More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_5078 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_5078  30S ribosomal protein S12  100 
 
 		 124 aa  248  2e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.621439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1279  30S ribosomal protein S12  100 
 
 		 124 aa  248  2e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.236845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0984  30S ribosomal protein S12  98.39 
 
 		 124 aa  244  2e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1012  30S ribosomal protein S12  98.39 
 
 		 124 aa  244  2e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.411543 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1002  30S ribosomal protein S12  98.39 
 
 		 124 aa  244  2e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.612737  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3469  ribosomal protein S12  96.75 
 
 		 124 aa  240  6e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.329977  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10696  30S ribosomal protein S12  96.75 
 
 		 124 aa  239  1e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.902005 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6619  30S ribosomal protein S12  95.16 
 
 		 124 aa  238  1e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3806  ribosomal protein S12  95.87 
 
 		 123 aa  233  5.0000000000000005e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.800192  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03930  30S ribosomal protein S12  91.94 
 
 		 124 aa  233  7e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4512  ribosomal protein S12  92.74 
 
 		 124 aa  232  1.0000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1115  ribosomal protein S12  91.94 
 
 		 124 aa  230  5e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0682  30S ribosomal protein S12  91.13 
 
 		 124 aa  229  8.000000000000001e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3925  30S ribosomal protein S12  91.13 
 
 		 124 aa  228  3e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4326  ribosomal protein S12  91.06 
 
 		 139 aa  226  1e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0921  30S ribosomal protein S12  88.71 
 
 		 124 aa  224  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0301  30S ribosomal protein S12  90.32 
 
 		 124 aa  223  6e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000933242 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29810  SSU ribosomal protein S12P  88.71 
 
 		 124 aa  223  8e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.378005 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5119  ribosomal protein S12  88.62 
 
 		 123 aa  223  9e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.455087 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0582  ribosomal protein S12  88.71 
 
 		 124 aa  222  1e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.114557  normal  0.106054 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6054  30S ribosomal protein S12  88.62 
 
 		 124 aa  223  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.234272 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0577  30S ribosomal protein S12  88.62 
 
 		 124 aa  223  1e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3928  30S ribosomal protein S12  87.9 
 
 		 124 aa  221  3e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.418026  normal  0.366347 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4320  30S ribosomal protein S12  87.9 
 
 		 124 aa  221  3e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1081  ribosomal protein S12  87.8 
 
 		 123 aa  220  4.9999999999999996e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.453767 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1180  30S ribosomal protein S12  87.8 
 
 		 124 aa  220  4.9999999999999996e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275804  normal  0.0539297 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2651  30S ribosomal protein S12  86.99 
 
 		 123 aa  219  8e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.31223  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0622  ribosomal protein S12  87.1 
 
 		 124 aa  218  3e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20930  SSU ribosomal protein S12P  86.99 
 
 		 124 aa  217  3.9999999999999997e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.6321  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2664  ribosomal protein S12  88.43 
 
 		 122 aa  215  1e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0557  30S ribosomal protein S12  86.29 
 
 		 124 aa  215  1e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.563691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0393  ribosomal protein S12  87.8 
 
 		 123 aa  214  2.9999999999999998e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.844601  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3148  ribosomal protein S12  84.55 
 
 		 124 aa  214  4e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.914306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2695  30S ribosomal protein S12  86.18 
 
 		 124 aa  213  9e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.281072 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2982  30S ribosomal protein S12  86.18 
 
 		 124 aa  213  9e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.80538  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17230  30S ribosomal protein S12  83.74 
 
 		 124 aa  211  2.9999999999999995e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23900  SSU ribosomal protein S12P  82.11 
 
 		 124 aa  208  2e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0239193  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1098  ribosomal protein S12  84.55 
 
 		 123 aa  208  2e-53  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10060  SSU ribosomal protein S12P  81.45 
 
 		 124 aa  207  4e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000265331  hitchhiker  0.000000000840597 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0244  30S ribosomal protein S12  77.42 
 
 		 126 aa  200  5e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.240123  normal  0.127892 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3442  30S ribosomal protein S12  77.42 
 
 		 126 aa  200  5e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000394059  normal  0.236546 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2764  30S ribosomal protein S12  77.42 
 
 		 126 aa  200  5e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0416814  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1606  ribosomal protein S12  79.84 
 
 		 126 aa  200  5e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.524218 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0322  30S ribosomal protein S12  77.42 
 
 		 126 aa  200  5e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.46074  normal  0.0169836 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0262  30S ribosomal protein S12  77.42 
 
 		 126 aa  200  5e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.822385  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0343  30S ribosomal protein S12  77.42 
 
 		 126 aa  200  5e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0271  30S ribosomal protein S12  77.42 
 
 		 126 aa  200  5e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.635943 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3649  30S ribosomal protein S12  77.42 
 
 		 126 aa  200  6e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111216  hitchhiker  0.000000000929733 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3782  30S ribosomal protein S12  77.42 
 
 		 126 aa  199  8e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00172098  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3809  30S ribosomal protein S12  77.42 
 
 		 126 aa  199  8e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3073  30S ribosomal protein S12  77.42 
 
 		 126 aa  199  8e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0733593  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3751  30S ribosomal protein S12  77.42 
 
 		 126 aa  199  8e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0182749  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0958  ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 123 aa  199  9e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000110265  hitchhiker  0.00000000399802 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16280  SSU ribosomal protein S12P  80.49 
 
 		 123 aa  199  9e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000991521  hitchhiker  0.0000080182 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0309  30S ribosomal protein S12  77.42 
 
 		 126 aa  199  9e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0102814  normal  0.289006 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0322  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 123 aa  199  9.999999999999999e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0874299  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0492  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 123 aa  199  9.999999999999999e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00450059  hitchhiker  0.000000284598 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2845  30S ribosomal protein S12  77.42 
 
 		 126 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.904067  normal  0.207657 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0473  30S ribosomal protein S12  77.42 
 
 		 124 aa  199  9.999999999999999e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0333  30S ribosomal protein S12  78.23 
 
 		 125 aa  199  9.999999999999999e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00769915 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3174  30S ribosomal protein S12  76.61 
 
 		 126 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00103484  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3473  30S ribosomal protein S12  76.61 
 
 		 126 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0860232  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1919  30S ribosomal protein S12  76.61 
 
 		 126 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000102606  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2637  30S ribosomal protein S12  76.61 
 
 		 126 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.419489  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3448  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 125 aa  198  1.9999999999999998e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0273463  normal  0.34807 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4000  ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 124 aa  197  3e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000197086  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3800  30S ribosomal protein S12  77.42 
 
 		 125 aa  197  3e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.0000000117431  n/a   
 
 
 
NC_008576  Mmc1_0842  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 123 aa  197  3e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117432  hitchhiker  0.000366661 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0268  30S ribosomal protein S12  77.42 
 
 		 125 aa  198  3e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0000012453  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0273  30S ribosomal protein S12  77.42 
 
 		 125 aa  198  3e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0102222  hitchhiker  0.00000133028 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1856  30S ribosomal protein S12  75.81 
 
 		 137 aa  197  3.9999999999999996e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0880493  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2263  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 123 aa  197  3.9999999999999996e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.12469  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0175  30S ribosomal protein S12  74.19 
 
 		 129 aa  197  5e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000000018595  normal  0.463989 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1259  30S ribosomal protein S12  78.23 
 
 		 125 aa  197  6e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0386  30S ribosomal protein S12  76.61 
 
 		 125 aa  197  6e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0122913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0075  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 123 aa  196  7.999999999999999e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.392906 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2428  30S ribosomal protein S12  75 
 
 		 135 aa  196  9e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0584234  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0284  30S ribosomal protein S12  75 
 
 		 136 aa  194  2.0000000000000003e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000309063  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2069  30S ribosomal protein S12  74.8 
 
 		 128 aa  194  2.0000000000000003e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000594982  normal  0.793383 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3185  30S ribosomal protein S12  76.61 
 
 		 125 aa  195  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0661629  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2234  30S ribosomal protein S12  76.03 
 
 		 135 aa  194  2.0000000000000003e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000995166  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0704  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 123 aa  195  2.0000000000000003e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000738801  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0260  30S ribosomal protein S12  74.19 
 
 		 135 aa  195  2.0000000000000003e-49  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000200867  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0048  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 126 aa  195  2.0000000000000003e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000042248  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1800  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 123 aa  195  2.0000000000000003e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.278795  normal  0.143842 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0198  30S ribosomal protein S12  75.81 
 
 		 125 aa  195  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000216597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1358  30S ribosomal protein S12  74.8 
 
 		 123 aa  194  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.179796  normal  0.150246 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0711  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 136 aa  194  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.305716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0296  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 135 aa  194  3e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0621  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 123 aa  194  3e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000330783  decreased coverage  1.9094399999999998e-21 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1244  30S ribosomal protein S12  74.8 
 
 		 123 aa  194  3e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.349862  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0187  ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 123 aa  194  3e-49  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0251  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 125 aa  194  3e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000000153437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1674  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 123 aa  194  3e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.230597  hitchhiker  0.0029615 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3343  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 125 aa  194  3e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00659827  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2301  30S ribosomal protein S12  73.98 
 
 		 128 aa  194  3e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000703033  decreased coverage  0.000703335 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3861  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 125 aa  194  3e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1426  30S ribosomal protein S12  77.42 
 
 		 126 aa  194  4.0000000000000005e-49  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0159812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3327  30S ribosomal protein S12  75.81 
 
 		 125 aa  194  4.0000000000000005e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.716206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0801  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 123 aa  194  4.0000000000000005e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.208097  normal  0.232344 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>