More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4978 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4978  UspA domain-containing protein  100 
 
 
293 aa  568  1e-161  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  80 
 
 
297 aa  448  1e-125  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  56.55 
 
 
292 aa  304  9.000000000000001e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  56.55 
 
 
292 aa  304  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  56.55 
 
 
292 aa  304  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12037  hypothetical protein  46.48 
 
 
295 aa  230  2e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4382  UspA domain-containing protein  47.14 
 
 
295 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12642  hypothetical protein  43.69 
 
 
297 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  45.42 
 
 
294 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  45.23 
 
 
294 aa  210  2e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  45.23 
 
 
294 aa  210  2e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1963  UspA domain-containing protein  46.28 
 
 
294 aa  209  5e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  44.21 
 
 
293 aa  206  3e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  44.21 
 
 
293 aa  206  3e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3626  UspA domain-containing protein  43.86 
 
 
293 aa  206  5e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208272  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  44.03 
 
 
295 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  44.03 
 
 
295 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  44.03 
 
 
295 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0713  UspA domain-containing protein  43.73 
 
 
294 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1415  UspA domain-containing protein  41.75 
 
 
295 aa  193  3e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542243  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0719  hypothetical protein  43.39 
 
 
294 aa  192  4e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0733  UspA domain-containing protein  43.39 
 
 
294 aa  192  4e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0946433 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12063  hypothetical protein  41.2 
 
 
294 aa  192  5e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3422  UspA domain-containing protein  42.05 
 
 
298 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3411  hypothetical protein  42.05 
 
 
298 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59136  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3474  UspA domain-containing protein  42.05 
 
 
298 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408629  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1386  UspA domain-containing protein  37.67 
 
 
293 aa  178  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  38.38 
 
 
293 aa  177  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1378  UspA domain-containing protein  41.78 
 
 
297 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5362  UspA domain-containing protein  38.93 
 
 
341 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4981  hypothetical protein  38.64 
 
 
341 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5069  UspA domain-containing protein  38.64 
 
 
341 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  40.07 
 
 
293 aa  166  5e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  41.11 
 
 
288 aa  165  9e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3526  hypothetical protein  42.71 
 
 
288 aa  162  7e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.369083  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1892  UspA domain-containing protein  41.02 
 
 
294 aa  156  3e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.281928  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12028  hypothetical protein  38.22 
 
 
317 aa  154  1e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000248719  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4999  UspA domain-containing protein  43.21 
 
 
296 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22920  universal stress protein UspA-like protein  42.12 
 
 
315 aa  149  6e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.27256  normal  0.365267 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  38.54 
 
 
289 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30750  universal stress protein UspA-like protein  36.39 
 
 
305 aa  142  9e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537439  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3447  UspA domain-containing protein  37.29 
 
 
296 aa  141  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728231  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4985  UspA domain-containing protein  39.86 
 
 
275 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3475  UspA domain-containing protein  38.14 
 
 
291 aa  137  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  37.59 
 
 
299 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  36.24 
 
 
293 aa  136  5e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3452  UspA domain-containing protein  37.02 
 
 
289 aa  135  7.000000000000001e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  35.48 
 
 
317 aa  134  9.999999999999999e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2388  UspA domain-containing protein  39.74 
 
 
293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  36.33 
 
 
289 aa  132  5e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4809  hypothetical protein  38.91 
 
 
282 aa  131  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.868158 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  35.52 
 
 
288 aa  130  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1800  UspA domain protein  35.29 
 
 
347 aa  130  3e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0593055  normal  0.0659308 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08260  universal stress protein UspA-like protein  37.11 
 
 
309 aa  129  5.0000000000000004e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.144181  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3533  UspA domain protein  35.74 
 
 
287 aa  129  6e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0384  UspA domain protein  35.66 
 
 
301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4830  hypothetical protein  36.6 
 
 
283 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148513  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2026  UspA domain protein  34.38 
 
 
290 aa  126  5e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000152786  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1402  UspA domain-containing protein  38.57 
 
 
275 aa  125  6e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  37.19 
 
 
292 aa  125  7e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2043  UspA domain protein  35.09 
 
 
291 aa  124  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000173989  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  39.58 
 
 
277 aa  123  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5216  UspA domain-containing protein  34.11 
 
 
298 aa  122  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.366232  normal  0.453672 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1801  UspA domain protein  36.33 
 
 
373 aa  122  7e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00612057  normal  0.112863 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1145  UspA domain protein  37.04 
 
 
301 aa  121  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4059  UspA domain protein  38.46 
 
 
288 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1808  UspA domain protein  35.15 
 
 
304 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  normal  0.0693032 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23130  universal stress protein UspA-like protein  40.27 
 
 
323 aa  120  3e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.688964  normal  0.113593 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2334  UspA domain-containing protein  37.14 
 
 
290 aa  120  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2526  UspA domain-containing protein  36.79 
 
 
296 aa  120  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3656  UspA domain-containing protein  34.26 
 
 
289 aa  119  4.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0378694  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3905  UspA domain protein  36.91 
 
 
301 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.166049  normal  0.0332237 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1111  UspA domain protein  36.04 
 
 
321 aa  119  6e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213436  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1901  UspA domain-containing protein  39.13 
 
 
295 aa  119  7.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184723  normal  0.100414 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4829  universal stress protein  38.01 
 
 
285 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595112  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0776  UspA domain protein  35.74 
 
 
308 aa  116  5e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2416  UspA domain protein  35.79 
 
 
277 aa  116  6e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000209099  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2000  UspA domain protein  36.05 
 
 
302 aa  116  6e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0511167  hitchhiker  0.00443199 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22890  universal stress protein UspA-like protein  35.64 
 
 
300 aa  115  7.999999999999999e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599041  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3433  UspA domain-containing protein  33.67 
 
 
289 aa  114  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1806  UspA domain protein  37.88 
 
 
393 aa  114  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0998568  normal  0.120471 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  36.59 
 
 
284 aa  113  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3658  UspA domain-containing protein  35.52 
 
 
296 aa  112  7.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0641627  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1934  UspA domain protein  38.68 
 
 
274 aa  112  8.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.235053  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2773  UspA domain-containing protein  35.1 
 
 
297 aa  112  9e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.254441  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5277  UspA domain protein  36.12 
 
 
308 aa  109  5e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0357  hypothetical protein  37.86 
 
 
300 aa  109  7.000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22880  universal stress protein UspA-like protein  35.76 
 
 
303 aa  108  9.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.538505  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0948  UspA domain-containing protein  32.63 
 
 
290 aa  108  9.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00710468  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3476  UspA domain-containing protein  33.79 
 
 
296 aa  106  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1900  UspA domain-containing protein  40 
 
 
277 aa  106  6e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0128633  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0884  UspA domain protein  33.78 
 
 
310 aa  105  7e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.314663 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0317  UspA domain-containing protein  34.13 
 
 
298 aa  105  7e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0328  hypothetical protein  36.23 
 
 
298 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0338  UspA domain-containing protein  36.23 
 
 
298 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.23658 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3032  hypothetical protein  34.34 
 
 
307 aa  104  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1787  universal stress protein  31.96 
 
 
345 aa  104  2e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06810  universal stress protein UspA-like protein  34.25 
 
 
322 aa  103  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.715632  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9016  hypothetical protein  32.62 
 
 
315 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2842  UspA domain protein  33.88 
 
 
305 aa  102  6e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.360925  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>