74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_5005 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_5005  hypothetical protein  100 
 
 
294 aa  586  1e-166  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1368  hypothetical protein  85.42 
 
 
281 aa  492  9.999999999999999e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.233326  normal  0.203451 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1095  hypothetical protein  82.69 
 
 
276 aa  468  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1068  hypothetical protein  82.69 
 
 
276 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1084  hypothetical protein  82.69 
 
 
276 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0372016 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13500  hypothetical protein  75.18 
 
 
285 aa  423  1e-117  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000277953  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1094  hypothetical protein  65.96 
 
 
283 aa  374  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1067  hypothetical protein  65.96 
 
 
283 aa  374  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1083  hypothetical protein  65.96 
 
 
283 aa  374  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.377526  normal  0.11045 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1367  hypothetical protein  65.16 
 
 
285 aa  371  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.134083 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5006  hypothetical protein  63.67 
 
 
287 aa  365  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38250  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  52.78 
 
 
280 aa  279  4e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.201502  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2385  putative F420-dependent oxidoreductase  55.94 
 
 
288 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.742445 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3207  putative F420-dependent oxidoreductase  54.48 
 
 
272 aa  265  5.999999999999999e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3680  putative F420-dependent oxidoreductase  54.01 
 
 
281 aa  263  4e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1512  hypothetical protein  49.48 
 
 
279 aa  252  4.0000000000000004e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00633715  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0252  hypothetical protein  50 
 
 
290 aa  246  3e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4343  hypothetical protein  49.81 
 
 
288 aa  238  5.999999999999999e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6698  hypothetical protein  48.59 
 
 
291 aa  231  1e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.490421  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0952  hypothetical protein  46.32 
 
 
285 aa  226  5.0000000000000005e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0151  hypothetical protein  48.88 
 
 
283 aa  215  5.9999999999999996e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5643  hypothetical protein  45.57 
 
 
297 aa  206  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.897056  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2688  hypothetical protein  45.35 
 
 
286 aa  204  1e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.566827  normal  0.214057 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3854  hypothetical protein  46.51 
 
 
286 aa  204  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.357835  normal  0.508421 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3932  hypothetical protein  45.63 
 
 
286 aa  201  8e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0176124 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6257  hypothetical protein  43.73 
 
 
285 aa  183  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.949372  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1071  hypothetical protein  42.4 
 
 
304 aa  182  8.000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1545  hypothetical protein  44.88 
 
 
301 aa  181  2e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0000935429  normal  0.088504 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2620  hypothetical protein  42.21 
 
 
296 aa  179  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7266  hypothetical protein  39.78 
 
 
334 aa  176  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.282695 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0059  hypothetical protein  39.72 
 
 
303 aa  172  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0508  hypothetical protein  39.5 
 
 
303 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.732723 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0497  hypothetical protein  39.5 
 
 
303 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0486  hypothetical protein  39.5 
 
 
303 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3644  hypothetical protein  41.67 
 
 
307 aa  159  4e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.150808 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4349  hypothetical protein  37.41 
 
 
324 aa  150  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3965  hypothetical protein  37 
 
 
324 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5428  hypothetical protein  38.96 
 
 
275 aa  145  7.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.178927 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4154  hypothetical protein  38.16 
 
 
301 aa  137  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.238248  normal  0.605436 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5686  hypothetical protein  39.53 
 
 
271 aa  136  5e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0100066 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9305  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  26.39 
 
 
322 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220711  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3526  luciferase-like monooxygenase  26.3 
 
 
318 aa  58.9  0.00000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.854723 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5119  Luciferase-like monooxygenase  27.57 
 
 
327 aa  58.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0410  luciferase family protein  26.74 
 
 
306 aa  57  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0589827 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0261  luciferase family protein  26.61 
 
 
309 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.110692 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3977  Luciferase-like monooxygenase  25.17 
 
 
318 aa  53.9  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1097  Luciferase-like monooxygenase  23.75 
 
 
335 aa  52.8  0.000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3116  putative F420-dependent oxidoreductase  27.34 
 
 
344 aa  52.8  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270575  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2486  luciferase family oxidoreductase, group 1  35.04 
 
 
326 aa  46.2  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.536185  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0507  Luciferase-like monooxygenase  28.37 
 
 
301 aa  45.4  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2146  Luciferase-like monooxygenase  40.24 
 
 
326 aa  45.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2574  hypothetical protein  25.9 
 
 
346 aa  45.4  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.304728  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1515  luciferase family protein  38.55 
 
 
346 aa  45.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.192461 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4273  Luciferase-like monooxygenase  27.4 
 
 
309 aa  44.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.268584  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3726  hypothetical protein  34.55 
 
 
351 aa  43.9  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000427742  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2163  luciferase family protein  24.19 
 
 
350 aa  44.3  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1630  methylenetetrahydromethanopterin reductase  36.36 
 
 
333 aa  44.3  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.497354  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0528  methylenetetrahydromethanopterin reductase  24.05 
 
 
328 aa  43.9  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.396522 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3948  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  23.57 
 
 
345 aa  43.5  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0406632  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20020  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  23.86 
 
 
351 aa  43.5  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294478 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4198  luciferase family protein  28.48 
 
 
317 aa  43.5  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.66157  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2317  luciferase family protein  23.89 
 
 
350 aa  43.1  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2761  luciferase-like  25 
 
 
353 aa  42.7  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4458  luciferase family protein  32.28 
 
 
350 aa  43.1  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.520717  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0532  luciferase-like protein  27.56 
 
 
326 aa  43.1  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0739  luciferase-like monooxygenase superfamily protein  34.48 
 
 
375 aa  42.7  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1682  luciferase-like monooxygenase  34.48 
 
 
333 aa  42.4  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1690  luciferase-like monooxygenase  34.48 
 
 
333 aa  42.4  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.624275  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1890  luciferase-like monooxygenase  34.48 
 
 
333 aa  42.4  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0562  luciferase-like monooxygenase  34.48 
 
 
333 aa  42.4  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1994  luciferase family oxidoreductase, group 1  37.63 
 
 
341 aa  42.4  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2268  luciferase  34.48 
 
 
402 aa  42.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.27163  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2476  luciferase family oxidoreductase, group 1  31.62 
 
 
334 aa  42.4  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2406  luciferase  34.48 
 
 
265 aa  42.4  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>