More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_5350 on replicon NC_009339
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008703  Mkms_5661  NLP/P60 protein  99.43 
 
 
348 aa  683    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5350  NLP/P60 protein  100 
 
 
348 aa  687    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3713  NLP/P60 protein  99.14 
 
 
348 aa  680    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761513  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5385  NLP/P60 protein  93.68 
 
 
363 aa  588  1e-167  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.418529  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2808  NLP/P60 protein  94.54 
 
 
348 aa  570  1e-161  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0888  NLP/P60 protein  64.56 
 
 
363 aa  349  3e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1435  NLP/P60  62.04 
 
 
361 aa  345  7e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0418485  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1453  NLP/P60 protein  62.04 
 
 
361 aa  345  7e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4528  NLP/P60 protein  64.45 
 
 
370 aa  345  8.999999999999999e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160091  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2959  NLP/P60 protein  56.7 
 
 
378 aa  336  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.454421  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3287  NLP/P60  59.18 
 
 
372 aa  332  5e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3349  NLP/P60 protein  59.18 
 
 
372 aa  332  5e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal  0.0310886 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3298  NLP/P60 protein  58.57 
 
 
372 aa  332  7.000000000000001e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.154902 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4570  NLP/P60 protein  63.55 
 
 
363 aa  327  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3552  NLP/P60 protein  54.42 
 
 
378 aa  316  4e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12218  hypothetical protein  56.66 
 
 
393 aa  311  7.999999999999999e-84  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.327955  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3049  NLP/P60 protein  37.23 
 
 
347 aa  209  5e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2683  NLP/P60 protein  40.5 
 
 
348 aa  205  8e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468332  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  34.64 
 
 
332 aa  156  4e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1380  NLP/P60 protein  31.04 
 
 
343 aa  145  7.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6095  NLP/P60 protein  33.03 
 
 
366 aa  141  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1820  NLP/P60 protein  31.25 
 
 
330 aa  140  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  31.17 
 
 
340 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5355  hypothetical protein  51.08 
 
 
365 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5444  hypothetical protein  51.08 
 
 
365 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.421103 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2684  NLP/P60 protein  52.25 
 
 
232 aa  133  5e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.708971  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3235  NLP/P60 protein  38.03 
 
 
446 aa  132  6.999999999999999e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.177919  hitchhiker  0.000140663 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5734  hypothetical protein  48.12 
 
 
365 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.765847 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3050  NLP/P60 protein  43.26 
 
 
227 aa  126  4.0000000000000003e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0023  NLP/P60 protein  55 
 
 
164 aa  118  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.371839  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5924  hypothetical protein  49.74 
 
 
370 aa  117  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3124  NLP/P60 protein  30.28 
 
 
327 aa  114  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0606455  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3420  NLP/P60 protein  30.28 
 
 
342 aa  112  9e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4866  NLP/P60 protein  48.62 
 
 
350 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  42.34 
 
 
235 aa  108  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3237  NLP/P60 protein  52 
 
 
380 aa  107  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00058739  hitchhiker  0.000426733 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0505  hypothetical protein  44.14 
 
 
364 aa  107  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  25.37 
 
 
321 aa  106  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  27.3 
 
 
306 aa  106  6e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  45.37 
 
 
335 aa  104  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  28.65 
 
 
333 aa  102  7e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0917  NLP/P60 protein  40.83 
 
 
173 aa  102  8e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.693605  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6766  NLP/P60 protein  27.71 
 
 
350 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  45.26 
 
 
331 aa  99  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  38.05 
 
 
438 aa  98.2  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3144  NLP/P60 protein  26.69 
 
 
334 aa  97.1  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0327841  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1508  NLP/P60 protein  26.29 
 
 
348 aa  97.1  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  26.93 
 
 
337 aa  96.3  7e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1699  cell wall-associated hydrolase  43.22 
 
 
400 aa  95.1  1e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  3.26912e-16 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8103  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  45.8 
 
 
393 aa  95.5  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  41 
 
 
417 aa  95.1  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  41.35 
 
 
452 aa  93.2  5e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  25.25 
 
 
391 aa  92.8  7e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1030  NLP/P60 family secreted protein  43.88 
 
 
340 aa  92.4  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427961  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2136  NLP/P60 protein  41.8 
 
 
389 aa  92  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000118144  normal  0.895402 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2283  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  39.64 
 
 
222 aa  91.3  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0385  NLP/P60 protein  42.97 
 
 
360 aa  91.3  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0274  SagA protein  41.28 
 
 
432 aa  91.7  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0265  NlpC/P60 family protein  41.28 
 
 
432 aa  91.3  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.894472  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4498  NLP/P60 protein  41.67 
 
 
398 aa  90.9  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.0701003 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0423  NLP/P60  43.3 
 
 
459 aa  90.9  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10024  hypothetical protein  41.28 
 
 
281 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  38 
 
 
265 aa  90.1  6e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0243  NLP/P60 protein  43.4 
 
 
323 aa  90.1  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1348  NLP/P60 protein  40.91 
 
 
293 aa  89.4  9e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00998708  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  39.8 
 
 
162 aa  88.6  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5879  NLP/P60 protein  39 
 
 
333 aa  88.6  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.884921  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8562  NLP/P60 protein  41.75 
 
 
373 aa  88.6  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0614213  hitchhiker  0.0073147 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  40.17 
 
 
368 aa  87.8  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  40.98 
 
 
476 aa  88.2  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  36.62 
 
 
285 aa  87.8  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0055  NLP/P60 protein  38.83 
 
 
337 aa  87.4  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4506  NLP/P60 protein  40.16 
 
 
501 aa  87  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.918319  normal  0.0864721 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1783  NLP/P60 protein  40 
 
 
317 aa  87  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114987  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3579  NLP/P60 protein  28.66 
 
 
323 aa  87.4  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1816  NLP/P60 protein  37.5 
 
 
859 aa  86.3  6e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  42.11 
 
 
291 aa  86.7  6e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0570  NLP/P60 protein  41.75 
 
 
160 aa  86.7  6e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1908  NLP/P60 protein  43.81 
 
 
298 aa  85.9  8e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3145  NLP/P60 protein  41.35 
 
 
349 aa  86.3  8e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.120353  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5004  NLP/P60 protein  41.13 
 
 
347 aa  86.3  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.549544  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0479  NLP/P60  40.87 
 
 
225 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1506  NLP/P60 protein  42.86 
 
 
524 aa  85.5  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.483483  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5044  NLP/P60 family protein  40.87 
 
 
226 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.982871  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  36.84 
 
 
224 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  37.96 
 
 
388 aa  85.1  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  36.84 
 
 
223 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  36.84 
 
 
234 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000624175  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2630  NLP/P60 family protein  36.84 
 
 
234 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000022944  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  35.96 
 
 
224 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1982  NLP/P60 family protein  36.84 
 
 
234 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000770897  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1378  NLP/P60 family protein  36.84 
 
 
218 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0650104  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  36.84 
 
 
223 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  36.84 
 
 
223 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000524971  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2105  NLP/P60 family protein  36.84 
 
 
218 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000576333  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3208  NLP/P60 family protein  36.84 
 
 
218 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00320254  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  36.84 
 
 
234 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2543  NlpC/P60 domain-containing protein  36.84 
 
 
218 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241327  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4013  NLP/P60 protein  43.16 
 
 
236 aa  83.6  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1095  NLP/P60 protein  39.09 
 
 
371 aa  84  0.000000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00180307  hitchhiker  0.0000000000000270751 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>