More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_5254 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_5254  geranylgeranyl reductase  100 
 
 		 416 aa  817    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0991  geranylgeranyl reductase  89.15 
 
 		 418 aa  676    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0765  geranylgeranyl reductase  80.05 
 
 		 406 aa  588  1e-167  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.616022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0784  geranylgeranyl reductase  79.8 
 
 		 406 aa  586  1e-166  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0770  geranylgeranyl reductase  79.37 
 
 		 400 aa  582  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10571  oxidoreductase  72.75 
 
 		 408 aa  538  9.999999999999999e-153  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.649109  normal  0.274108 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0948  geranylgeranyl reductase  63.05 
 
 		 417 aa  459  9.999999999999999e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.3862  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0714  geranylgeranyl reductase  60.26 
 
 		 415 aa  442  1e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1099  geranylgeranyl reductase  58.39 
 
 		 435 aa  421  1e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.997696  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0362  geranylgeranyl reductase  37.44 
 
 		 436 aa  237  3e-61  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.495463  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  37.78 
 
 		 418 aa  227  3e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  39.11 
 
 		 445 aa  224  2e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  33.65 
 
 		 434 aa  215  9e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  34.43 
 
 		 435 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  36.19 
 
 		 424 aa  213  5.999999999999999e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2717  geranylgeranyl reductase  36.21 
 
 		 443 aa  209  6e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.593407 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  34.7 
 
 		 431 aa  209  8e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  35.24 
 
 		 434 aa  209  1e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  34.86 
 
 		 426 aa  207  3e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  35.59 
 
 		 423 aa  204  2e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  36.41 
 
 		 431 aa  204  3e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  32.93 
 
 		 423 aa  203  4e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  37.23 
 
 		 419 aa  202  8e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  33.57 
 
 		 430 aa  200  3e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  35.37 
 
 		 423 aa  200  5e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2826  geranylgeranyl reductase  35.9 
 
 		 443 aa  199  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0858816 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  35.05 
 
 		 430 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  34.16 
 
 		 425 aa  196  9e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3131  geranylgeranyl reductase  35.73 
 
 		 444 aa  196  9e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6095  geranylgeranyl reductase  34.38 
 
 		 440 aa  192  6e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0614228 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  31.5 
 
 		 457 aa  184  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17730  geranylgeranyl reductase family protein  34.35 
 
 		 466 aa  178  1e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07370  geranylgeranyl reductase family protein  33.18 
 
 		 431 aa  179  1e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0284516 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03150  geranylgeranyl reductase family protein  32.2 
 
 		 424 aa  174  1.9999999999999998e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.992088  normal  0.897834 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2055  geranylgeranyl reductase  33.79 
 
 		 393 aa  157  4e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  35.87 
 
 		 393 aa  156  8e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0311  hypothetical protein  38.54 
 
 		 409 aa  150  6e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.172492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  36.34 
 
 		 413 aa  149  7e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1807  geranylgeranyl reductase  34.02 
 
 		 393 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.622254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1826  geranylgeranyl reductase  34.02 
 
 		 393 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.253785  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1873  geranylgeranyl reductase  34.02 
 
 		 393 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.700646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1294  geranylgeranyl reductase  35.51 
 
 		 420 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.730528  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1343  geranylgeranyl reductase  35.23 
 
 		 411 aa  128  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.263408 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  30.03 
 
 		 384 aa  124  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  32.73 
 
 		 398 aa  124  4e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5969  geranylgeranyl reductase  34.29 
 
 		 409 aa  117  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.365894  normal  0.508891 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  32.87 
 
 		 375 aa  117  3e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  31.72 
 
 		 398 aa  115  2.0000000000000002e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0390  monooxygenase FAD-binding  33.53 
 
 		 425 aa  114  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0398453 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  26.32 
 
 		 376 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0830  geranylgeranyl reductase  26.03 
 
 		 415 aa  106  7e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1602  hypothetical protein  29.15 
 
 		 387 aa  104  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  28.32 
 
 		 389 aa  103  8e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6208  monooxygenase FAD-binding protein  30.48 
 
 		 403 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00171157  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  26.72 
 
 		 382 aa  101  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0164  putative electron transfer oxidoreductase  34.3 
 
 		 420 aa  99.4  9e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.762503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1161  geranylgeranyl reductase  35.67 
 
 		 429 aa  99  1e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0327  geranylgeranyl reductase  36.59 
 
 		 373 aa  97.1  6e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.252383  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  29.19 
 
 		 378 aa  95.5  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1062  geranylgeranyl reductase  29.49 
 
 		 385 aa  94.7  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  26.95 
 
 		 398 aa  94.4  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1376  dehydrogenase, flavoprotein containing  29.77 
 
 		 384 aa  94  5e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000125722  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0660  geranylgeranyl reductase  31.21 
 
 		 406 aa  92.4  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0877902 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2388  flavoprotein-containing dehydrogenase  29.06 
 
 		 414 aa  90.1  7e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0523144  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1193  geranylgeranyl reductase  28.92 
 
 		 362 aa  86.7  6e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0917874  hitchhiker  0.0000705466 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  27.47 
 
 		 402 aa  85.9  0.000000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0879  geranylgeranyl reductase  25.69 
 
 		 370 aa  86.3  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0808  geranylgeranyl reductase  32.17 
 
 		 406 aa  85.5  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.967973  hitchhiker  0.000310699 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  32.54 
 
 		 400 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0388  geranylgeranyl reductase  32.34 
 
 		 362 aa  84.7  0.000000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.1431 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2189  geranylgeranyl reductase  28.39 
 
 		 383 aa  83.6  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1462  geranylgeranyl reductase  29.16 
 
 		 384 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.36043  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0862  geranylgeranyl reductase  33.88 
 
 		 387 aa  81.6  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0133  geranylgeranyl reductase  30.91 
 
 		 368 aa  81.3  0.00000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2702  geranylgeranyl reductase  28.91 
 
 		 401 aa  80.9  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  26.89 
 
 		 390 aa  80.5  0.00000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  26.36 
 
 		 390 aa  80.1  0.00000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0342  tryptophan halogenase  24.32 
 
 		 422 aa  79.7  0.00000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  25.66 
 
 		 391 aa  79.7  0.00000000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3422  geranylgeranyl reductase  27.99 
 
 		 407 aa  79  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.351163 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0387  geranylgeranyl reductase  25.62 
 
 		 403 aa  79.3  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2824  geranylgeranyl reductase  28.48 
 
 		 379 aa  79.3  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0436  FAD dependent oxidoreductase  26.3 
 
 		 429 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  28.39 
 
 		 395 aa  78.6  0.0000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1355  geranylgeranyl reductase  29.63 
 
 		 358 aa  78.2  0.0000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0520333 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3777  geranylgeranyl reductase  26.53 
 
 		 368 aa  77.4  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1119  geranylgeranyl reductase  32 
 
 		 367 aa  76.6  0.0000000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.920793 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2265  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  25.53 
 
 		 433 aa  76.6  0.0000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00453186  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  26.35 
 
 		 406 aa  76.3  0.0000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3702  monooxygenase FAD-binding  25.85 
 
 		 419 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.378943  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4779  monooxygenase FAD-binding  25.85 
 
 		 419 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3686  monooxygenase, FAD-binding protein  24.93 
 
 		 435 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0337  monooxygenase FAD-binding  25.66 
 
 		 429 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0340  monooxygenase FAD-binding  25.66 
 
 		 429 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.131128 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0708  monooxygenase FAD-binding  26.25 
 
 		 416 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0331  monooxygenase, FAD-binding  24.93 
 
 		 435 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0330  monooxygenase FAD-binding  25.43 
 
 		 429 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0277  geranylgeranyl hydrogenase  33.54 
 
 		 394 aa  74.3  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  26.6 
 
 		 408 aa  74.3  0.000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1920  geranylgeranyl reductase  33.54 
 
 		 394 aa  74.3  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.571775 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>