More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4953 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_4953  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 184 aa  360  5.0000000000000005e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281079  normal  0.71404 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5134  TetR family transcriptional regulator  56.5 
 
 		 198 aa  186  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5515  TetR family transcriptional regulator  56.5 
 
 		 195 aa  186  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.674737 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5223  TetR family transcriptional regulator  56.5 
 
 		 195 aa  186  1e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1272  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 176 aa  152  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.388296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  49.06 
 
 		 209 aa  94.4  9e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6209  transcriptional regulator, TetR family  33.9 
 
 		 208 aa  82  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 215 aa  74.7  0.0000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0815  transcriptional regulator, TetR family  34.41 
 
 		 207 aa  73.9  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1359  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 218 aa  73.9  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0153  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 205 aa  70.9  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10564  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1892  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 192 aa  65.1  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000800916  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2525  transcriptional regulator, TetR family  35.94 
 
 		 214 aa  61.6  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1845  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 237 aa  61.2  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4307  TetR family transcriptional regulator  55.36 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46290  TetR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128988  normal  0.0344421 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3134  TetR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.471149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4466  transcriptional regulator, TetR family  55.77 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575375  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1844  TetR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000808903 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1637  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0178246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1093  TetR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3937  transcriptional regulatory protein  40.66 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2011  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.27798 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4820  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3882  transcriptional regulator, TetR family  51.06 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0498  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 208 aa  53.9  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0525706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2011  transcriptional regulator, TetR family  50.98 
 
 		 203 aa  53.9  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1961  TetR family transcriptional regulator  51.06 
 
 		 213 aa  53.9  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.310052  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0300  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 214 aa  53.5  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.948594  normal  0.297799 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1677  transcriptional regulator, TetR family  50.98 
 
 		 203 aa  53.9  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.786941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1734  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 207 aa  53.5  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0246488  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 196 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2647  TetR family transcriptional regulator  59.57 
 
 		 74 aa  53.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1825  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 198 aa  52.8  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0521  putative transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0239  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 229 aa  53.1  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4331  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 220 aa  53.1  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2548  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 236 aa  52.8  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000944763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0966  transcriptional regulator, TetR family  42.03 
 
 		 218 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00645846  normal  0.836206 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5420  TetR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 202 aa  52.4  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.66162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 196 aa  52  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4856  TetR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 219 aa  52.4  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.633474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0850  TetR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 209 aa  52  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0204358 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3501  TetR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 209 aa  52  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.191946  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4865  TetR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 209 aa  52  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0820  putative transcription regulator protein  46.15 
 
 		 225 aa  52  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3182  TetR family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 216 aa  52  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.86361 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4689  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 243 aa  52  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1939  TetR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 257 aa  52  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0961  TetR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 218 aa  51.6  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1526  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 208 aa  51.2  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0534186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0767  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 227 aa  51.2  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4614  transcriptional regulator, TetR family  45.1 
 
 		 222 aa  51.2  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1314  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 201 aa  51.2  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.2142  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2408  transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 		 239 aa  51.2  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.616889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0746  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 190 aa  50.8  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0973  TetR family transcriptional regulator  50.91 
 
 		 199 aa  50.4  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.342069 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4218  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 208 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566415  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00530  transcriptional regulator  44.23 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2786  regulatory protein TetR  40 
 
 		 243 aa  50.4  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1942  TetR family transcriptional regulator  60 
 
 		 253 aa  50.8  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.338038  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0998  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 191 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000315127  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0794  TetR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 205 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 324 aa  49.7  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1240  transcriptional regulator, TetR family  35.09 
 
 		 211 aa  49.7  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.567777  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4122  TetR family transcriptional regulator  53.49 
 
 		 204 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0992  putative transcriptional regulator of paa operon  45.45 
 
 		 208 aa  50.1  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.332152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5303  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 210 aa  49.3  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.444335 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2538  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 195 aa  49.3  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.772793 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0143  transcriptional regulator  42.31 
 
 		 264 aa  49.7  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0795  TetR family transcriptional regulator  58.97 
 
 		 219 aa  49.3  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04380  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 72 aa  49.3  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3750  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 230 aa  49.3  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0927  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 191 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.165233  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 206 aa  48.9  0.00004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2868  TetR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 184 aa  48.9  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0239599 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1538  TetR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 222 aa  48.9  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5773  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 198 aa  48.9  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4758  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 210 aa  48.9  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.939945 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6138  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 198 aa  48.9  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.890581 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2306  TetR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 189 aa  48.9  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0142  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 184 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2165  transcriptional regulator, TetR family  51.11 
 
 		 188 aa  48.5  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289199  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0235  TetR family transcriptional regulator  52.27 
 
 		 225 aa  48.5  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0914  transcriptional regulatory protein  50 
 
 		 210 aa  48.5  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.626019  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  38.04 
 
 		 194 aa  48.9  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0543  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 203 aa  48.5  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.889127 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6198  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 193 aa  48.5  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  normal  0.545762 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0794  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 192 aa  48.5  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0156861  n/a   
 
 
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NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  46.81 
 
 		 206 aa  48.1  0.00006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0730  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 192 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.110462  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7672  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 198 aa  48.5  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245363  normal  0.688993 
 
 
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NC_007530  GBAA_0834  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 191 aa  48.1  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00423826  n/a   
 
 
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NC_007778  RPB_4514  TetR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 202 aa  48.1  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.603185  normal  0.656005 
 
 
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NC_010717  PXO_04693  transcriptional regulator TetR/acrR family  46.94 
 
 		 232 aa  48.5  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_0929  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 192 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1215099999999997e-45 
 
 
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NC_011884  Cyan7425_1901  transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 		 245 aa  48.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0306246  normal  1 
 
 
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NC_011369  Rleg2_0133  transcriptional regulator, TetR family  48.89 
 
 		 218 aa  47.8  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.440249 
 
 
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NC_014165  Tbis_2871  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 213 aa  47.8  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 224 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
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