70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_5176 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_5176  hypothetical protein  100 
 
 
551 aa  1109    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.798305 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0342  NERD domain protein  68.8 
 
 
550 aa  738    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0844  hypothetical protein  77.82 
 
 
563 aa  890    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1146  hypothetical protein  83.82 
 
 
551 aa  927    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0827  hypothetical protein  77.82 
 
 
563 aa  890    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0847  hypothetical protein  78.36 
 
 
549 aa  898    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20557  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3317  NERD domain protein  45.08 
 
 
555 aa  358  9.999999999999999e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2424  NERD domain protein  31.41 
 
 
559 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000438453  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1680  NERD domain-containing protein  26.02 
 
 
568 aa  167  5e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0729  hypothetical protein  29.66 
 
 
574 aa  167  5.9999999999999996e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0239  NERD domain-containing protein  29.64 
 
 
579 aa  150  8e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1060  NERD domain protein  28.9 
 
 
527 aa  108  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0134281 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1416  NERD domain protein  27.09 
 
 
578 aa  99.8  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.251198 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4099  NERD domain-contain protein  26.83 
 
 
606 aa  99.8  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1706  NERD domain protein  28.05 
 
 
541 aa  92  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.516506  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4576  AAA ATPase  25.2 
 
 
533 aa  86.3  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0285  NERD domain protein  28.49 
 
 
540 aa  86.3  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0845  hypothetical protein  24.95 
 
 
544 aa  84.3  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0545753  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0515  hypothetical protein  28.02 
 
 
558 aa  75.9  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0189041  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0076  DNA helicase II  24.83 
 
 
632 aa  75.9  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4939  DNA helicase II  22.95 
 
 
613 aa  72  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.891198  normal  0.619317 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1463  hypothetical protein  27.11 
 
 
626 aa  72  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1159  hypothetical protein  28.05 
 
 
555 aa  70.5  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.127687 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5636  NERD domain-containing protein  25.86 
 
 
557 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0748755  normal  0.450463 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4052  hypothetical protein  26.12 
 
 
555 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.890756 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2752  hypothetical protein  32.85 
 
 
324 aa  68.6  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.172027 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0422  hypothetical protein  27.86 
 
 
554 aa  67.8  0.0000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4510  NERD domain-containing protein  25.21 
 
 
555 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1108  hypothetical protein  23.25 
 
 
593 aa  67.4  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.290007  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2959  NERD domain-containing protein  25.38 
 
 
625 aa  65.9  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4896  NERD domain protein  24.83 
 
 
564 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0805838 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1094  hypothetical protein  22.65 
 
 
588 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4026  NERD domain-containing protein  27.83 
 
 
555 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1359  hypothetical protein  25.07 
 
 
554 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3351  NERD domain-containing protein  25.29 
 
 
557 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.164276  hitchhiker  0.000169391 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4664  hypothetical protein  24.79 
 
 
557 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220049  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3704  hypothetical protein  24.79 
 
 
557 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.064418  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2536  hypothetical protein  25.07 
 
 
554 aa  63.9  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1020  hypothetical protein  25.07 
 
 
554 aa  63.9  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.44837  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1281  hypothetical protein  25.07 
 
 
554 aa  63.9  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0983409  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0546  hypothetical protein  25.07 
 
 
554 aa  63.9  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.946495  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0275  hypothetical protein  25.07 
 
 
554 aa  63.9  0.000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0985894  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1296  hypothetical protein  25.07 
 
 
669 aa  63.9  0.000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0263973  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4005  hypothetical protein  23.25 
 
 
610 aa  63.5  0.000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.467683  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4891  hypothetical protein  20.86 
 
 
616 aa  62  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.412698  normal  0.98473 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3974  hypothetical protein  26.37 
 
 
607 aa  62.4  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.335001 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2139  hypothetical protein  30.12 
 
 
617 aa  62  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0807  hypothetical protein  27.36 
 
 
616 aa  62  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1774  hypothetical protein  24.45 
 
 
573 aa  62  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245885  hitchhiker  0.0000023235 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3682  NERD domain-containing protein  25.06 
 
 
601 aa  60.1  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.023391  normal  0.021571 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5264  hypothetical protein  25.45 
 
 
617 aa  60.1  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4619  hypothetical protein  25.61 
 
 
615 aa  57.8  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.502486 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2302  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  24.45 
 
 
607 aa  56.6  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0738  hypothetical protein  24.12 
 
 
631 aa  55.5  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1772  DNA helicase II  23.72 
 
 
619 aa  55.1  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02993  hypothetical protein  24.79 
 
 
612 aa  54.7  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000145899  normal  0.116581 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6025  UvrD/REP helicase  28.73 
 
 
737 aa  53.5  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39740  DNA helicase  24.8 
 
 
615 aa  52  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0820371  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1246  UvrD/REP helicase  28.06 
 
 
662 aa  49.7  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.176029  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0351  hypothetical protein  23.73 
 
 
388 aa  48.9  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0328547  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3287  NERD domain protein  22.44 
 
 
197 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2836  NERD domain protein  22.44 
 
 
197 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.830296 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5380  DNA helicase II  25.99 
 
 
619 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1299  NERD domain protein  29.37 
 
 
593 aa  47.8  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3349  hypothetical protein  28.29 
 
 
673 aa  47.4  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.038988  normal  0.770189 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2859  UvrD/REP helicase  27.31 
 
 
690 aa  46.6  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2329  superfamily protein I DNA/RNA helicase  27.76 
 
 
679 aa  45.8  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0809  LexA repressor  21.8 
 
 
815 aa  45.1  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.642499  hitchhiker  0.0000861607 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0359  hypothetical protein  23.33 
 
 
827 aa  44.7  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000526889  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0467  UvrD/REP helicase  27.31 
 
 
603 aa  44.3  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.82885  normal  0.469599 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>