270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_5272 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_5272  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 195 aa  380  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0969  TetR family transcriptional regulator  92.93 
 
 		 195 aa  330  8e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.610377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0746  TetR family transcriptional regulator  83.16 
 
 		 193 aa  294  5e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0760  TetR family transcriptional regulator  83.16 
 
 		 193 aa  294  5e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.650224  normal  0.287817 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0740  TetR family transcriptional regulator  82.63 
 
 		 193 aa  293  9e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.156291  normal  0.856133 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3793  regulatory protein TetR  39.38 
 
 		 207 aa  121  5e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0106  transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 		 227 aa  79.3  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5157  putative transcriptional regulator, TetR family  32.49 
 
 		 233 aa  75.1  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23435  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3271  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 201 aa  69.3  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.377871  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1317  regulatory protein TetR  28.26 
 
 		 232 aa  62.4  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1797  transcriptional regulator, TetR family  36.21 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000197435  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1490  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1512  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1488  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4373  transcriptional regulator, TetR family  29.12 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.335963  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1957  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3721  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6683  putative transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0648274  normal  0.237194 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  33.03 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0242  transcriptional regulator, TetR family  38.26 
 
 		 208 aa  54.7  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.156746 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0085  transcriptional regulator, TetR family  26.74 
 
 		 219 aa  54.7  0.0000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 231 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0686  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 197 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.863349  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0699  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 197 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.682068  normal  0.380548 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0679  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 197 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 192 aa  52.4  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4740  transcriptional regulator, TetR family  44.23 
 
 		 196 aa  51.6  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.609223  normal  0.406356 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6487  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2209  putative transcriptional regulator, TetR family  56.25 
 
 		 202 aa  50.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.594451  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  38.36 
 
 		 224 aa  50.1  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1824  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 224 aa  50.1  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.87921  normal  0.175095 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0827  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 179 aa  50.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.843783  normal  0.883408 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33280  transcriptional regulator  33.57 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.815894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 190 aa  49.3  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2233  TetR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 187 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.749736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0380  transcriptional regulator, TetR family  40.3 
 
 		 216 aa  48.9  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.50033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0059  TetR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 197 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8134  hypothetical protein  57.14 
 
 		 203 aa  48.9  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290445  normal  0.176944 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2581  regulatory protein, TetR  37.5 
 
 		 197 aa  48.9  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2776  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 197 aa  48.9  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.832438  hitchhiker  0.000578318 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3373  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 193 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.946701  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3435  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 193 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0970833  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25080  Transcriptional regulator, TetR family  44.23 
 
 		 191 aa  48.1  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3384  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 193 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2773  TetR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 191 aa  47.8  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.704113  normal  0.8573 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3452  transcriptional regulator, TetR family  48.08 
 
 		 227 aa  47.4  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000897017  hitchhiker  0.00397123 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3873  regulatory protein TetR  29.08 
 
 		 205 aa  47.4  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0855  TetR family transcriptional regulator  43.53 
 
 		 196 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179371  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1050  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 193 aa  47.4  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5902  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 213 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 190 aa  47.8  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1444  transcriptional regulator, TetR family  32.05 
 
 		 225 aa  47.8  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0101817  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4112  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 183 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0592835  normal  0.670519 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5162  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 193 aa  47  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.186575 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 200 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2010  TetR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 184 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 200 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1709  transcriptional regulator, TetR family  30.71 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.922562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6158  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 212 aa  46.6  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.488727  normal  0.104212 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30260  transcriptional regulator  31.53 
 
 		 400 aa  46.6  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.473296 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0792  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 212 aa  46.6  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3267  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 188 aa  47  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2056  TetR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 184 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1991  TetR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 184 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.645683  normal  0.738548 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3558  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 190 aa  45.8  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.410356 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3892  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 198 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2402  transcriptional regulator, TetR family  45.28 
 
 		 204 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1687  regulatory protein, TetR  46.67 
 
 		 266 aa  46.2  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13194  TetR/AcrR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 200 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.338711 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0523  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 184 aa  46.2  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3966  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 198 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal  0.497396 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0284  regulatory protein TetR  46.55 
 
 		 215 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3878  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 198 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.348506 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1288  TetR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 215 aa  46.2  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0315957  hitchhiker  0.00536276 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2227  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 180 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.192949  normal  0.218846 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 191 aa  45.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3530  regulatory protein TetR  40.74 
 
 		 235 aa  45.4  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.898869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1474  TetR family transcriptional regulator  47.73 
 
 		 188 aa  45.4  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0935  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 199 aa  45.4  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 194 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 210 aa  45.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3260  TetR family transcriptional regulator  51.16 
 
 		 213 aa  45.4  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.122521  normal  0.297775 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4158  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 205 aa  45.4  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000188504  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 194 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5181  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 190 aa  45.4  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.752009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  39 
 
 		 194 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7116  putative transcriptional regulator, TetR family  46.81 
 
 		 183 aa  45.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101346  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1634  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 209 aa  45.4  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.681802  normal  0.225704 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0942  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 208 aa  45.1  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0072348  normal  0.323203 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3771  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 223 aa  45.1  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4342  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 218 aa  45.1  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0243053 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 184 aa  45.1  0.0007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06672  hypothetical protein  40.98 
 
 		 198 aa  45.1  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10053  putative TetR transcriptional regulator  26.67 
 
 		 194 aa  45.1  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.205087  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2582  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 212 aa  44.7  0.0008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1098  hypothetical protein  35.79 
 
 		 216 aa  44.7  0.0008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.176641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1128  transcriptional regulator RutR  32.56 
 
 		 212 aa  44.7  0.0008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1250  transcriptional regulator RutR  32.56 
 
 		 212 aa  44.7  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1131  transcriptional regulator RutR  32.56 
 
 		 212 aa  44.7  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.33999  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0961  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 218 aa  44.7  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>