270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_5122 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1105  ribosomal protein L33  100 
 
 		 55 aa  115  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.184146  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5122  50S ribosomal protein L33  100 
 
 		 55 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1229  50S ribosomal protein L33  100 
 
 		 55 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384143 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10647  50S ribosomal protein L33  94.55 
 
 		 55 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0308205 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0737  ribosomal protein L33  94.55 
 
 		 55 aa  112  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0917  50S ribosomal protein L33  94.55 
 
 		 55 aa  111  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.166637  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0934  50S ribosomal protein L33  94.55 
 
 		 55 aa  111  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0945  50S ribosomal protein L33  94.55 
 
 		 55 aa  110  5e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03530  LSU ribosomal protein L33P  86.79 
 
 		 54 aa  102  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.748842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0563  50S ribosomal protein L33  81.13 
 
 		 54 aa  99.4  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1008  ribosomal protein L33  84.91 
 
 		 54 aa  98.2  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6648  ribosomal protein L33  84.91 
 
 		 54 aa  98.2  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0287  50S ribosomal protein L33P  76.36 
 
 		 55 aa  97.4  6e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0740  ribosomal protein L33  77.36 
 
 		 54 aa  94  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.174089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6067  50S ribosomal protein L33  75.47 
 
 		 54 aa  93.6  8e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.412873  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0356  50S ribosomal protein L33  77.36 
 
 		 54 aa  93.2  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.26663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0598  ribosomal protein L33  79.63 
 
 		 56 aa  92.4  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.761553  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07670  LSU ribosomal protein L33P  78.57 
 
 		 56 aa  90.9  5e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.797929  normal  0.041948 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4364  ribosomal protein L33  75.47 
 
 		 54 aa  90.5  7e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6366  50S ribosomal protein L33  77.36 
 
 		 56 aa  90.5  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.747023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0663  ribosomal protein L33  72.73 
 
 		 55 aa  89.7  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.023048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3942  50S ribosomal protein L33  72.73 
 
 		 55 aa  88.6  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5101  ribosomal protein L33  75.47 
 
 		 54 aa  88.6  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.299786  normal  0.585671 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2667  50S ribosomal protein L33  71.7 
 
 		 54 aa  88.6  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0668  50S ribosomal protein L33  76.79 
 
 		 56 aa  88.2  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0319237  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4334  50S ribosomal protein L33  72.73 
 
 		 55 aa  88.6  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21410  LSU ribosomal protein L33P  76.79 
 
 		 56 aa  88.6  3e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00000944878  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1680  50S ribosomal protein L33  70.91 
 
 		 55 aa  87  8e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3184  ribosomal protein L33  73.21 
 
 		 56 aa  85.9  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0237332 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21200  LSU ribosomal protein L33P  75 
 
 		 56 aa  85.1  3e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4531  ribosomal protein L33  71.7 
 
 		 54 aa  84.7  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2694  ribosomal protein L33  75 
 
 		 56 aa  84.3  6e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0239  ribosomal protein L33  69.64 
 
 		 56 aa  83.6  9e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0897  50S ribosomal protein L33  69.81 
 
 		 54 aa  79.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.178264  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2169  50S ribosomal protein L33P  63.27 
 
 		 49 aa  70.9  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.100769  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2727  ribosomal protein L33  61.22 
 
 		 49 aa  70.1  0.000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.383463  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2475  50S ribosomal protein L33P  59.18 
 
 		 49 aa  68.6  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000110121  decreased coverage  0.000947094 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1377  ribosomal protein L33  61.22 
 
 		 49 aa  67.8  0.00000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000000360963  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0208  ribosomal protein L33  59.18 
 
 		 78 aa  67.4  0.00000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000103911  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1177  ribosomal protein L33  57.14 
 
 		 49 aa  65.5  0.0000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000000979821  unclonable  0.0000000170129 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09700  LSU ribosomal protein L33P  57.14 
 
 		 49 aa  65.1  0.0000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000620955  hitchhiker  0.00000511825 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2717  50S ribosomal protein L33  61.22 
 
 		 49 aa  65.5  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00191424  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0305  ribosomal protein L33  61.22 
 
 		 49 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000123978  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1183  50S ribosomal protein L33  57.69 
 
 		 54 aa  64.3  0.0000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00129055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1320  ribosomal protein L33  54 
 
 		 54 aa  64.3  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.440087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1826  ribosomal protein L33  58.33 
 
 		 54 aa  64.3  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2385  ribosomal protein L33  57.14 
 
 		 49 aa  63.5  0.0000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.60269  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2132  ribosomal protein L33  57.14 
 
 		 49 aa  62.8  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0045011  normal  0.563046 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0403  50S ribosomal protein L33  57.14 
 
 		 49 aa  63.2  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.1461e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0996  50S ribosomal protein L33  49.09 
 
 		 55 aa  62.4  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000243211  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0887  50S ribosomal protein L33  49.09 
 
 		 55 aa  62.8  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000422402  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_868  ribosomal protein L33  49.09 
 
 		 55 aa  62.8  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000132161  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2415  50S ribosomal protein L33  54 
 
 		 52 aa  62.8  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000000282582  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08660  LSU ribosomal protein L33P  55.1 
 
 		 49 aa  62.4  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000650228  hitchhiker  0.0000000147794 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0200  50S ribosomal protein L33  55.1 
 
 		 49 aa  62.4  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311808  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1932  ribosomal protein L33  55.1 
 
 		 49 aa  61.6  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000219423  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0904  50S ribosomal protein L33  53.06 
 
 		 49 aa  60.8  0.000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2729  50S ribosomal protein L33  53.06 
 
 		 49 aa  60.8  0.000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000000221707  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1396  50S ribosomal protein L33  51.02 
 
 		 49 aa  60.1  0.000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000827111  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1423  50S ribosomal protein L33  51.02 
 
 		 49 aa  60.1  0.000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000766493  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0383  ribosomal protein L33  54.17 
 
 		 54 aa  59.7  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.192931  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0178  LSU ribosomal protein L33P  55.1 
 
 		 49 aa  59.7  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000000816698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0271  50S ribosomal protein L33  55.1 
 
 		 49 aa  60.1  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000825725  hitchhiker  0.00763041 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3696  ribosomal protein L33  57.14 
 
 		 49 aa  60.1  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000370683  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf336  50S ribosomal protein L33  52.08 
 
 		 50 aa  58.9  0.00000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0709942  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2689  ribosomal protein L33  54 
 
 		 54 aa  58.9  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00155848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3067  50S ribosomal protein L33  53.06 
 
 		 49 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.212936  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1534  50S ribosomal protein L33  49.06 
 
 		 54 aa  58.9  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000298593  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0187  50S ribosomal protein L33  55.1 
 
 		 49 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1122  50S ribosomal protein L33  50 
 
 		 64 aa  57.8  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.529669  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4424  50S ribosomal protein L33  51.02 
 
 		 49 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4240  50S ribosomal protein L33  51.02 
 
 		 49 aa  57.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4462  50S ribosomal protein L33  51.02 
 
 		 49 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.228819  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4570  50S ribosomal protein L33  51.02 
 
 		 49 aa  57.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4475  50S ribosomal protein L33  51.02 
 
 		 49 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4421  50S ribosomal protein L33  51.02 
 
 		 49 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0775  50S ribosomal protein L33  51.02 
 
 		 49 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.089249 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1609  50S ribosomal protein L33  51.02 
 
 		 49 aa  57  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.353079  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1643  50S ribosomal protein L33  51.02 
 
 		 49 aa  57  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.274003  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1116  50S ribosomal protein L33  48.98 
 
 		 49 aa  56.6  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01020  ribosomal protein L33  47.27 
 
 		 55 aa  56.6  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.1928e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2870  50S ribosomal protein L33  51.02 
 
 		 49 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0631761  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2904  50S ribosomal protein L33  45.45 
 
 		 55 aa  55.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.833747  normal  0.633116 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2854  50S ribosomal protein L33  45.45 
 
 		 55 aa  55.5  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.584525  normal  0.509046 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1629  50S ribosomal protein L33  53.06 
 
 		 49 aa  55.5  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0305  50S ribosomal protein L33  53.19 
 
 		 49 aa  55.8  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000647748  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1951  ribosomal protein L33  49.06 
 
 		 58 aa  55.1  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000000159206  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3342  50S ribosomal protein L33  52.08 
 
 		 50 aa  54.7  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00145467 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0919  50S ribosomal protein L33  52.08 
 
 		 50 aa  54.7  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3920  50S ribosomal protein L33  47.27 
 
 		 55 aa  55.1  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1542  50S ribosomal protein L33  48.98 
 
 		 49 aa  55.1  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.336096  normal  0.759054 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0089  50S ribosomal protein L33  53.06 
 
 		 48 aa  54.7  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000121403  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0251  50S ribosomal protein L33  55.32 
 
 		 49 aa  54.3  0.0000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000192587  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0226  50S ribosomal protein L33  45.45 
 
 		 55 aa  54.7  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.289129  hitchhiker  0.00105834 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0833  50S ribosomal protein L33P  46.94 
 
 		 51 aa  54.3  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000169832  normal  0.0907475 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2994  50S ribosomal protein L33  51.02 
 
 		 49 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3722  50S ribosomal protein L33  45.45 
 
 		 55 aa  53.9  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0446  50S ribosomal protein L33  51.02 
 
 		 49 aa  53.9  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0286  50S ribosomal protein L33  45.45 
 
 		 55 aa  53.5  0.0000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.184896  normal  0.0139935 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0606  ribosomal protein L33  43.64 
 
 		 55 aa  53.5  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>