268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_R0046 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_14034  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000622318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0046  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.467185  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0014  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0015  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0817161  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0014  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.591193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0018  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0021  tRNA-Val  98.67 
 
 		 75 bp  141  3e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0036  tRNA-Val  98.67 
 
 		 75 bp  141  3e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0258762  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0026  tRNA-Val  100 
 
 		 72 bp  133  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0265977  hitchhiker  0.000432959 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14860  tRNA-Val  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.303289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0039  tRNA-Val  97.01 
 
 		 72 bp  117  3.9999999999999997e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00107403  hitchhiker  0.00887894 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0038  tRNA-Val  97.01 
 
 		 72 bp  117  3.9999999999999997e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00268365  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0029  tRNA-Val  94.52 
 
 		 75 bp  113  6e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0245746  normal  0.0651884 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0043  tRNA-Val  96.92 
 
 		 75 bp  113  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0177605  normal  0.590974 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0047  tRNA-Val  96.92 
 
 		 75 bp  113  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00873766  hitchhiker  0.00896999 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0040  tRNA-Val  96.92 
 
 		 75 bp  113  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.288253  hitchhiker  0.000507453 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0041  tRNA-Val  95.52 
 
 		 72 bp  109  9.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000505895  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0029  tRNA-Val  93.15 
 
 		 75 bp  105  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0037  tRNA-Val  93.15 
 
 		 75 bp  105  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.605152  normal  0.0106326 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0026  tRNA-Val  93.06 
 
 		 75 bp  103  6e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.179113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0041  tRNA-Val  93.06 
 
 		 72 bp  103  6e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.532077  normal  0.0646966 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14900  tRNA-Val  91.78 
 
 		 75 bp  97.6  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0038  tRNA-Val  91.78 
 
 		 75 bp  97.6  3e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0032  tRNA-Val  91.78 
 
 		 75 bp  97.6  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.463355  normal  0.0505941 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0036  tRNA-Val  91.78 
 
 		 75 bp  97.6  3e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0042  tRNA-Val  91.78 
 
 		 75 bp  97.6  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0153066  hitchhiker  0.00834851 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0033  tRNA-Val  91.78 
 
 		 75 bp  97.6  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.526612  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0035  tRNA-Val  91.78 
 
 		 75 bp  97.6  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.522217  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0026  tRNA-Val  91.78 
 
 		 75 bp  97.6  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0408746  normal  0.0924489 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0029  tRNA-Val  91.78 
 
 		 75 bp  97.6  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000337509 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0028  tRNA-Val  91.78 
 
 		 75 bp  97.6  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00986707 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0030  tRNA-Val  91.67 
 
 		 75 bp  95.6  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10750  tRNA-Val  91.67 
 
 		 72 bp  95.6  1e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0216656  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16730  tRNA-Val  92.54 
 
 		 72 bp  93.7  5e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251043  normal  0.0595565 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0033  tRNA-Val  92.54 
 
 		 72 bp  93.7  5e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000837062 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16760  tRNA-Val  92.54 
 
 		 72 bp  93.7  5e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.268589  normal  0.0588163 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0029  tRNA-Val  92.54 
 
 		 72 bp  93.7  5e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.742373  hitchhiker  0.00208243 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0031  tRNA-Val  92.54 
 
 		 72 bp  93.7  5e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000451767 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0037  tRNA-Val  92.54 
 
 		 72 bp  93.7  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.960362  normal  0.0810888 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0032  tRNA-Val  90.41 
 
 		 75 bp  89.7  8e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0045  tRNA-Val  90.41 
 
 		 75 bp  89.7  8e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0052  tRNA-Val  90.41 
 
 		 75 bp  89.7  8e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0026  tRNA-Val  90.41 
 
 		 75 bp  89.7  8e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000411365 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0049  tRNA-Val  90.41 
 
 		 75 bp  89.7  8e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0027  tRNA-Val  90.41 
 
 		 75 bp  89.7  8e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.60657 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0044  tRNA-Val  92.31 
 
 		 72 bp  89.7  8e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13890  tRNA-Val  90.28 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0287375  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13840  tRNA-Val  90.28 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.150199  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0051  tRNA-Val  92.19 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000163002  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0029  tRNA-Val  91.04 
 
 		 72 bp  85.7  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.575368 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0028  tRNA-Val  91.04 
 
 		 72 bp  85.7  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000436096 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0025  tRNA-Val  89.04 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000057008  normal  0.409519 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0044  tRNA-Val  89.04 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00403684  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15510  tRNA-Val  94.34 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00141573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0037  tRNA-Val  94.34 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0047  tRNA-Val  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.561657  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0023  tRNA-Val  89.55 
 
 		 72 bp  77.8  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.720893  normal  0.0127386 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0046  tRNA-Val  89.55 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0191389  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0025  tRNA-Val  94.12 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.962727  normal  0.312894 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Val-2  tRNA-Val  88.41 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.516841  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0031  tRNA-Val  87.67 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000478109 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0033  tRNA-Val  87.67 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.523176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0060  tRNA-Val  87.67 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000546078  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0052  tRNA-Val  87.67 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.886993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0021  tRNA-Val  92.45 
 
 		 72 bp  73.8  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0013  tRNA-Val  87.67 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.736454 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0036  tRNA-Val  88.06 
 
 		 72 bp  69.9  0.00000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.821341  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13860  tRNA-Val  93.62 
 
 		 72 bp  69.9  0.00000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0312518  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07210  tRNA-Val  97.44 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000170104  normal  0.87743 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0053  tRNA-Val  90.74 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000250607  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0033  tRNA-Val  86.96 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000112986  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0044  tRNA-Val  90.57 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.311014  normal  0.10516 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0025  tRNA-Val  86.3 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000640058  normal  0.0750081 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0031  tRNA-Val  86.96 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0032  tRNA-Val  86.3 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00002348 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0033  tRNA-Val  86.3 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Val-3  tRNA-Val  89.09 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0018  tRNA-Val  86.57 
 
 		 72 bp  61.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.347531  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0030  tRNA-Val  95.35 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000000857099  normal  0.523891 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07570  tRNA-Val  87.3 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.10137  normal  0.977811 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAValVIMSS1309212  tRNA-Val  86.57 
 
 		 72 bp  61.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.430818  normal  0.748874 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0065  tRNA-Val  88.89 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0059636  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0045  tRNA-Val  88.89 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0045  tRNA-Val  88.89 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0059  tRNA-Val  88.89 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000382947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0046  tRNA-Val  88.89 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000910848  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Val-4  tRNA-Val  85.51 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.464554  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0051  tRNA-Val  85.51 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000353155  normal  0.0160187 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2650  tRNA-Val  85.51 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0061  tRNA-Val  85.51 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.700263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0047  tRNA-Val  85.51 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0061  tRNA-Val  85.51 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.17954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0089  tRNA-Val  85.51 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347614  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0043  tRNA-Val  87.72 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0172535  normal  0.864924 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0061  tRNA-Val  85.51 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2705  tRNA-Val  85.51 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0024  tRNA-Val  84.93 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000776805  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0038  tRNA-Val  85.51 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.827791  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0031  tRNA-Val  84.93 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.432364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2266  tRNA-Val  85.51 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.248753  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>