More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4744 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4744  putative outer membrane adhesin like protein  100 
 
 
666 aa  1317    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.511214  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1718  putative outer membrane adhesin like proteiin  46.99 
 
 
777 aa  377  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0847  putative outer membrane adhesin like protein  47.9 
 
 
567 aa  265  3e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.189392  normal  0.116719 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1720  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  36.75 
 
 
1949 aa  171  5e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5913  putative outer membrane adhesin like proteiin  43.46 
 
 
1063 aa  162  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.278208  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3594  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  46.3 
 
 
1056 aa  162  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207597  normal  0.593254 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2913  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  45.56 
 
 
1067 aa  160  5e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.511883  normal  0.352036 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1009  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.41 
 
 
802 aa  125  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.227831 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5004  hypothetical protein  30.31 
 
 
1039 aa  120  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.998418 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  36.22 
 
 
3927 aa  115  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0031  M24/M37 family peptidase  49.56 
 
 
299 aa  112  2.0000000000000002e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  35.69 
 
 
2377 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4603  outer membrane adhesin like proteiin  33.11 
 
 
1867 aa  96.3  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873009  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.13 
 
 
1884 aa  94.7  4e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2039  Peptidase M23  43.22 
 
 
414 aa  92  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0205491  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1363  Peptidase M23  44.44 
 
 
402 aa  87.4  7e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.498283  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3182  hypothetical protein  31.8 
 
 
1416 aa  80.9  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  28.82 
 
 
1597 aa  80.9  0.00000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0243  M24/M37 family peptidase  41.67 
 
 
300 aa  79.3  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.35 
 
 
2507 aa  79.7  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4736  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.14 
 
 
1433 aa  79.7  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.159607 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1597  hypothetical protein  28.21 
 
 
898 aa  79  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.489596 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  36.81 
 
 
377 aa  78.6  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1702  hypothetical protein  31.23 
 
 
1512 aa  76.3  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0190  Peptidase M23  39.55 
 
 
582 aa  76.3  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5984  peptidase M23B  36.96 
 
 
284 aa  76.3  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0310033  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0237  peptidase M23B  33.54 
 
 
824 aa  75.5  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.130715 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  43.16 
 
 
527 aa  75.1  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1230  M24/M37 family peptidase  41.88 
 
 
300 aa  74.7  0.000000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.448984  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23480  peptidase M23B  37.17 
 
 
334 aa  74.3  0.000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000421975  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1105  M24/M37 family peptidase  41.53 
 
 
300 aa  73.9  0.000000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1568  peptidase M23B  40 
 
 
317 aa  73.9  0.000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0752  peptidoglycan-binding peptidase M23B  38.28 
 
 
291 aa  73.9  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.897589  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04807  hypothetical protein  36.89 
 
 
317 aa  73.9  0.000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0799  Peptidase M23  38.28 
 
 
294 aa  73.9  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00788388  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2199  Peptidase M23  40.32 
 
 
316 aa  72.8  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1283  Peptidase M23  40 
 
 
251 aa  72.4  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  29.67 
 
 
5745 aa  72.4  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  38.24 
 
 
301 aa  72.8  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  43.75 
 
 
305 aa  72.8  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1104  peptidase M23B  39.5 
 
 
444 aa  72.8  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.109344  decreased coverage  0.00201556 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0652  Peptidase M23  41.51 
 
 
198 aa  72.8  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00716754  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2398  Peptidase M23  36.05 
 
 
474 aa  73.2  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0487248 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0803  Peptidase M23  38.28 
 
 
292 aa  73.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3739  outer membrane adhesin like proteiin  33.85 
 
 
4231 aa  72.8  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1041  peptidase, M23/M37 family  43.75 
 
 
302 aa  72.4  0.00000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.432604  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0060  hypothetical protein  42.42 
 
 
430 aa  72  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  5.86289e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0735  M24/M37 family peptidase  41.67 
 
 
296 aa  72  0.00000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0510667  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0633  Peptidase M23  40.57 
 
 
198 aa  71.6  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0188  peptidase M23B  37.5 
 
 
271 aa  71.2  0.00000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.248105  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1615  Peptidase M23  38.66 
 
 
299 aa  71.2  0.00000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3195  peptidoglycan-binding LysM  38.71 
 
 
754 aa  71.2  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000999045  decreased coverage  0.00000682898 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1152  peptidase M23B  40 
 
 
414 aa  71.2  0.00000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000291008  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2270  Peptidase M23  42.61 
 
 
727 aa  70.9  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000539525  unclonable  0.00000000807187 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2207  Peptidase M23  42.61 
 
 
727 aa  70.9  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0789  peptidase M23B  38.89 
 
 
284 aa  70.9  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.236004  normal  0.0154646 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1249  M24/M37 family peptidase  40.62 
 
 
244 aa  70.5  0.00000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.838418  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  38.84 
 
 
452 aa  70.5  0.00000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4631  Peptidase M23  41.55 
 
 
195 aa  70.1  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1354  peptidase M23B  38.02 
 
 
424 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000810467  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0866  Peptidase M23  40 
 
 
489 aa  69.3  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.329722  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1343  Peptidase M23  38.02 
 
 
320 aa  69.3  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.243109  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25170  metalloendopeptidase-like membrane protein  33.56 
 
 
462 aa  69.3  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1326  peptidoglycan-binding LysM  38.33 
 
 
349 aa  69.3  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0931152 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4206  peptidase M23B  37.14 
 
 
270 aa  69.3  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  34.48 
 
 
442 aa  69.3  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2121  Peptidase M23  29.3 
 
 
262 aa  69.7  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2182  peptidase M23B  36.07 
 
 
233 aa  69.7  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  35.14 
 
 
375 aa  69.7  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1777  M24/M37 family peptidase  41.03 
 
 
347 aa  69.7  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.193193  normal  0.0207649 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2472  peptidase M23B  36.57 
 
 
446 aa  69.7  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000997494  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  39.5 
 
 
375 aa  69.3  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1370  M24/M37 family peptidase  41.67 
 
 
273 aa  68.9  0.0000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0779116  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1314  cell wall endopeptidase  38.02 
 
 
423 aa  68.9  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000373067  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1313  cell wall endopeptidase  38.02 
 
 
423 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000309784  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3686  parallel beta-helix repeat-containing protein  31.66 
 
 
1066 aa  68.9  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.346515 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  40.4 
 
 
491 aa  68.9  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4510  peptidase M23B  40.16 
 
 
334 aa  68.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1339  M24/M37 family peptidase  38.02 
 
 
417 aa  68.6  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000501622  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0505  peptidase M23B  43.16 
 
 
465 aa  68.6  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1523  peptidase, M23/M37 family  38.02 
 
 
423 aa  68.6  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  9.25649e-59 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1449  M23/37 family peptidase  38.02 
 
 
417 aa  68.6  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000128519  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1893  peptidase M23B  40.65 
 
 
325 aa  68.6  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3858  cell wall endopeptidase, family M23/M37  37.19 
 
 
424 aa  68.2  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000135417  hitchhiker  0.00000000000537806 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  32.47 
 
 
446 aa  68.2  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  36.07 
 
 
590 aa  68.2  0.0000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1779  Peptidase M23  36.11 
 
 
354 aa  68.2  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2204  peptidase M23  38.94 
 
 
999 aa  68.2  0.0000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1592  peptidase, M23/M37 family  38.02 
 
 
423 aa  67.8  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000620859  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1554  M24/M37 family peptidase  38.02 
 
 
423 aa  67.8  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000152765  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3151  hypothetical protein  38.61 
 
 
460 aa  67.8  0.0000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696817  hitchhiker  0.00198036 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3331  outer membrane adhesin like proteiin  29.94 
 
 
3439 aa  67.8  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1486  cell wall endopeptidase, family M23/M37  37.19 
 
 
421 aa  67.8  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000596043  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0539  Peptidase M23  33.62 
 
 
308 aa  67.8  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0654  Peptidase M23  38.95 
 
 
274 aa  67.8  0.0000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3774  peptidase M23B  37.5 
 
 
266 aa  67.8  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  33.56 
 
 
404 aa  67.8  0.0000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1646  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  36.84 
 
 
248 aa  67.8  0.0000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.570168  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1877  Peptidase M23  38.3 
 
 
273 aa  67.8  0.0000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000121356  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2292  Peptidase M23  40.4 
 
 
300 aa  67.4  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>