More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0005 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_0005  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
1399 aa  2896    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.7049  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1415  multi-sensor signal transduction histidine kinase  56.71 
 
 
2072 aa  673    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384608  normal  0.53452 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1350  multi-sensor signal transduction histidine kinase  58.13 
 
 
1758 aa  608  9.999999999999999e-173  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.669381 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1417  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.31 
 
 
1055 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0587691  normal  0.569805 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1354  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.99 
 
 
1276 aa  381  1e-104  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.530457  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2672  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.57 
 
 
619 aa  271  5e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.96 
 
 
1325 aa  240  2e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.120961 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1352  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.27 
 
 
732 aa  238  8e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.161755  normal  0.747327 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2968  putative PAS/PAC sensor protein  39.02 
 
 
479 aa  237  9e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2477  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.11 
 
 
1439 aa  234  1e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131363  normal  0.44536 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0053  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.68 
 
 
968 aa  230  1e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1847  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.25 
 
 
763 aa  225  4e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.926751  normal  0.806541 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2462  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.06 
 
 
1032 aa  224  9.999999999999999e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1419  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.48 
 
 
769 aa  221  8.999999999999998e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849788  normal  0.753623 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1070  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.52 
 
 
1426 aa  221  8.999999999999998e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.632131  normal  0.158919 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1981  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.62 
 
 
651 aa  214  7.999999999999999e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2554  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.88 
 
 
844 aa  213  3e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.91 
 
 
1301 aa  204  9.999999999999999e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.012558 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0331  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.67 
 
 
608 aa  204  9.999999999999999e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0867  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.66 
 
 
905 aa  201  9e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.768776  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.47 
 
 
768 aa  196  2e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.103172  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1048  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.98 
 
 
931 aa  196  3e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.339388  normal  0.130033 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1420  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.97 
 
 
1121 aa  196  3e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0817518  normal  0.492636 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1739  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.12 
 
 
841 aa  190  2e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.165697  normal  0.509542 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1919  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.19 
 
 
862 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.592004  normal  0.385421 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1516  signal transduction histidine kinase  35.19 
 
 
1205 aa  185  7e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0460264 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1846  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.55 
 
 
737 aa  184  9.000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1353  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.56 
 
 
1078 aa  182  4.999999999999999e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0004  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.63 
 
 
1039 aa  180  2e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.763661  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1413  putative PAS/PAC sensor protein  25.04 
 
 
1251 aa  179  2e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.629832 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.11 
 
 
765 aa  178  6e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3264  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.51 
 
 
1134 aa  177  1.9999999999999998e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2150  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.8 
 
 
1643 aa  177  1.9999999999999998e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.133009  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2789  sensory box histidine kinase  31.18 
 
 
770 aa  174  7.999999999999999e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0877  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.69 
 
 
1050 aa  174  1e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.948624  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0161  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.36 
 
 
1039 aa  173  2e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2110  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.2 
 
 
789 aa  173  2e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.377648  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 
644 aa  171  7e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1242  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 
472 aa  171  1e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.41521  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0237  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.62 
 
 
440 aa  170  2e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1140  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.78 
 
 
563 aa  169  2.9999999999999998e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0338  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.66 
 
 
653 aa  169  2.9999999999999998e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.79 
 
 
1253 aa  168  5e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.841858  normal  0.0475592 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.94 
 
 
873 aa  168  5e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3403  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.31 
 
 
957 aa  168  5.9999999999999996e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1055  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.54 
 
 
639 aa  167  1.0000000000000001e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.345165 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2693  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.71 
 
 
727 aa  167  1.0000000000000001e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0252521 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0170  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.4 
 
 
603 aa  167  2.0000000000000002e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2213  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.86 
 
 
1069 aa  165  6e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.273979 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1487  signal transduction histidine kinase  30.47 
 
 
924 aa  165  7e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.588746 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  35.91 
 
 
909 aa  164  8.000000000000001e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2259  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.38 
 
 
593 aa  164  1e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2385  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.96 
 
 
720 aa  164  1e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1347  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.13 
 
 
638 aa  163  2e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.679676  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.25 
 
 
771 aa  162  3e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1525  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 
813 aa  162  4e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0467  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.61 
 
 
431 aa  162  4e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.466167  hitchhiker  0.00940458 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1121  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.16 
 
 
1513 aa  162  4e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1502  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.65 
 
 
783 aa  161  6e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0445794 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1962  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.93 
 
 
603 aa  160  1e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2431  diguanylate cyclase  57.14 
 
 
329 aa  160  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.966679  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2258  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.92 
 
 
566 aa  160  2e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.866363 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1933  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.46 
 
 
589 aa  160  2e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2061  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  35.06 
 
 
600 aa  159  2e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.658977 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2222  diguanylate cyclase  56.35 
 
 
312 aa  160  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0027044  normal  0.320993 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2298  diguanylate cyclase  56.35 
 
 
312 aa  160  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.44184  normal  0.652684 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0058  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.44 
 
 
581 aa  159  3e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0545  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.25 
 
 
896 aa  159  5.0000000000000005e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.91043  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1755  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.43 
 
 
781 aa  159  5.0000000000000005e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1244  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.25 
 
 
813 aa  158  8e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1250  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.51 
 
 
559 aa  158  9e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1167  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.96 
 
 
544 aa  157  1e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.230477  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2174  cyclic nucleotide phosphodiesterase, putative  46.06 
 
 
320 aa  157  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0908  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.69 
 
 
1267 aa  157  2e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.142245  normal  0.539943 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0493  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.05 
 
 
440 aa  156  2.9999999999999998e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.274957  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0266  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.59 
 
 
736 aa  155  4e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0292  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.07 
 
 
530 aa  155  5e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1208  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.76 
 
 
619 aa  155  5e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0242207  normal  0.0474084 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1112  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.09 
 
 
493 aa  155  5.9999999999999996e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.607083 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0309  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.33 
 
 
657 aa  154  8.999999999999999e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1307  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.05 
 
 
1225 aa  154  2e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.551936  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22780  GGDEF protein  51.41 
 
 
318 aa  153  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0043996  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1527  signal transduction histidine kinase  28.85 
 
 
1227 aa  152  3e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.823974 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1943  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.34 
 
 
596 aa  152  3e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1482  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 
656 aa  152  4e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.548294  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1481  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.72 
 
 
1425 aa  152  4e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1309  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.44 
 
 
472 aa  152  5e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.974547  normal  0.0144544 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1349  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.73 
 
 
1111 aa  151  7e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.444762  normal  0.501062 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0912  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.14 
 
 
903 aa  151  9e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.644945  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0006  putative PAS/PAC sensor protein  29.24 
 
 
412 aa  150  1.0000000000000001e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.533638  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1434  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.16 
 
 
481 aa  150  1.0000000000000001e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0656222  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0331  diguanylate cyclase  55.46 
 
 
318 aa  150  1.0000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.552505  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0274  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 
472 aa  150  1.0000000000000001e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.836728  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0295  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.94 
 
 
655 aa  149  4.0000000000000006e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3741  putative PAS/PAC sensor protein  29.66 
 
 
1268 aa  149  4.0000000000000006e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0157  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.87 
 
 
478 aa  148  6e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.260977 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.5 
 
 
753 aa  148  7.0000000000000006e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2634  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  29.32 
 
 
843 aa  148  9e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.86 
 
 
569 aa  147  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.176462  normal  0.11002 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0986  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.47 
 
 
433 aa  147  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0645349  normal  0.624976 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>