228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_5248 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_5248  putative nucleotide-binding protein  100 
 
 
163 aa  324  3e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0997  putative nucleotide-binding protein  88.96 
 
 
163 aa  294  4e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.446557  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0777  putative nucleotide-binding protein  85.28 
 
 
179 aa  284  4e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0791  putative nucleotide-binding protein  85.28 
 
 
179 aa  284  4e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.20666 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0772  putative nucleotide-binding protein  85.28 
 
 
179 aa  284  4e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.596495  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10576  putative nucleotide-binding protein  82.21 
 
 
163 aa  275  2e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.703775 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1104  protein of unknown function DUF520  73.62 
 
 
163 aa  248  3e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.237734  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0736  protein of unknown function DUF520  71.78 
 
 
163 aa  247  5e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4534  protein of unknown function DUF520  71.78 
 
 
163 aa  245  2e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.452055  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1006  protein of unknown function DUF520  70.55 
 
 
163 aa  241  3e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0564  putative nucleotide-binding protein  67.48 
 
 
163 aa  230  7.000000000000001e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6653  putative nucleotide-binding protein  67.48 
 
 
163 aa  229  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.59339  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5091  protein of unknown function DUF520  68.1 
 
 
165 aa  227  5e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.413017  normal  0.812219 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03430  hypothetical protein  65.64 
 
 
163 aa  227  5e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.405869  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0332  hypothetical protein  66.26 
 
 
163 aa  227  6e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.408979  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0508  protein of unknown function DUF520  64.85 
 
 
164 aa  221  4.9999999999999996e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0858  protein of unknown function DUF520  66.05 
 
 
163 aa  220  7e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.83182  hitchhiker  0.00457625 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2696  protein of unknown function DUF520  63.41 
 
 
165 aa  220  8e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3188  protein of unknown function DUF520  63.64 
 
 
167 aa  219  9.999999999999999e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.171819  normal  0.0244342 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0561  protein of unknown function DUF520  64.24 
 
 
165 aa  218  1.9999999999999999e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.637028  normal  0.064143 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0409  putative nucleotide-binding protein  64.81 
 
 
164 aa  218  3e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.67309 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4374  protein of unknown function DUF520  65.64 
 
 
162 aa  217  3.9999999999999997e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0477  putative nucleotide-binding protein  64.81 
 
 
164 aa  217  5e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.132383 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2672  putative nucleotide-binding protein  61.96 
 
 
165 aa  212  1.9999999999999998e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0662  putative nucleotide-binding protein  61.11 
 
 
163 aa  212  1.9999999999999998e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103714  normal  0.990048 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0959  hypothetical protein  61.96 
 
 
164 aa  212  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.486251  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21450  hypothetical protein  61.96 
 
 
162 aa  211  2.9999999999999995e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.000199035  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0690  nucleotide-binding protein  60.98 
 
 
164 aa  209  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.310071 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07620  hypothetical protein  63.12 
 
 
159 aa  209  1e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0480829 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0286  putative nucleotide-binding protein  57.67 
 
 
163 aa  201  4e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6074  putative nucleotide-binding protein  56.44 
 
 
162 aa  187  5.999999999999999e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.21358 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17650  putative nucleotide-binding protein  58.64 
 
 
162 aa  187  5.999999999999999e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.839683  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21350  hypothetical protein  57.83 
 
 
167 aa  186  2e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0391235  hitchhiker  0.000130122 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3073  putative nucleotide-binding protein  58.02 
 
 
163 aa  184  4e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.760306  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2778  putative nucleotide-binding protein  57.41 
 
 
163 aa  183  7e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00451374 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0558  putative nucleotide-binding protein  54.6 
 
 
162 aa  182  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1469  protein of unknown function DUF520  48.77 
 
 
164 aa  150  8.999999999999999e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0438378  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3127  putative nucleotide-binding protein  46.91 
 
 
163 aa  140  9e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.266318  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0379  protein of unknown function DUF520  45.96 
 
 
164 aa  138  3e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0120708  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3093  putative nucleotide-binding protein  45.62 
 
 
161 aa  137  7e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000935771  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0033  putative nucleotide-binding protein  46.88 
 
 
161 aa  136  1e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1927  putative nucleotide-binding protein  43.21 
 
 
166 aa  134  6.0000000000000005e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0682804  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1036  putative nucleotide-binding protein  45.96 
 
 
163 aa  133  8e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.448426  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3198  putative nucleotide-binding protein  45.62 
 
 
161 aa  133  9e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1539  putative nucleotide-binding protein  48.15 
 
 
163 aa  133  9e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4047  hypothetical protein  45.51 
 
 
164 aa  133  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0094  putative nucleotide-binding protein  43.12 
 
 
162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0537  putative nucleotide-binding protein  47.83 
 
 
163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.323651  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0476  putative nucleotide-binding protein  47.83 
 
 
163 aa  131  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0482  putative nucleotide-binding protein  47.83 
 
 
163 aa  131  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.101201 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0474  putative nucleotide-binding protein  47.83 
 
 
163 aa  131  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0495  putative nucleotide-binding protein  47.83 
 
 
163 aa  131  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0533  putative nucleotide-binding protein  44.03 
 
 
160 aa  131  3.9999999999999996e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1084  putative nucleotide-binding protein  47.2 
 
 
163 aa  131  3.9999999999999996e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.235952  hitchhiker  0.00000304548 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0893  putative nucleotide-binding protein  47.83 
 
 
163 aa  130  6e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3275  putative nucleotide-binding protein  45.34 
 
 
163 aa  130  6.999999999999999e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3204  putative nucleotide-binding protein  44.38 
 
 
161 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118693  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10690  hypothetical protein  45.4 
 
 
165 aa  129  1.0000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0100552  unclonable  0.00000000113677 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2028  putative nucleotide-binding protein  43.9 
 
 
164 aa  130  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0717  putative nucleotide-binding protein  46.25 
 
 
161 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000115495  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0876  putative nucleotide-binding protein  43.21 
 
 
163 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1273  putative nucleotide-binding protein  43.21 
 
 
163 aa  129  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.152949  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1081  putative nucleotide-binding protein  43.21 
 
 
163 aa  129  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1064  putative nucleotide-binding protein  43.21 
 
 
163 aa  129  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1059  putative nucleotide-binding protein  43.21 
 
 
163 aa  129  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1166  putative nucleotide-binding protein  43.21 
 
 
163 aa  129  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1240  putative nucleotide-binding protein  43.21 
 
 
163 aa  129  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1318  putative nucleotide-binding protein  43.21 
 
 
163 aa  129  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106646  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0095  putative nucleotide-binding protein  41.25 
 
 
162 aa  128  3e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.615818  normal  0.24721 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3247  putative nucleotide-binding protein  47.2 
 
 
163 aa  128  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3104  putative nucleotide-binding protein  47.2 
 
 
163 aa  128  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2888  putative nucleotide-binding protein  46.58 
 
 
163 aa  128  3e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3067  putative nucleotide-binding protein  47.2 
 
 
163 aa  128  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1213  putative nucleotide-binding protein  43.21 
 
 
163 aa  128  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2033  hypothetical protein  40.88 
 
 
161 aa  128  4.0000000000000003e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4128  putative nucleotide-binding protein  43.21 
 
 
163 aa  127  6e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0402113  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0619  putative nucleotide-binding protein  43.75 
 
 
161 aa  127  6e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0491781  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3206  putative nucleotide-binding protein  45 
 
 
161 aa  127  8.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000932382  hitchhiker  2.6233800000000004e-18 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0711  putative nucleotide-binding protein  46.3 
 
 
163 aa  127  9.000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000320146  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1098  putative nucleotide-binding protein  42.14 
 
 
160 aa  126  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.157658  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0633  putative nucleotide-binding protein  43.12 
 
 
161 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.897e-30 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2261  putative nucleotide-binding protein  40.88 
 
 
160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.299234  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3079  putative nucleotide-binding protein  45.96 
 
 
163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.421568  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00374  nucleotide-binding protein  44.79 
 
 
163 aa  125  3e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3183  protein of unknown function DUF520  44.79 
 
 
163 aa  125  3e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.387868  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0498  putative nucleotide-binding protein  44.79 
 
 
163 aa  125  3e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00378  hypothetical protein  44.79 
 
 
163 aa  125  3e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0462  putative nucleotide-binding protein  44.79 
 
 
163 aa  125  3e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3207  putative nucleotide-binding protein  44.79 
 
 
163 aa  125  3e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000536011 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0348  putative nucleotide-binding protein  44.79 
 
 
163 aa  125  3e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0510  putative nucleotide-binding protein  44.79 
 
 
163 aa  125  3e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.781965  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0458  putative nucleotide-binding protein  44.79 
 
 
163 aa  125  3e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2254  putative nucleotide-binding protein  43.4 
 
 
160 aa  124  5e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000945037  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0136  hypothetical protein  41.82 
 
 
164 aa  124  6e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0112  putative nucleotide-binding protein  42.86 
 
 
162 aa  124  6e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.609186  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2743  putative nucleotide-binding protein  42.86 
 
 
163 aa  124  7e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3111  putative nucleotide-binding protein  41.98 
 
 
165 aa  123  9e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000138147  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1061  putative nucleotide-binding protein  41.98 
 
 
163 aa  122  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000318846  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4311  putative nucleotide-binding protein  42.5 
 
 
160 aa  122  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.57751  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1091  protein of unknown function DUF520  40.62 
 
 
161 aa  122  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>