More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0003 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_0003  CheW protein  100 
 
 		 200 aa  402  1e-111  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0102214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1423  CheW protein  76.19 
 
 		 189 aa  282  2.0000000000000002e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.797772  normal  0.101367 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2399  CheW protein  59.38 
 
 		 190 aa  228  5e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1708  CheW protein  48.47 
 
 		 181 aa  149  2e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.425738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1069  CheW protein  50 
 
 		 160 aa  148  6e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.691995  normal  0.156637 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1098  putative CheW protein  50.98 
 
 		 177 aa  145  5e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.428476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1247  putative CheW protein  47.02 
 
 		 201 aa  140  1.9999999999999998e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0898  CheW protein  49.39 
 
 		 187 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.109851  normal  0.161542 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0969  CheW protein  44.85 
 
 		 178 aa  135  4e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1925  CheW protein  46.62 
 
 		 174 aa  131  5e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0967  CheW protein  45.1 
 
 		 178 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0007  CheW protein  45.33 
 
 		 169 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2634  CheW protein  52.98 
 
 		 184 aa  126  3e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0117259  hitchhiker  0.00200366 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1774  CheW protein  42.29 
 
 		 179 aa  125  5e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.298965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1579  putative CheW protein  32.26 
 
 		 170 aa  91.7  7e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.450037  normal  0.31697 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0960  CheW protein  37.04 
 
 		 779 aa  90.5  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0366627  normal  0.772368 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1544  putative CheW protein  34.62 
 
 		 159 aa  83.2  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0974613  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1768  CheW protein  29.87 
 
 		 907 aa  80.1  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.52563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  36.51 
 
 		 165 aa  77.4  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2550  CheW protein  28.39 
 
 		 169 aa  75.5  0.0000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.234406 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1642  CheW protein  40 
 
 		 124 aa  74.3  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.116806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2885  CheW protein  27.98 
 
 		 404 aa  74.3  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  31.08 
 
 		 162 aa  74.3  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2836  CheW protein  32.3 
 
 		 156 aa  73.2  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0103385 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1450  chemotaxis signal transduction protein  32.33 
 
 		 518 aa  73.6  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2575  CheW protein  32.3 
 
 		 156 aa  73.2  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2861  chemotaxis protein  38.26 
 
 		 154 aa  73.9  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.952149  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0320  CheW protein  33.59 
 
 		 160 aa  72.8  0.000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2050  putative CheW protein  38.26 
 
 		 154 aa  72.8  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143061  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  32.1 
 
 		 170 aa  72.8  0.000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  35.85 
 
 		 159 aa  71.6  0.000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2261  CheW protein  31.21 
 
 		 161 aa  70.9  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00686219 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  38.83 
 
 		 165 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0944  CheW protein  31.69 
 
 		 141 aa  70.5  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  38.83 
 
 		 165 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1319  CheW protein  32.28 
 
 		 179 aa  70.1  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.783186  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  30 
 
 		 159 aa  69.7  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  32.85 
 
 		 163 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  32.28 
 
 		 164 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  32.28 
 
 		 164 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  32.28 
 
 		 164 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  32.28 
 
 		 164 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  35.14 
 
 		 165 aa  68.6  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0209  CheW protein  32.52 
 
 		 150 aa  68.2  0.00000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  31.58 
 
 		 161 aa  68.2  0.00000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0779  CheW protein  34.26 
 
 		 165 aa  68.2  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0247  CheW protein  30.14 
 
 		 141 aa  68.6  0.00000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.136861  normal  0.143746 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2309  CheW protein  27.5 
 
 		 238 aa  68.2  0.00000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  31.5 
 
 		 164 aa  68.2  0.00000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0724  CheW protein  30.77 
 
 		 171 aa  67.8  0.00000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  38.78 
 
 		 161 aa  67.8  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1944  CheW protein  39.58 
 
 		 425 aa  67.4  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  33.33 
 
 		 159 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  33.33 
 
 		 159 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  33.33 
 
 		 159 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2166  putative CheW protein  31.01 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.260989  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  33.33 
 
 		 159 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0689  CheW protein  38.46 
 
 		 333 aa  67.4  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.283168  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0275  putative CheW protein  36.07 
 
 		 150 aa  67.4  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.18524  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  33.06 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  31.25 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  30.67 
 
 		 168 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  32.54 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  31.5 
 
 		 164 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  31.5 
 
 		 164 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  31.5 
 
 		 164 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  32.03 
 
 		 161 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  31.2 
 
 		 159 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  31.5 
 
 		 164 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  31.2 
 
 		 159 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  32.14 
 
 		 168 aa  65.9  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  32 
 
 		 162 aa  65.9  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  33.06 
 
 		 163 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3142  putative CheW protein  29.45 
 
 		 160 aa  65.5  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  32.54 
 
 		 159 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2796  putative CheW protein  31.2 
 
 		 159 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153028  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1560  putative CheW protein  32.26 
 
 		 146 aa  65.5  0.0000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.918027  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  31.2 
 
 		 164 aa  65.5  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1327  CheW protein  35.42 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.893593  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1988  chemotaxis protein CheW  32.54 
 
 		 159 aa  65.5  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381098  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0878  CheW protein  28.77 
 
 		 192 aa  65.1  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00285186  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3558  CheW protein  30.67 
 
 		 160 aa  65.1  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.911694  normal  0.981486 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  33.61 
 
 		 163 aa  65.1  0.0000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  29.61 
 
 		 163 aa  65.1  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  33.07 
 
 		 164 aa  64.7  0.0000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  37.5 
 
 		 164 aa  64.7  0.0000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  36.36 
 
 		 164 aa  64.7  0.0000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3259  CheW protein  30 
 
 		 158 aa  64.3  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105416  normal  0.09229 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  36.54 
 
 		 174 aa  63.9  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07620  putative CheW protein  40.66 
 
 		 165 aa  64.7  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000372381  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3887  CheW protein  33.94 
 
 		 141 aa  63.9  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.110248  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  30.46 
 
 		 165 aa  64.3  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  30.46 
 
 		 165 aa  64.3  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  31.4 
 
 		 164 aa  64.3  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1611  CheW protein  38.83 
 
 		 141 aa  64.7  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00323467  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3496  biotin synthase  38.61 
 
 		 179 aa  63.9  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.296204  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0936  response regulator receiver modulated CheW protein  24.7 
 
 		 301 aa  63.5  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  34.95 
 
 		 165 aa  63.2  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0744  CheW protein  31.96 
 
 		 170 aa  63.5  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0759  CheW protein  31.96 
 
 		 170 aa  63.2  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0623723 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>