More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0055 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_0055  NusA family protein  100 
 
 		 142 aa  288  2e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0755132 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0303  NusA family protein  60.87 
 
 		 149 aa  174  5e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.212919  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0317  NusA family protein  60.87 
 
 		 149 aa  174  5e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0703108  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1929  NusA family protein  58.27 
 
 		 154 aa  164  2.9999999999999998e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.107527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2164  NusA family KH domain protein  57.14 
 
 		 148 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0209393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0373  aminotransferase, class I and II  48.92 
 
 		 157 aa  147  4e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0032  NusA family protein  46.38 
 
 		 143 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3689  transcription elongation factor NusA-like protein  41.3 
 
 		 141 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.167967 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1200  NusA family KH domain protein  40.15 
 
 		 143 aa  114  6e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0786  transcription elongation factor NusA-like protein  43.17 
 
 		 184 aa  108  3e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0611  transcription elongation factor NusA-like protein  41.43 
 
 		 173 aa  106  8.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1174  transcription elongation factor NusA-like protein  41.3 
 
 		 141 aa  106  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000000440347  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0212  transcription elongation factor NusA-like protein  40.71 
 
 		 173 aa  105  2e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1307  transcription elongation factor NusA-like protein  41.43 
 
 		 173 aa  105  2e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1967  transcription elongation factor NusA-like protein  40.58 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0000104424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0676  transcription elongation factor NusA-like protein  40.71 
 
 		 173 aa  103  8e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.618289  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2095  transcription elongation factor NusA-like protein  39.13 
 
 		 144 aa  100  5e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0353  NusA family protein  35.51 
 
 		 154 aa  100  6e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2325  transcription elongation factor NusA-like protein  39.86 
 
 		 144 aa  100  8e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000411828  decreased coverage  0.00000148869 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0321  transcription elongation factor NusA-like protein  36.43 
 
 		 148 aa  98.6  2e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.140806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0699  transcription elongation factor NusA-like protein  38.41 
 
 		 144 aa  99  2e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00857549  normal  0.0543141 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0037  transcription elongation factor NusA-like protein  40.15 
 
 		 143 aa  97.4  6e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000224532  normal  0.180707 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2073  NusA family protein  40 
 
 		 147 aa  92.8  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.115145  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0103  transcription elongation factor NusA-like protein  36.69 
 
 		 139 aa  92.8  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0511  transcription elongation factor NusA-like protein  37.41 
 
 		 141 aa  89  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0355  NusA family KH domain protein  35.42 
 
 		 146 aa  88.6  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0437  NusA family KH domain protein  36.36 
 
 		 147 aa  87.8  5e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0231371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1778  NusA family protein  40 
 
 		 146 aa  83.6  9e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0791  NusA family protein  36.59 
 
 		 147 aa  83.6  9e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.013566  normal  0.0952767 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1385  hypothetical protein  40.83 
 
 		 151 aa  82.4  0.000000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2154  NusA family KH domain protein  32.32 
 
 		 166 aa  79.7  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.392185  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0780  transcription elongation factor NusA-like protein  30.22 
 
 		 142 aa  75.5  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0698378  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0282  NusA family protein  31.54 
 
 		 149 aa  74.7  0.0000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.956097  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1087  NusA family KH domain protein  29.79 
 
 		 141 aa  73.2  0.000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.513028  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2022  transcription elongation factor NusA  35.71 
 
 		 441 aa  63.5  0.0000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.142374 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0776  transcription elongation factor NusA  41.03 
 
 		 329 aa  59.3  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387304  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1134  NusA antitermination factor  35.79 
 
 		 442 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000746814  normal  0.939177 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3749  NusA antitermination factor  35.79 
 
 		 442 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00409142  unclonable  0.0000152852 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1585  transcription elongation factor NusA  33.68 
 
 		 468 aa  58.2  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2089  transcription elongation factor NusA  34.65 
 
 		 413 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.69598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18931  transcription elongation factor NusA  35 
 
 		 497 aa  57.8  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1023  transcription elongation factor NusA  35 
 
 		 497 aa  57.8  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0594  transcription elongation factor NusA  35 
 
 		 485 aa  57.8  0.00000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.501988  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16141  transcription elongation factor NusA  34.74 
 
 		 471 aa  57.4  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1932  NusA antitermination factor  36.17 
 
 		 392 aa  57  0.00000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000167668  decreased coverage  0.000000000752271 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16831  transcription elongation factor NusA  33.68 
 
 		 467 aa  57  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.422838  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3683  NusA antitermination factor  33.68 
 
 		 442 aa  56.6  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00388019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16961  transcription elongation factor NusA  32.63 
 
 		 467 aa  56.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0339666  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3041  transcription elongation factor NusA  33.04 
 
 		 572 aa  55.8  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0597  NusA antitermination factor  31.15 
 
 		 425 aa  55.1  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1432  NusA antitermination factor  33 
 
 		 373 aa  55.1  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000109855  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1870  transcription elongation factor NusA  31.15 
 
 		 425 aa  54.3  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0338144  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3594  NusA antitermination factor  34.04 
 
 		 337 aa  54.7  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16721  transcription elongation factor NusA  32.63 
 
 		 467 aa  54.3  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0811  transcription elongation factor NusA  34.04 
 
 		 423 aa  53.9  0.0000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000010954  hitchhiker  0.00234388 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1475  transcription termination factor NusA  34.34 
 
 		 393 aa  53.5  0.0000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000477736  unclonable  0.00000325116 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04151  transcription elongation factor NusA  33.68 
 
 		 484 aa  53.5  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.659645 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2079  transcription elongation factor NusA  33.68 
 
 		 481 aa  53.1  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.376983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1441  NusA antitermination factor  38.46 
 
 		 339 aa  52.4  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5836  transcription elongation factor NusA  35.11 
 
 		 337 aa  52  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0996  NusA antitermination factor  30.61 
 
 		 369 aa  52  0.000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000936712  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09350  transcription termination factor NusA  29.47 
 
 		 401 aa  52  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000834112  normal  0.892609 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1018  NusA antitermination factor  34 
 
 		 354 aa  52  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1379  transcription elongation factor NusA  35.05 
 
 		 365 aa  51.6  0.000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0473  NusA antitermination factor  34.74 
 
 		 444 aa  52  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000679634  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3219  NusA antitermination factor  33 
 
 		 503 aa  52  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.517549  normal  0.104407 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2777  NusA antitermination factor  33.33 
 
 		 354 aa  51.6  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000726051  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1059  NusA antitermination factor  34.62 
 
 		 333 aa  51.6  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00843571  normal  0.0553593 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0073  transcription elongation factor NusA  35.8 
 
 		 494 aa  51.6  0.000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.837556  normal  0.355658 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0833  transcription elongation factor NusA  32.63 
 
 		 407 aa  51.2  0.000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.792423  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3332  NusA antitermination factor  37.18 
 
 		 351 aa  51.2  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.166447  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7749  NusA antitermination factor  32.98 
 
 		 324 aa  51.2  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3061  transcription elongation factor NusA  29.41 
 
 		 499 aa  50.8  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000291489  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1209  NusA antitermination factor  34.04 
 
 		 344 aa  50.8  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0489852  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1047  NusA antitermination factor  29.76 
 
 		 362 aa  50.8  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000154988  unclonable  0.0000000137146 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3978  transcription elongation factor NusA  32 
 
 		 426 aa  50.4  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1517  transcription elongation factor NusA  35.9 
 
 		 348 aa  50.8  0.000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.261597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1419  NusA antitermination factor  32.98 
 
 		 347 aa  50.4  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2115  transcription elongation factor NusA  34.62 
 
 		 331 aa  50.4  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.781064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1180  NusA antitermination factor  33 
 
 		 361 aa  50.4  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00193855  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0068  transcription elongation factor NusA  35.8 
 
 		 494 aa  50.4  0.000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.272639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1441  NusA antitermination factor  38.1 
 
 		 380 aa  50.4  0.000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0429547  normal  0.129125 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1648  transcription elongation factor NusA  30.3 
 
 		 346 aa  50.4  0.000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000247005  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1002  transcription elongation factor NusA  30.21 
 
 		 501 aa  50.4  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1665  NusA antitermination factor  32 
 
 		 365 aa  50.4  0.000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000721447  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0166  transcription elongation factor NusA  33.68 
 
 		 538 aa  50.1  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.590136  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2491  NusA antitermination factor  33.33 
 
 		 346 aa  50.1  0.000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0599  transcription elongation factor NusA  33.33 
 
 		 367 aa  50.1  0.000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.329401  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3439  transcription elongation factor NusA  34.41 
 
 		 552 aa  50.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.787039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1352  transcription elongation factor NusA  31.58 
 
 		 391 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4389  transcription elongation factor NusA  33.33 
 
 		 533 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3638  transcription elongation factor NusA  30 
 
 		 368 aa  50.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000480862  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1047  transcription elongation factor NusA  32.67 
 
 		 344 aa  49.7  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000699393  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4069  transcription elongation factor NusA  33.33 
 
 		 535 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1326  transcription elongation factor NusA  31.58 
 
 		 391 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1065  transcription elongation factor NusA  32.67 
 
 		 344 aa  50.1  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123432  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3192  transcription elongation factor NusA  32.98 
 
 		 327 aa  50.1  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0218268  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0876  transcription elongation factor NusA  33.33 
 
 		 491 aa  50.1  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0313079  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2063  transcription elongation factor NusA  34.04 
 
 		 347 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1694  NusA antitermination factor  27.84 
 
 		 497 aa  48.9  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>