More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0031 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_0031  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 272 aa  559  1e-158  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.246666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0032  extracellular solute-binding protein  51.3 
 
 		 276 aa  273  3e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.427857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1361  extracellular solute-binding protein  47.78 
 
 		 257 aa  260  1e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1664  extracellular solute-binding protein family 3  48.4 
 
 		 294 aa  249  3e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2054  extracellular solute-binding protein  46.31 
 
 		 258 aa  230  2e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.179486 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0210  hypothetical protein  45.16 
 
 		 263 aa  228  8e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3903  extracellular solute-binding protein  48.48 
 
 		 252 aa  221  7e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.754855  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2548  extracellular solute-binding protein  47.68 
 
 		 249 aa  208  6e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.163495  normal  0.139391 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0186  extracellular solute-binding protein  46.15 
 
 		 251 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1571  extracellular solute-binding protein family 3  46.85 
 
 		 249 aa  191  1e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1758  extracellular solute-binding protein family 3  45.78 
 
 		 247 aa  187  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.809792  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0805  extracellular solute-binding protein family 3  43.29 
 
 		 247 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.789569  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18770  extracellular solute-binding protein family 3  40.45 
 
 		 244 aa  169  5e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.74936e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1658  extracellular solute-binding protein  37.22 
 
 		 243 aa  167  2e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000026827  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0324  extracellular solute-binding protein  39.73 
 
 		 246 aa  145  5e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0727  extracellular solute-binding protein  37.55 
 
 		 264 aa  144  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114827  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  32.82 
 
 		 250 aa  144  2e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0342  extracellular solute-binding protein  39.29 
 
 		 246 aa  143  3e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0470  extracellular solute-binding protein  31.94 
 
 		 247 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1692  extracellular solute-binding protein family 3  35 
 
 		 258 aa  138  1e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.350495 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0771  extracellular solute-binding protein  31.16 
 
 		 264 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000484393  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1848  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.32 
 
 		 513 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3406  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  32.96 
 
 		 251 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.940811  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0244  cystine transporter subunit  35.14 
 
 		 266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.136857  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1126  extracellular solute-binding protein  34.52 
 
 		 284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0904  glutamine-binding periplasmic protein  31.7 
 
 		 254 aa  126  4.0000000000000003e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.207514  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0928  extracellular solute-binding protein family 3  34.91 
 
 		 254 aa  126  4.0000000000000003e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0242  cystine transporter subunit  36.24 
 
 		 264 aa  126  5e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.310723 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0227  cystine transporter subunit  36.24 
 
 		 264 aa  125  6e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00670463 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1148  extracellular solute-binding protein  32.7 
 
 		 283 aa  124  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4985  cystine transporter subunit  35.06 
 
 		 264 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.916643 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2074  extracellular solute-binding protein  30.43 
 
 		 277 aa  124  2e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0251  cystine transporter subunit  34.5 
 
 		 264 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0589  extracellular solute-binding protein family 3  34.96 
 
 		 247 aa  123  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0251025  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5180  cystine ABC transporter, periplasmic cystine binding protein  33.92 
 
 		 268 aa  123  4e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  34.7 
 
 		 257 aa  122  4e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1869  extracellular solute-binding protein family 3  31.93 
 
 		 272 aa  122  6e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000802311  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1868  extracellular solute-binding protein family 3  35.09 
 
 		 247 aa  121  9.999999999999999e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.265180000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1804  extracellular solute-binding protein family 3  32.26 
 
 		 267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0358  cystine transporter subunit  34.38 
 
 		 265 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.95727 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1135  extracellular solute-binding protein  32.97 
 
 		 268 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0567537  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3710  extracellular solute-binding protein  36.32 
 
 		 253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.33118  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3796  extracellular solute-binding protein family 3  32.43 
 
 		 281 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0150584  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0131  glutamine transport system substrate-binding protein  33.04 
 
 		 285 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.210199  normal  0.0525108 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5891  putative periplasmic binding protein  33.78 
 
 		 250 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68070  putative periplasmic binding protein  33.78 
 
 		 250 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.467705  normal  0.0215943 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2009  cystine transporter subunit  32.88 
 
 		 265 aa  119  7e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163072  decreased coverage  0.0074335 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4752  extracellular solute-binding protein family 3  30.91 
 
 		 269 aa  119  7e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000170582  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2053  extracellular solute-binding protein family 3  32.48 
 
 		 271 aa  119  7e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0489  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.73 
 
 		 490 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0983  extracellular solute-binding protein family 3  29.89 
 
 		 264 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0154796  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2056  extracellular solute-binding protein family 3  34.07 
 
 		 257 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00137642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1070  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  30.04 
 
 		 263 aa  118  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.623597  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1588  extracellular solute-binding protein  32.89 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2031  cystine transporter subunit  31.44 
 
 		 266 aa  117  3e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3277  extracellular solute-binding protein family 3  29.52 
 
 		 264 aa  117  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2274  cystine transporter subunit  31.44 
 
 		 266 aa  117  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4912  extracellular solute-binding protein  33.88 
 
 		 254 aa  116  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2214  extracellular solute-binding protein  33.61 
 
 		 268 aa  117  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2376  cystine transporter subunit  31.44 
 
 		 266 aa  117  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1726  extracellular solute-binding protein family 3  31.44 
 
 		 285 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0106098  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2154  cystine transporter subunit  31.14 
 
 		 266 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0349557  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2694  cystine transporter subunit  31.44 
 
 		 266 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.520163  normal  0.0574677 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1231  extracellular solute-binding protein  30.83 
 
 		 260 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.62778 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2019  cystine transporter subunit  31.14 
 
 		 266 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.579561  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1262  cystine transporter subunit  31.14 
 
 		 266 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0848905  normal  0.0261829 
 
 
-
 
NC_002936  DET0419  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.67 
 
 		 260 aa  116  5e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000266261  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2289  extracellular solute-binding protein family 3  33.63 
 
 		 257 aa  116  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.019267  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5358  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  35.24 
 
 		 254 aa  116  5e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1048  cystine transporter subunit  31.14 
 
 		 266 aa  115  5e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202301  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1562  extracellular solute-binding protein  31.09 
 
 		 261 aa  115  5e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.470134  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1719  cystine transporter subunit  31.14 
 
 		 285 aa  115  6e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2076  extracellular solute-binding protein  32.65 
 
 		 264 aa  115  6.9999999999999995e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_362  amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  31.03 
 
 		 260 aa  115  8.999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000000733431  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3760  extracellular solute-binding protein  33.19 
 
 		 245 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000882813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0295  ABC basic amino acid transporter, periplasmic binding protein  30.94 
 
 		 266 aa  114  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.874401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0325  extracellular solute-binding protein  30.94 
 
 		 266 aa  114  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0327  extracellular solute-binding protein  30.97 
 
 		 305 aa  115  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0501  extracellular solute-binding protein  35.27 
 
 		 281 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2184  extracellular solute-binding protein  28.19 
 
 		 295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092646 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0860  extracellular solute-binding protein family 3  32.89 
 
 		 246 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.599972 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3886  amino acid ABC transporter permease  33.48 
 
 		 501 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3397  extracellular solute-binding protein  30.67 
 
 		 245 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0237  extracellular solute-binding protein family 3  33.8 
 
 		 267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.640745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3027  extracellular solute-binding protein  32.13 
 
 		 244 aa  113  3e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3442  extracellular solute-binding protein  29.06 
 
 		 285 aa  113  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3512  extracellular solute-binding protein family 3  31.38 
 
 		 256 aa  113  3e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.249774  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3392  extracellular solute-binding protein  32.13 
 
 		 244 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0624048  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0854  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  33.76 
 
 		 282 aa  112  4.0000000000000004e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0919  extracellular solute-binding protein  33.48 
 
 		 244 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.994657 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1461  ABC-type amino acid transport system, periplasmic and permease components  33.19 
 
 		 736 aa  113  4.0000000000000004e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0986  extracellular solute-binding protein  32.13 
 
 		 244 aa  112  5e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0951  extracellular solute-binding protein  32.13 
 
 		 244 aa  112  5e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1958  arginine/ornithine periplasmic binding protein-dependent transporter  31.85 
 
 		 258 aa  112  5e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.488249  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2066  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  32.64 
 
 		 258 aa  112  6e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2179  extracellular solute-binding protein  31.72 
 
 		 250 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.158318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1930  extracellular solute-binding protein family 3  29.8 
 
 		 248 aa  112  6e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000351018  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2287  extracellular solute-binding protein family 3  29.41 
 
 		 248 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000177355 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3166  extracellular solute-binding protein  31.17 
 
 		 242 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.190587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4274  extracellular solute-binding protein  34.93 
 
 		 258 aa  112  7.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0882363  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>