310 aa  113  3e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1838  putative formate transporter FdhC  30.04 
 
 
292 aa  113  5e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.17934e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0842  formate/nitrite transporter  32.93 
 
 
263 aa  112  7.000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0311  formate/nitrite transporter  27.21 
 
 
310 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2402  formate/nitrite transporter  30.04 
 
 
269 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000214776  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0933  formate/nitrite transporter  32.83 
 
 
296 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.91346  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000193  formate efflux transporter  32.29 
 
 
483 aa  110  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000746052  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1703  formate transporter  31.99 
 
 
286 aa  108  9.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.57542  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000071  nitrite transporter from formate/nitrite family  29.08 
 
 
283 aa  108  9.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05923  methionine gamma-lyase  31.6 
 
 
483 aa  108  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25150  formate/nitrite transporter family protein  32.55 
 
 
287 aa  108  1e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.796989  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0716  formate/nitrite transporter  28.22 
 
 
270 aa  107  2e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.653028  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0331  formate/nitrite transporter  27.82 
 
 
270 aa  107  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1131  formate/nitrite transporter  27.93 
 
 
279 aa  107  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1243  formate/nitrite transporter  27.93 
 
 
279 aa  107  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29881  formate and nitrite transporters  28.96 
 
 
303 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1943  putativel formate transporter  27.62 
 
 
281 aa  107  3e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.466004  normal  0.753963 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5755  formate/nitrite transporter  29.41 
 
 
280 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.582427  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6120  formate/nitrite transporter  29.41 
 
 
280 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.119231 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2285  formate and nitrite transporters  27.7 
 
 
295 aa  105  7e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6602  formate/nitrite transporter  29.07 
 
 
280 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.609291 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0474  putative formate transporter 1  31.23 
 
 
483 aa  104  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188118  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3362  formate transporter  30.04 
 
 
259 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.495857  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3326  formate/nitrite transporter  30.04 
 
 
259 aa  104  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.669254  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3276  formate/nitrite transporter  30.04 
 
 
259 aa  104  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.55771  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3625  formate transporter  30.04 
 
 
259 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0703  formate/nitrite transporter  28.92 
 
 
270 aa  103  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.709097  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1998  formate transporter  31.1 
 
 
286 aa  103  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1956  putative formate transporter 1  31.4 
 
 
286 aa  103  4e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2242  formate/nitrite transporter  30.33 
 
 
285 aa  103  5e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.57128  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02558  Formate/nitrite transporter  28.37 
 
 
282 aa  102  6e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1641  putative formate transporter  30.88 
 
 
273 aa  102  7e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2657  formate and nitrite transporters  28.81 
 
 
275 aa  102  7e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.00842969  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3676  putative formate transporter  30.88 
 
 
273 aa  102  7e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3576  putative formate transporter  29.68 
 
 
259 aa  102  7e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2344  formate/nitrite transporter  29.89 
 
 
285 aa  102  8e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3240  formate/nitrite transporter  28.98 
 
 
274 aa  102  9e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.532711  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0884  response regulator receiver protein  30.68 
 
 
425 aa  101  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3583  formate transporter, putative  29.68 
 
 
273 aa  100  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3593  putative formate transporter  29.68 
 
 
273 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1862  formate/nitrite transporter  32.1 
 
 
289 aa  100  3e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2756  formate/nitrite transporter  28.03 
 
 
284 aa  100  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3614  formate/nitrite transporter  27.27 
 
 
279 aa  99.8  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.568549  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2879  formate/nitrite transporter  28.33 
 
 
289 aa  99.8  5e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.583143  normal  0.245539 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0819  formate/nitrite transporter  27.93 
 
 
270 aa  99.4  7e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.225898  normal  0.0203602 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2846  formate/nitrite transporter  27.27 
 
 
270 aa  99  8e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0182  formate/nitrite transporter  26.52 
 
 
282 aa  98.6  9e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1947  formate transporter  31.45 
 
 
285 aa  98.2  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00022093  normal  0.102506 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2676  formate transporter  31.45 
 
 
285 aa  98.2  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00730  formate/nitrite transporter family protein  29.07 
 
 
295 aa  98.2  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.802131  normal  0.255605 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2588  formate transporter  31.45 
 
 
285 aa  98.2  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.864414  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46427  predicted protein  31.05 
 
 
315 aa  98.2  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.215207  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1730  formate transporter  32.47 
 
 
286 aa  97.4  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.373125  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3067  formate/nitrite transporter  27.34 
 
 
296 aa  97.4  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.962754  normal  0.623416 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0796  formate/nitrite transporter  29.88 
 
 
270 aa  97.4  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1424  formate/nitrite transporter  30.33 
 
 
285 aa  97.1  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2826  formate/nitrate transporter  28.17 
 
 
269 aa  96.7  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.189736  hitchhiker  0.00104508 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3480  formate/nitrite transporter  27.97 
 
 
288 aa  96.7  4e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25116  FNT family transporter: formate/nitrite  31.62 
 
 
323 aa  96.7  4e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.413468  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00908  formate transporter  29.33 
 
 
285 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.839413  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2739  formate/nitrite transporter  29.33 
 
 
285 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.851182  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>