More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4949 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4949  30S ribosomal protein S9  100 
 
 
171 aa  342  1e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.143487  normal  0.446856 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1131  30S ribosomal protein S9  85.44 
 
 
158 aa  272  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1158  30S ribosomal protein S9  85.44 
 
 
158 aa  272  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.356107 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1148  30S ribosomal protein S9  85.44 
 
 
158 aa  272  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.542588  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1470  30S ribosomal protein S9  82.56 
 
 
171 aa  268  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.828818 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1686  ribosomal protein S9  77.5 
 
 
161 aa  240  9e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0870  ribosomal protein S9  78.23 
 
 
167 aa  233  7e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13479  30S ribosomal protein S9  87.69 
 
 
151 aa  212  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0104915  hitchhiker  0.000207065 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4467  ribosomal protein S9  78.74 
 
 
139 aa  208  4e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1177  ribosomal protein S9  76.74 
 
 
174 aa  204  6e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.904807  normal  0.699948 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04450  SSU ribosomal protein S9P  66.67 
 
 
162 aa  203  1e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.271227 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0342  SSU ribosomal protein S9P  56.14 
 
 
170 aa  189  2e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0651444  hitchhiker  0.00386337 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0923  30S ribosomal protein S9  70.31 
 
 
154 aa  188  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6017  ribosomal protein S9  72.58 
 
 
135 aa  185  3e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0328969  normal  0.0856034 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2612  ribosomal protein S9  63.06 
 
 
162 aa  182  2.0000000000000003e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.523931  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3863  30S ribosomal protein S9  75.78 
 
 
154 aa  178  2.9999999999999997e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.78601 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29350  SSU ribosomal protein S9P  68.46 
 
 
162 aa  177  4.999999999999999e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.100136  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3105  ribosomal protein S9  57.76 
 
 
162 aa  177  7e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6564  ribosomal protein S9  75 
 
 
216 aa  175  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0743813  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4253  30S ribosomal protein S9  74.22 
 
 
154 aa  174  4e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0150173 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1126  30S ribosomal protein S9  56.67 
 
 
172 aa  171  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.482238 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0600  30S ribosomal protein S9  53.45 
 
 
173 aa  171  3.9999999999999995e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.190844  normal  0.458366 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20520  SSU ribosomal protein S9P  53.85 
 
 
171 aa  171  3.9999999999999995e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.476775  normal  0.598664 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16860  30S ribosomal protein S9  58.78 
 
 
162 aa  169  1e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.944317  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0972  ribosomal protein S9  57.69 
 
 
173 aa  168  4e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0537605 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0890  30S ribosomal protein S9  55.69 
 
 
166 aa  167  5e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2613  30S ribosomal protein S9  65.35 
 
 
169 aa  167  6e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0618  ribosomal protein S9  63.08 
 
 
163 aa  167  8e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5159  ribosomal protein S9  58.11 
 
 
169 aa  167  9e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.623801  normal  0.298446 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0615  SSU ribosomal protein S9P  74.59 
 
 
135 aa  164  5e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.733906  normal  0.442005 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0662  ribosomal protein S9  58.72 
 
 
165 aa  162  2.0000000000000002e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.178699  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2630  30S ribosomal protein S9  53.01 
 
 
168 aa  159  2e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2917  30S ribosomal protein S9  61.29 
 
 
168 aa  152  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.954546  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0902  30S ribosomal protein S9  61.16 
 
 
130 aa  152  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000079624  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4283  ribosomal protein S9  59.18 
 
 
171 aa  150  5.9999999999999996e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2297  ribosomal protein S9  59.5 
 
 
130 aa  149  2e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000207473  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0795  30S ribosomal protein S9  59.5 
 
 
130 aa  146  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000718866  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3517  30S ribosomal protein S9  56.91 
 
 
130 aa  145  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.143376  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3371  30S ribosomal protein S9  56.91 
 
 
130 aa  145  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0767368  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3453  30S ribosomal protein S9  56.91 
 
 
130 aa  145  3e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2069  30S ribosomal protein S9  56.2 
 
 
130 aa  143  1e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000831765  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1782  30S ribosomal protein S9  58.68 
 
 
130 aa  142  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000024243  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0721  30S ribosomal protein S9  63.78 
 
 
167 aa  142  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.21338 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2120  SSU ribosomal protein S9P  58.2 
 
 
130 aa  142  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.39803  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0321  30S ribosomal protein S9  58.68 
 
 
130 aa  141  5e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000288169  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1249  ribosomal protein S9  61.6 
 
 
131 aa  141  5e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2679  ribosomal protein S9  56.56 
 
 
130 aa  139  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0151101  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01520  ribosomal protein S9  54.92 
 
 
131 aa  138  4.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000216085  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02470  ribosomal protein S9  54.92 
 
 
131 aa  138  4.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000158686  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3436  30S ribosomal protein S9  54.47 
 
 
131 aa  137  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.113849  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1394  ribosomal protein S9  53.6 
 
 
129 aa  137  8.999999999999999e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000135637  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21980  SSU ribosomal protein S9P  59.5 
 
 
130 aa  136  1e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000149562  hitchhiker  0.00529045 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0212  ribosomal protein S9  59.84 
 
 
131 aa  136  1e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000467508  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0145  30S ribosomal protein S9  56.2 
 
 
130 aa  137  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23240  SSU ribosomal protein S9P  60.63 
 
 
166 aa  135  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.457375  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2151  30S ribosomal protein S9  53.28 
 
 
158 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.45731  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0138  30S ribosomal protein S9  55.37 
 
 
130 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000590069  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0719  30S ribosomal protein S9  58.2 
 
 
138 aa  135  4e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000482758  normal  0.593544 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2583  30S ribosomal protein S9  57.02 
 
 
130 aa  134  4e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000028456  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2249  30S ribosomal protein S9  48.17 
 
 
163 aa  134  5e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0144  30S ribosomal protein S9  54.55 
 
 
130 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000361179  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0139  30S ribosomal protein S9  54.55 
 
 
130 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.11946e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0137  30S ribosomal protein S9  54.55 
 
 
130 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000359543  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0157  30S ribosomal protein S9  54.55 
 
 
130 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.4920599999999996e-31 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0166  30S ribosomal protein S9  54.55 
 
 
130 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00347352  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5160  30S ribosomal protein S9  54.55 
 
 
130 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000743375  hitchhiker  0.0000000912351 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0176  30S ribosomal protein S9  54.55 
 
 
130 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000140848  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0725  30S ribosomal protein S9  56.56 
 
 
130 aa  134  9e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.616344  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1476  30S ribosomal protein S9  54.55 
 
 
166 aa  133  9.999999999999999e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.270542 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2678  30S ribosomal protein S9  52.89 
 
 
130 aa  133  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000125135  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2363  30S ribosomal protein S9  52.89 
 
 
130 aa  133  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000350135  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3627  30S ribosomal protein S9  52.46 
 
 
130 aa  133  9.999999999999999e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000023775  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1320  30S ribosomal protein S9  56.1 
 
 
137 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.540344  normal  0.687353 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0139  30S ribosomal protein S9  53.72 
 
 
130 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000424807  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1384  30S ribosomal protein S9  48.3 
 
 
161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.839793 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2843  30S ribosomal protein S9  47.65 
 
 
161 aa  132  3e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0144  30S ribosomal protein S9  53.72 
 
 
130 aa  132  3e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133435  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1450  SSU ribosomal protein S9P  53.72 
 
 
131 aa  132  3e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000188818  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0144  30S ribosomal protein S9  53.72 
 
 
130 aa  132  3e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000533856  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2620  30S ribosomal protein S9  47.65 
 
 
161 aa  132  3e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.159482 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1601  30S ribosomal protein S9  47.4 
 
 
164 aa  131  3.9999999999999996e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.292372  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01720  SSU ribosomal protein S9P  57.38 
 
 
130 aa  131  5e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000110111  hitchhiker  0.000000000473134 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0051  30S ribosomal protein S9  52 
 
 
128 aa  131  5e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0331  ribosomal protein S9  52.89 
 
 
130 aa  131  5e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00016739  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0970  30S ribosomal protein S9  55.74 
 
 
130 aa  130  6e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.476085 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2650  30S ribosomal protein S9  47.65 
 
 
161 aa  130  6e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.550147  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3731  30S ribosomal protein S9  55.65 
 
 
137 aa  130  9e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4425  ribosomal protein S9  52.89 
 
 
130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.146621  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4119  30S ribosomal protein S9  52.89 
 
 
130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4693  30S ribosomal protein S9  52.89 
 
 
130 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00380118  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3496  30S ribosomal protein S9  50.4 
 
 
128 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000030471  normal  0.91876 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0231  SSU ribosomal protein S9P  54.55 
 
 
131 aa  129  1.0000000000000001e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000192076  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1316  30S ribosomal protein S9  52.89 
 
 
130 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.428523  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0230  SSU ribosomal protein S9P  52.89 
 
 
132 aa  129  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000443747  normal  0.670048 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0347  ribosomal protein S9  55.74 
 
 
130 aa  129  2.0000000000000002e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000129825  normal  0.751178 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4533  30S ribosomal protein S9  52.89 
 
 
130 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.848049  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4408  30S ribosomal protein S9  52.89 
 
 
130 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.40853 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1063  30S ribosomal protein S9  53.72 
 
 
130 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000313432  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2587  30S ribosomal protein S9  56.1 
 
 
138 aa  129  2.0000000000000002e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13050  30S ribosomal protein S9  52.89 
 
 
130 aa  129  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>