More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_5378 on replicon NC_009339
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009339  Mflv_5378  peptidase M23B  100 
 
 
339 aa  682    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2817  peptidase M23B  82.65 
 
 
339 aa  528  1e-149  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3705  peptidase M23B  83.19 
 
 
340 aa  528  1e-149  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5342  peptidase M23B  81.71 
 
 
340 aa  525  1e-148  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.556656  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5669  peptidase M23B  81.71 
 
 
340 aa  525  1e-148  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1864  peptidase M23B  45.89 
 
 
351 aa  245  9e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.102724 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4328  peptidase M23B  45.72 
 
 
360 aa  240  2e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4414  peptidase M23B  45.72 
 
 
360 aa  240  2e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.307323  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4510  peptidase M23B  43.4 
 
 
334 aa  239  5.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4708  peptidase M23B  45.43 
 
 
360 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4871  peptidase M23B  47.92 
 
 
348 aa  237  3e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.289392  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10968  hypothetical protein  55.27 
 
 
332 aa  218  2e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.292549 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5120  Peptidase M23  56.6 
 
 
288 aa  187  3e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04900  metalloendopeptidase-like membrane protein  63.49 
 
 
235 aa  180  2.9999999999999997e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6511  Peptidase M23  50.6 
 
 
224 aa  176  4e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33100  metalloendopeptidase-like membrane protein  60.98 
 
 
326 aa  172  5.999999999999999e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.718817 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2660  Peptidase M23  57.81 
 
 
245 aa  165  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2895  Peptidase M23  57.02 
 
 
199 aa  159  7e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.351071  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2633  Peptidase M23  60.17 
 
 
348 aa  159  7e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3326  Peptidase M23  39.92 
 
 
340 aa  147  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1340  Peptidase M23  49.07 
 
 
346 aa  145  7.0000000000000006e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.363221  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2270  Peptidase M23  55 
 
 
727 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000539525  unclonable  0.00000000807187 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2207  Peptidase M23  55 
 
 
727 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3518  Peptidase M23  51.18 
 
 
406 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.829131  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  53.33 
 
 
751 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4752  Peptidase M23  53.54 
 
 
458 aa  140  3e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.817263  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1343  Peptidase M23  55.38 
 
 
320 aa  139  6e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.243109  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3195  peptidoglycan-binding LysM  53.33 
 
 
754 aa  139  7e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000999045  decreased coverage  0.00000682898 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2623  Peptidase M23  56.1 
 
 
311 aa  139  1e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1283  Peptidase M23  52.71 
 
 
251 aa  137  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4428  Peptidase M23  47.47 
 
 
272 aa  135  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.914132  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0633  Peptidase M23  49.23 
 
 
198 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0652  Peptidase M23  49.23 
 
 
198 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00716754  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4243  Peptidase M23  54.47 
 
 
311 aa  132  6.999999999999999e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2596  Peptidase M23  54.47 
 
 
311 aa  132  9e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  48.78 
 
 
590 aa  129  6e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  51.64 
 
 
452 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0237  peptidase M23B  49.59 
 
 
824 aa  127  3e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.130715 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4631  Peptidase M23  50 
 
 
195 aa  126  6e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0376  peptidase M23B  51.2 
 
 
271 aa  125  9e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14661  M23/M37 familypeptidase  45.38 
 
 
333 aa  122  6e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.122507 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1888  Peptidase M23  50.41 
 
 
511 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000847553  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1148  peptidoglycan-binding LysM  45.08 
 
 
358 aa  120  3.9999999999999996e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.766808  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1326  peptidoglycan-binding LysM  46.55 
 
 
349 aa  117  3e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0931152 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4610  peptidase M23  51.67 
 
 
788 aa  115  1.0000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.0000163265  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0688  Peptidase M23  47.06 
 
 
383 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.50956  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2464  Peptidase M23  36.87 
 
 
231 aa  112  7.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126719  normal  0.891349 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14641  LysM motif-containing protein  45.22 
 
 
360 aa  112  9e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.318084 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4205  peptidase M23B  40.94 
 
 
236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0068065 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  49.09 
 
 
491 aa  111  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6368  Peptidase M23  51.28 
 
 
269 aa  110  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2137  Peptidase M23  47.24 
 
 
466 aa  107  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000635965 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5984  peptidase M23B  45.45 
 
 
284 aa  107  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0310033  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0243  M24/M37 family peptidase  45.16 
 
 
300 aa  107  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2553  Peptidase M23  36.07 
 
 
323 aa  107  4e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  42.54 
 
 
274 aa  107  4e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4206  peptidase M23B  46.51 
 
 
270 aa  106  6e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3816  peptidase M23B  49.15 
 
 
283 aa  105  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0789  peptidase M23B  44.54 
 
 
284 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.236004  normal  0.0154646 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  45.69 
 
 
447 aa  103  5e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  45.69 
 
 
447 aa  103  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  47.41 
 
 
446 aa  103  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0752  peptidoglycan-binding peptidase M23B  46.15 
 
 
291 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.897589  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0799  Peptidase M23  46.15 
 
 
294 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00788388  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  47.86 
 
 
442 aa  101  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2752  Peptidase M23  43.59 
 
 
482 aa  101  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.76088  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0803  Peptidase M23  45.3 
 
 
292 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3774  peptidase M23B  44.53 
 
 
266 aa  101  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0097  peptidase M23B  38.4 
 
 
291 aa  100  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  42.31 
 
 
375 aa  100  5e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3297  peptidase M23B  43.75 
 
 
448 aa  100  5e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00235812  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5144  peptidase M23  38.42 
 
 
404 aa  99.8  6e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3815  peptidase M23B  32.74 
 
 
237 aa  99.8  6e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2197  Peptidase M23  37.43 
 
 
300 aa  99.8  7e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.927466  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  34.74 
 
 
309 aa  99.4  8e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0190  Peptidase M23  42.5 
 
 
582 aa  99.4  9e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0268  M23 peptidase domain protein  38.89 
 
 
417 aa  98.6  1e-19  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  44.74 
 
 
305 aa  99  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0177  peptidase M23  41.13 
 
 
298 aa  98.6  2e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  46.9 
 
 
321 aa  97.8  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0030  Peptidase M23  42.86 
 
 
445 aa  98.2  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0771  Peptidase M23  43.86 
 
 
305 aa  97.4  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4756  peptidase M23B  41.67 
 
 
333 aa  97.4  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0919319  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0771  Peptidase M23  43.86 
 
 
305 aa  97.4  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  39.07 
 
 
376 aa  97.4  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  44 
 
 
301 aa  97.1  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0654  Peptidase M23  38.76 
 
 
274 aa  97.1  4e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2406  peptidase M23B  42.86 
 
 
283 aa  97.1  4e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000810221  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1089  peptidase M23B  45.69 
 
 
443 aa  96.7  5e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.156803  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2565  metalloendopeptidase-like membrane protein  34.44 
 
 
304 aa  96.7  5e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.966222  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2172  peptidase M23B  46.67 
 
 
284 aa  96.7  6e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  42.28 
 
 
468 aa  96.3  6e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1779  Peptidase M23  45.28 
 
 
354 aa  96.3  8e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0539  Peptidase M23  40.31 
 
 
308 aa  95.9  8e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0824  Peptidase M23  50.41 
 
 
378 aa  95.9  9e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04840  peptidase M23B  41.67 
 
 
419 aa  95.9  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000479397  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0798  peptidase M23B  45.9 
 
 
352 aa  94.7  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  47.41 
 
 
400 aa  95.1  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  42.86 
 
 
524 aa  95.1  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2662  lipoprotein  44.26 
 
 
538 aa  94.7  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0792091  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>