66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_5280 on replicon NC_009339
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007961  Nham_4656  N-6 DNA methylase  33.97 
 
 
1700 aa  646  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4173  helicase domain-containing protein  34.82 
 
 
1575 aa  669  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4476  helicase-like  33.82 
 
 
1703 aa  639  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4973  helicase domain-containing protein  34.2 
 
 
1697 aa  645  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.664795 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5280  methyltransferase type 11  100 
 
 
1594 aa  3192  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00107926  unclonable  0.0024977 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5796  helicase domain-containing protein  72.73 
 
 
976 aa  1434  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00607211  hitchhiker  2.23463e-19 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4742  N-6 DNA methylase  32.94 
 
 
1702 aa  650  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2546  helicase, C-terminal  33.33 
 
 
1669 aa  652  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.26749 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2221  helicase, C-terminal  34.27 
 
 
1669 aa  655  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.332048 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5797  methyltransferase type 11  70.14 
 
 
577 aa  670  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.295406  hitchhiker  4.23938e-17 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4540  helicase domain protein  35.41 
 
 
1606 aa  682  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0264  hypothetical protein  34.59 
 
 
1748 aa  637  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3732  helicase domain-containing protein  33.08 
 
 
1693 aa  633  1e-180  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253895  normal  0.261793 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1578  helicase domain-containing protein  33.45 
 
 
1642 aa  631  1e-179  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.149983 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4316  methyltransferase type 11  32.54 
 
 
1516 aa  629  1e-178  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3177  helicase domain protein  29.13 
 
 
2077 aa  627  1e-178  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9541  helicase SNF2 family  33.9 
 
 
1701 aa  629  1e-178  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.398827  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9162  helicase SNF2 family  32.84 
 
 
1697 aa  625  1e-177  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4747  helicase domain-containing protein  37.74 
 
 
1925 aa  598  1e-169  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.099466  normal 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4295  helicase-like  31.12 
 
 
1726 aa  598  1e-169  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1824  helicase domain protein  28.12 
 
 
2098 aa  581  1e-164  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4914  helicase  31.5 
 
 
1706 aa  570  1e-161  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4893  DEAD-like helicase  34.18 
 
 
1417 aa  566  1e-160  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4933  helicase domain protein  32.32 
 
 
1956 aa  554  1e-156  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4259  helicase domain-containing protein  27.72 
 
 
2570 aa  486  1e-135  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0010  cpp14  25.73 
 
 
1932 aa  483  1e-135  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0437256  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a002  DNA methylase/helicase  24.89 
 
 
1934 aa  470  1e-130  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0978124  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4301  helicase, C-terminal  34.05 
 
 
1649 aa  466  1e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.182147 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0160  Cpp14  24.71 
 
 
2117 aa  427  1e-118  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.296407  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1280  SNF2 family protein  27.64 
 
 
2274 aa  414  1e-113  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.459246  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8083  helicase  30.49 
 
 
1211 aa  404  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0239915  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6722  Methyltransferase type 11  26.62 
 
 
1674 aa  360  1e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0870  SNF2-related protein  30.31 
 
 
2005 aa  324  1e-86  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2730  helicase domain protein  29.27 
 
 
1722 aa  323  2e-86  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.52816  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_002950  PG1500  hypothetical protein  29.11 
 
 
763 aa  206  2e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00538454 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4475  helicase domain-containing protein  27.29 
 
 
761 aa  182  5e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0387  putative DNA methylase  27.42 
 
 
766 aa  141  8e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8079  helicase SNF2 family  36.63 
 
 
470 aa  127  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.48311  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0847  hypothetical protein  31.98 
 
 
526 aa  105  7e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.03105e-05 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6184  helicase domain protein  42.28 
 
 
284 aa  85.1  9e-15  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0111751 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3075  DEAD-like helicase  25.07 
 
 
1328 aa  84.3  2e-14  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3018  helicase domain-containing protein  23.36 
 
 
678 aa  77.4  2e-12  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1466  SNF2 family helicase  21.21 
 
 
1379 aa  63.5  3e-08  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.942792  normal  0.0166873 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23220  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  26.4 
 
 
1110 aa  59.3  6e-07  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0796  hypothetical protein  29.65 
 
 
339 aa  57.4  2e-06  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11556  methyltransferase  31.15 
 
 
347 aa  52  8e-05  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5012  helicase domain protein  31.58 
 
 
1055 aa  51.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  23.71 
 
 
777 aa  50.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0104  SNF2-related protein  30.16 
 
 
1086 aa  50.4  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3846  helicase domain-containing protein  28.97 
 
 
1058 aa  50.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.064852 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0563  methyltransferase type 11  41.03 
 
 
270 aa  49.3  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.149497  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0554  modification methyltransferase  29.21 
 
 
423 aa  48.9  0.0008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359419  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1303  helicase domain-containing protein  30.51 
 
 
669 aa  48.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  26.95 
 
 
1162 aa  47.8  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0902  DEAD/DEAH box helicase-like  27.72 
 
 
1006 aa  47.4  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6261  Methyltransferase type 12  30.33 
 
 
298 aa  47.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2215  non-specific serine/threonine protein kinase  24.62 
 
 
1110 aa  47.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00386976 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0138  SNF2-related protein  30.67 
 
 
903 aa  46.6  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.021253  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0053  SNF2-related protein  25.74 
 
 
1141 aa  47  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2083  methyltransferase small  32.38 
 
 
204 aa  46.6  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0505  non-specific serine/threonine protein kinase  27.97 
 
 
617 aa  47  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  28.71 
 
 
919 aa  46.6  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3931  SNF2-related  23.65 
 
 
1178 aa  46.2  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1779  type I restriction-modification system specificity subunit  27.91 
 
 
799 aa  46.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2833  SNF2-related protein  24.58 
 
 
991 aa  45.8  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0279  hypothetical protein  34.68 
 
 
285 aa  45.1  0.01  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.313315  normal  0.062823 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>