More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_5477 on replicon NC_009339
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_1584  IS891/IS1136/IS1341 family transposase  83.45 
 
 		 417 aa  712    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.200242  normal  0.758267 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3319  IS891/IS1136/IS1341 family transposase  86.27 
 
 		 415 aa  715    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.947288 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5477  IS605 family transposase OrfB  100 
 
 		 416 aa  848    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.461601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3797  IS605 family transposase OrfB  56.93 
 
 		 429 aa  436  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.414505 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6349  transposase  56.82 
 
 		 429 aa  429  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1800  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  59.84 
 
 		 386 aa  427  1e-118  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.31256  normal  0.500943 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1133  transposase, IS605 OrfB  54.57 
 
 		 397 aa  412  1e-114  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1324  transposase  54.57 
 
 		 397 aa  412  1e-114  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0532148  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2022  IS605 family transposase OrfB  38.18 
 
 		 402 aa  251  2e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000253507  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1062  IS605 family transposase orfB  37.81 
 
 		 402 aa  247  2e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000017458  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01390  predicted transposase  37.93 
 
 		 402 aa  247  3e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01400  hypothetical protein  37.93 
 
 		 402 aa  247  3e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2214  transposase, IS605 OrfB family  39.02 
 
 		 382 aa  245  9e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.645387  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2227  IS605 family transposase OrfB  39.02 
 
 		 382 aa  245  9e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.722641 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3630  transposase, IS605 orfB family  37.68 
 
 		 402 aa  245  9e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000427387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1611  IS605 family transposase OrfB  37.56 
 
 		 402 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2166  IS605 family transposase OrfB  37.92 
 
 		 387 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0448  IS605 family transposase orfB  37.47 
 
 		 402 aa  244  3e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3890  IS605 family transposase OrfB  37.93 
 
 		 402 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1516  IS605 family transposase OrfB  37.68 
 
 		 402 aa  243  6e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5722  transposase, IS605 orfB family  37.68 
 
 		 402 aa  242  9e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000324341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0023  IS605 family transposase OrfB  37.47 
 
 		 402 aa  241  2e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2764  IS605 family transposase OrfB  37.18 
 
 		 411 aa  239  6.999999999999999e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.432246  normal  0.196965 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0845  IS605 family transposase OrfB  41.21 
 
 		 381 aa  238  1e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0714  IS605 family transposase OrfB  41.21 
 
 		 381 aa  238  1e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0279  IS605 family transposase OrfB  35.77 
 
 		 411 aa  235  1.0000000000000001e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1294  IS605 family transposase OrfB  35.29 
 
 		 411 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3880  IS605 family transposase OrfB  36.25 
 
 		 411 aa  234  3e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1278  IS605 family transposase OrfB  35.1 
 
 		 413 aa  233  6e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.716474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3066  IS605 family transposase OrfB  34.58 
 
 		 402 aa  229  5e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6989  transposase  36.3 
 
 		 400 aa  227  4e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3509  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  41.91 
 
 		 398 aa  226  4e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0613  IS605 family transposase OrfB  34.07 
 
 		 411 aa  226  5.0000000000000005e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5691  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  39.26 
 
 		 396 aa  226  8e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6840  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  40.9 
 
 		 396 aa  224  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.643066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4187  IS605 family transposase OrfB  37.71 
 
 		 422 aa  218  2e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00750  Transposase, IS891/IS1136/IS1341/IS605  36.93 
 
 		 403 aa  217  4e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16800  transposase, IS605  36.83 
 
 		 403 aa  216  5.9999999999999996e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1058  ISAfe8, transposase  38.5 
 
 		 408 aa  216  7e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.19621  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1215  ISAfe8, transposase  37.75 
 
 		 408 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.630529  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42370  transposase  36.57 
 
 		 403 aa  214  1.9999999999999998e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3236  IS200 transposase orfB  35.43 
 
 		 399 aa  212  9e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.48969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5398  transposase  34.51 
 
 		 422 aa  208  1e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1550  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  42.43 
 
 		 401 aa  206  4e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.734191  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15780  transposase, IS891/IS1136/IS1341  35.04 
 
 		 406 aa  203  4e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1390  transposase  35.31 
 
 		 348 aa  203  6e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0279929  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1280  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  41.27 
 
 		 403 aa  201  3e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.138792 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0127  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  41.27 
 
 		 403 aa  198  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.291596 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0486  transposase  34.12 
 
 		 348 aa  197  3e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0583  transposase  34.12 
 
 		 348 aa  197  3e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3354  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  41.87 
 
 		 403 aa  187  4e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3904  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  39.89 
 
 		 517 aa  186  6e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.112308 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2560  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  34.9 
 
 		 431 aa  181  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.747478  normal  0.0116534 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0649  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  35.21 
 
 		 435 aa  167  2e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5918  IS605 family transposase OrfB  33.17 
 
 		 399 aa  157  4e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.320804 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7257  IS605 family transposase OrfB  37.88 
 
 		 399 aa  147  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.793072  normal  0.105213 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2738  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  31.3 
 
 		 361 aa  144  3e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2963  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  38.6 
 
 		 399 aa  143  5e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.268101  normal  0.616422 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3266  transposase  38.6 
 
 		 399 aa  143  5e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.364761 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5850  IS605 family transposase OrfB  39.47 
 
 		 399 aa  143  7e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3502  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  33.95 
 
 		 406 aa  140  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0717  transposase  37.25 
 
 		 219 aa  140  3.9999999999999997e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0318714  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0373  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  29.61 
 
 		 444 aa  140  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0668  transposase  35.27 
 
 		 231 aa  139  7.999999999999999e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000294639  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1677  putative transposase IS605 family  28.22 
 
 		 449 aa  137  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1215  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  33.42 
 
 		 399 aa  137  5e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0567342  normal  0.0860408 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3183  transposase, IS605 OrfB family  30.65 
 
 		 496 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1117  IS605 family transposase OrfB  27.78 
 
 		 395 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.148504  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3581  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  29.13 
 
 		 444 aa  133  5e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2479  transposase, IS605 OrfB family  27.09 
 
 		 388 aa  133  5e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2663  transposase, IS605 OrfB family  27.58 
 
 		 440 aa  133  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.149189 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1958  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  29.13 
 
 		 440 aa  133  6e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0714326  normal  0.520814 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1931  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  29.13 
 
 		 440 aa  133  6e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0778  transposase, IS605 OrfB family  30.59 
 
 		 500 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5163  transposase, IS608 family  27.13 
 
 		 399 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000648868 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2946  transposase, IS605 OrfB family  27.23 
 
 		 384 aa  126  6e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.420176 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0294  IS605 family transposase OrfB  25.06 
 
 		 424 aa  125  1e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.414871  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2515  transposase, IS605 OrfB family  30.06 
 
 		 326 aa  125  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4194  transposase, IS605 OrfB family  28.49 
 
 		 383 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4154  transposase, IS605 OrfB family  28.49 
 
 		 383 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1018  transposase  25.86 
 
 		 370 aa  124  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3049  transposase  26.12 
 
 		 370 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00782519  normal  0.671104 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0285  IS891/IS1136/IS1341 transposase  25.65 
 
 		 461 aa  122  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.310253  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2213  transposase IS605 OrfB family  27.72 
 
 		 376 aa  122  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3751  transposase  24.54 
 
 		 370 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.947255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3241  transposase  26.12 
 
 		 370 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.14303 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2209  transposase, IS605 OrfB family  28.22 
 
 		 405 aa  121  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000968463 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2201  transposase, IS605 OrfB family  28.22 
 
 		 405 aa  121  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00013574 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4609  transposase, IS605 OrfB family  27.94 
 
 		 396 aa  121  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.483897 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1883  transposase, IS605 OrfB family  27.23 
 
 		 394 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1973  transposase  26.12 
 
 		 370 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1508  transposase, IS605 OrfB family  29.92 
 
 		 370 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1857  transposase, IS605 OrfB family  27.23 
 
 		 394 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3755  transposase  25.86 
 
 		 393 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2694  transposase  25.86 
 
 		 370 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.240385  normal  0.200603 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1722  transposase, IS605 OrfB family  29.69 
 
 		 370 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3814  transposase, IS605 OrfB family  26.82 
 
 		 363 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000135622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3217  transposase  25.78 
 
 		 394 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0165855 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2243  transposase, IS605 OrfB family  31.2 
 
 		 424 aa  117  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2689  transposase, IS605 OrfB family  28.13 
 
 		 363 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>