More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4882 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_2154  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  48.69 
 
 
851 aa  705    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.288386  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11765  transmembrane ATP-binding protein ABC transporter  71.62 
 
 
863 aa  1201    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000591365 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1201  FHA domain-containing protein  75.14 
 
 
866 aa  1256    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.137794  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1228  ABC transporter related  75.34 
 
 
866 aa  1258    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00708642 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1218  ABC transporter related  75.14 
 
 
866 aa  1256    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1546  ABC transporter-related protein  89.33 
 
 
861 aa  1493    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.687102  normal  0.160264 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4882  ABC transporter related  100 
 
 
869 aa  1732    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296145 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2459  ABC transporter related protein  46.96 
 
 
848 aa  672    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.584906  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0947  FHA domain-containing protein  36.82 
 
 
851 aa  483  1e-135  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.231474 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5595  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  38 
 
 
838 aa  480  1e-134  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0852343  hitchhiker  0.00394117 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7170  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  41.93 
 
 
777 aa  462  1e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1183  FHA domain-containing protein  38.19 
 
 
895 aa  457  1e-127  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.1473  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4686  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  40.4 
 
 
856 aa  449  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5286  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  40.37 
 
 
933 aa  442  9.999999999999999e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.135201  normal  0.531019 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3181  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  40.21 
 
 
849 aa  440  9.999999999999999e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2211  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  34.28 
 
 
910 aa  424  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.913993 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6707  serine/threonine kinase protein  40.16 
 
 
1108 aa  379  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.54449  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6416  ABC transporter related  39.24 
 
 
702 aa  372  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00507697  normal  0.224381 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0751  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  32.68 
 
 
863 aa  324  5e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.039806 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4431  FHA domain-containing protein  31.02 
 
 
796 aa  315  1.9999999999999998e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1548  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  30.34 
 
 
1004 aa  299  1e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.506154 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4060  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  33.59 
 
 
890 aa  298  2e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.344917 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3935  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  31.54 
 
 
899 aa  295  2e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.410503  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3609  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  31.58 
 
 
903 aa  291  3e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0897  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  29.95 
 
 
878 aa  283  7.000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2932  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  30.49 
 
 
802 aa  283  1e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1666  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  29.1 
 
 
799 aa  271  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1639  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  28.91 
 
 
799 aa  268  4e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28591  hypothetical protein  29.74 
 
 
770 aa  233  1e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0963  ABC transporter related  28.26 
 
 
590 aa  171  8e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6943  ABC transporter related  34.67 
 
 
972 aa  168  5e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.144831 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13396  hypothetical protein  61.48 
 
 
122 aa  146  1e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0921482 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25217  predicted protein  28.52 
 
 
635 aa  136  1.9999999999999998e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.657092  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49726  predicted protein  25.73 
 
 
741 aa  134  9e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.125269  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_42103  ABC(ATP-binding) family transporter  35.09 
 
 
1226 aa  131  4.0000000000000003e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0166966  normal  0.134886 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0427  ATPase  33.8 
 
 
282 aa  131  6e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57529  ATP dependent transporter multidrug resistance (SNQ2)  30.11 
 
 
1455 aa  130  1.0000000000000001e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.088165  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08892  ABC multidrug transporter (Eurofung)  34.92 
 
 
1448 aa  128  4.0000000000000003e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3796  ABC transporter related  35.61 
 
 
323 aa  128  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6187  nodulation factor exporter subunit NodI  32.95 
 
 
355 aa  128  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05770  xenobiotic-transporting ATPase, putative  34.04 
 
 
1536 aa  128  5e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.16705  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4919  nodulation factor exporter subunit NodI  33.47 
 
 
342 aa  127  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19730  ABC transporter related  31.14 
 
 
252 aa  127  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3313  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.36 
 
 
502 aa  126  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.571004  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5039  nodulation factor exporter subunit NodI  33.08 
 
 
345 aa  125  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05194  ABC transporter (Eurofung)  37.9 
 
 
963 aa  125  4e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.177656  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2964  ABC transporter related protein  36.89 
 
 
253 aa  125  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.194601  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND00090  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  31.91 
 
 
1558 aa  125  5e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.120947  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35308  ABC(ABCG) family transporter: pleiotropic drug  33.96 
 
 
1268 aa  125  5e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03329  ABC multidrug transporter (Eurofung)  33.22 
 
 
1361 aa  124  6e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.829089  normal  0.85182 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08928  ATP-binding cassette multidrug transporter [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78576]  26.49 
 
 
1466 aa  124  7e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0515148 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0358  ABC transporter related  31.6 
 
 
303 aa  124  7e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0629  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  34.72 
 
 
244 aa  124  8e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0726  ABC transporter related  34.48 
 
 
247 aa  123  1.9999999999999998e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000170097  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0695  ABC transporter related protein  32.43 
 
 
328 aa  123  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77736  Opaque-specific ABC transporter CDR3  35.47 
 
 
1470 aa  122  1.9999999999999998e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0085  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  33.64 
 
 
254 aa  122  1.9999999999999998e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000203236  normal  0.523772 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85570  Multidrug resistance protein  35.19 
 
 
1505 aa  122  3e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.408248  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0060  ABC transporter related  37.91 
 
 
312 aa  122  3e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0643  ABC transporter related  34.91 
 
 
304 aa  122  3e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4029  nodulation ABC transporter NodI  32.62 
 
 
304 aa  122  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2485  nodulation ABC transporter NodI  32.19 
 
 
344 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_23497  predicted protein  32.5 
 
 
1891 aa  122  3.9999999999999996e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0286  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.21 
 
 
307 aa  122  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  36.97 
 
 
246 aa  122  3.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10949  ABC transporter protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96VK5]  35.56 
 
 
1501 aa  121  4.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01174  ABC multidrug transporter (Eurofung)  37.38 
 
 
1490 aa  121  4.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2486  ATP-binding protein  32.85 
 
 
318 aa  121  4.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2824  ABC transporter related  34.32 
 
 
302 aa  121  4.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3884  ABC transporter related  33.17 
 
 
240 aa  121  4.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_83  predicted protein  37.1 
 
 
1164 aa  121  6e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.897392  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  32.71 
 
 
242 aa  121  7e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1484  nodulation ABC transporter NodI  34 
 
 
309 aa  120  9e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.374303  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50096  predicted protein  26 
 
 
640 aa  120  9e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59143  ABC transporter  29.53 
 
 
1476 aa  120  9.999999999999999e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.233353  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11703  ATP-binding protein ABC transporter  36.24 
 
 
255 aa  120  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.228043 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0284  ABC transporter, ATPase subunit  34.38 
 
 
310 aa  120  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6988  ABC transporter related  36.49 
 
 
265 aa  120  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.741907  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0290  ABC transporter related protein  33.17 
 
 
341 aa  120  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  31.25 
 
 
279 aa  120  9.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1218  nodulation ABC transporter NodI  31.76 
 
 
306 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.513325  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06490  ABC transporter, putative  34.89 
 
 
1463 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0348  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  34.98 
 
 
605 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.000000098516 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3211  ABC transporter ATP-binding protein  30.77 
 
 
307 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00761631  normal  0.0394821 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1840  nodulation ABC transporter NodI  31.76 
 
 
304 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4865  ABC transporter related  33.19 
 
 
244 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0749  ABC transporter related  28.71 
 
 
904 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.118496  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2220  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.63 
 
 
321 aa  119  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00218593  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1116  nodulation ABC transporter NodI  31.2 
 
 
304 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2001  ABC transporter related  33.19 
 
 
258 aa  119  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1528  ABC transporter related  30.52 
 
 
246 aa  119  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.479266  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0801  nodulation ABC transporter NodI  31.76 
 
 
304 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.485655  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1596  nodulation ABC transporter NodI  31.2 
 
 
304 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.993965  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1855  nodulation ABC transporter NodI  31.76 
 
 
304 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1703  nodulation ABC transporter NodI  31.76 
 
 
304 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3995  ABC transporter related  37.09 
 
 
286 aa  119  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.259313  normal  0.940234 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08344  ABC multidrug transporter (Eurofung)  36.68 
 
 
1462 aa  119  3e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0543017  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3073  ABC transporter related  32.23 
 
 
307 aa  119  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0036  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.64 
 
 
325 aa  119  3e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  32.24 
 
 
242 aa  119  3e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>