More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_5031 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_5031  50S ribosomal protein L18  100 
 
 
136 aa  268  2e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  6.97313e-06  normal  0.548641 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1338  50S ribosomal protein L18  89.05 
 
 
137 aa  237  3e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.000353034  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1048  50S ribosomal protein L18  83.09 
 
 
134 aa  201  4e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00198535  normal  0.123064 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1060  50S ribosomal protein L18  83.09 
 
 
134 aa  201  4e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  1.72408e-06  normal  0.393686 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1031  50S ribosomal protein L18  83.09 
 
 
134 aa  201  4e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  2.95773e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10734  50S ribosomal protein L18  79.51 
 
 
122 aa  192  1e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00420212  normal  0.645623 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3690  ribosomal protein L18  69.4 
 
 
134 aa  177  6e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  2.55511e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3401  ribosomal protein L18  67.15 
 
 
134 aa  172  1e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4491  ribosomal protein L18  66.4 
 
 
136 aa  164  3e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6598  ribosomal protein L18  74.8 
 
 
132 aa  164  3e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6033  50S ribosomal protein L18  67.21 
 
 
124 aa  157  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04140  LSU ribosomal protein L18P  68.85 
 
 
134 aa  157  6e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2960  50S ribosomal protein L18P  59.56 
 
 
127 aa  152  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00477287  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0322  50S ribosomal protein L18P  67.26 
 
 
128 aa  149  1e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00166637 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5140  ribosomal protein L18  64.52 
 
 
126 aa  148  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.642153 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0598  50S ribosomal protein L18  64.96 
 
 
124 aa  148  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2672  ribosomal protein L18  58.09 
 
 
127 aa  147  4e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1139  ribosomal protein L18  63.03 
 
 
122 aa  146  8e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20710  LSU ribosomal protein L18P  64.86 
 
 
124 aa  145  2e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3889  50S ribosomal protein L18P  64.91 
 
 
127 aa  145  2e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0603  ribosomal protein L18  61.67 
 
 
123 aa  142  1e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.415443  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29580  LSU ribosomal protein L18P  59.17 
 
 
123 aa  142  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.100392  normal  0.753343 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17010  LSU ribosomal protein L18P  63.39 
 
 
124 aa  142  1e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  8.38424e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1201  50S ribosomal protein L18  66.39 
 
 
131 aa  140  8e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0426216 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4305  ribosomal protein L18  59.83 
 
 
127 aa  139  1e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0643  ribosomal protein L18  57.5 
 
 
123 aa  138  2e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.258445  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0704  ribosomal protein L18  63.89 
 
 
127 aa  137  7e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.815408  normal  0.233202 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0947  ribosomal protein L18  59.02 
 
 
127 aa  135  3e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0241036  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1815  50S ribosomal protein L18  59.09 
 
 
120 aa  134  5e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1102  LSU ribosomal protein L18P  64.15 
 
 
127 aa  133  7e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0571737 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1723  50S ribosomal protein L18  61.32 
 
 
123 aa  133  9e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00474742  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1122  ribosomal protein L18  57.63 
 
 
122 aa  132  2e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.805171  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3127  ribosomal protein L18  56.67 
 
 
125 aa  132  2e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0211  50S ribosomal protein L18  60 
 
 
117 aa  129  1e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2261  50S ribosomal protein L18  58.18 
 
 
119 aa  127  4e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00249191  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2049  ribosomal protein L18  56.52 
 
 
116 aa  127  4e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00570654  normal  0.0179917 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2302  50S ribosomal protein L18  58.18 
 
 
119 aa  127  4e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0220849  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3008  50S ribosomal protein L18  60.34 
 
 
120 aa  126  8e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156671  hitchhiker  0.00901101 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0237  50S ribosomal protein L18  56.41 
 
 
120 aa  126  9e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0234  50S ribosomal protein L18  56.41 
 
 
120 aa  126  9e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.875475 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0074  50S ribosomal protein L18  58.18 
 
 
118 aa  125  1e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.966065  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0120  50S ribosomal protein L18  52.63 
 
 
120 aa  126  1e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  5.42863e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2630  50S ribosomal protein L18P  60.38 
 
 
128 aa  125  2e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.13685  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0121  50S ribosomal protein L18  51.75 
 
 
120 aa  125  2e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  5.38516e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0578  50S ribosomal protein L18  61.39 
 
 
127 aa  125  2e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5179  50S ribosomal protein L18  51.75 
 
 
120 aa  125  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  3.11819e-09  unclonable  1.18579e-25 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0127  50S ribosomal protein L18  52.63 
 
 
120 aa  125  3e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2643  ribosomal protein L18  62.38 
 
 
123 aa  124  3e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1891  50S ribosomal protein L18  58.18 
 
 
118 aa  124  4e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.865797  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0138  50S ribosomal protein L18  51.75 
 
 
120 aa  124  4e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.4273e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0157  50S ribosomal protein L18  51.75 
 
 
120 aa  124  5e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.09054e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0147  50S ribosomal protein L18  51.75 
 
 
120 aa  124  5e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  7.02498e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0731  ribosomal protein L18  54.84 
 
 
125 aa  124  5e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0122  50S ribosomal protein L18  51.75 
 
 
120 aa  124  5e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.09989e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0126  50S ribosomal protein L18  51.75 
 
 
120 aa  124  5e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  1.39258e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0126  50S ribosomal protein L18  51.75 
 
 
120 aa  124  5e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  1.40079e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0126  50S ribosomal protein L18  51.75 
 
 
120 aa  124  5e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0315012  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0120  50S ribosomal protein L18  51.75 
 
 
120 aa  124  5e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  6.18216e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2695  ribosomal protein L18  57.39 
 
 
119 aa  124  6e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1467  50S ribosomal protein L18  58.18 
 
 
118 aa  123  7e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  5.95755e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0306  50S ribosomal protein L18  56.36 
 
 
119 aa  123  7e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  1.38344e-28 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1729  50S ribosomal protein L18  53.85 
 
 
124 aa  123  7e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  5.00708e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2698  50S ribosomal protein L18  55.26 
 
 
119 aa  122  1e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2383  50S ribosomal protein L18  55.26 
 
 
119 aa  122  1e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2997  50S ribosomal protein L18  54.7 
 
 
120 aa  123  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331277  normal  0.0205603 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1242  50S ribosomal protein L18P  55.28 
 
 
124 aa  122  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0425166  hitchhiker  0.0030984 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0774  ribosomal protein L18  51.28 
 
 
122 aa  122  2e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0123  50S ribosomal protein L18  51.75 
 
 
120 aa  122  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0724  ribosomal protein L18  54.39 
 
 
124 aa  121  3e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111204  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0774  ribosomal protein L18  52.07 
 
 
122 aa  121  3e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  2.6259e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1269  ribosomal protein L18  54.39 
 
 
120 aa  120  4e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2148  50S ribosomal protein L18  58.93 
 
 
120 aa  120  5e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2919  50S ribosomal protein L18P  52.99 
 
 
122 aa  120  9e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000202022  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3718  50S ribosomal protein L18  54.17 
 
 
120 aa  119  1e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0610  50S ribosomal protein L18P  54.95 
 
 
118 aa  119  1e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0267024  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0301  50S ribosomal protein L18  53.78 
 
 
119 aa  119  1e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.525651 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1508  50S ribosomal protein L18  54.31 
 
 
121 aa  119  1e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.175326  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3979  ribosomal protein L18  52.99 
 
 
122 aa  119  2e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2574  50S ribosomal protein L18  55.56 
 
 
120 aa  119  2e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0969  50S ribosomal protein L18  50.42 
 
 
122 aa  118  3e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1970  50S ribosomal protein L18  51.69 
 
 
122 aa  118  3e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01330  ribosomal protein L18  52.59 
 
 
118 aa  117  4e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.458183  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1662  50S ribosomal protein L18P  58.12 
 
 
119 aa  117  4e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.130652  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0706  50S ribosomal protein L18  52.99 
 
 
120 aa  117  6e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  5.04342e-08  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0607  50S ribosomal protein L18  53.45 
 
 
119 aa  117  6e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2444  50S ribosomal protein L18P  51.26 
 
 
121 aa  117  7e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.96892 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0377  50S ribosomal protein L18  54.62 
 
 
119 aa  116  9e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.492357  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1731  50S ribosomal protein L18  54.62 
 
 
119 aa  116  9e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00463126  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0361  50S ribosomal protein L18  51.26 
 
 
122 aa  116  1e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0731775  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0490  50S ribosomal protein L18  55.65 
 
 
121 aa  115  1e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0095589  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0467  50S ribosomal protein L18  55.65 
 
 
121 aa  115  1e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  7.81328e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0883  50S ribosomal protein L18  52.59 
 
 
121 aa  116  1e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.418113  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1163  ribosomal protein L18  55.45 
 
 
118 aa  116  1e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000618231  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2518  50S ribosomal protein L18  54.62 
 
 
119 aa  116  1e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_432  ribosomal protein L18  55.65 
 
 
121 aa  116  1e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  1.58089e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1082  50S ribosomal protein L18  52.14 
 
 
122 aa  115  2e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.180279  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23640  LSU ribosomal protein L18P  59.6 
 
 
128 aa  115  2e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.429981  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1857  50S ribosomal protein L18  54.24 
 
 
120 aa  115  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.58959  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2317  ribosomal protein L18  52.17 
 
 
121 aa  114  3e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00125147  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2311  50S ribosomal protein L18  54.92 
 
 
120 aa  114  4e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0992173  normal  0.451377 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>