More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4616 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4616  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
518 aa  1043  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.892742  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3215  O-succinylbenzoate-CoA ligase  79.34 
 
 
517 aa  807  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0554015  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3204  O-succinylbenzoate-CoA ligase  79.34 
 
 
517 aa  807  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.716175  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3266  O-succinylbenzoate-CoA ligase  79.34 
 
 
517 aa  807  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.10141  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  43.5 
 
 
499 aa  438  1e-121  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  44.6 
 
 
503 aa  403  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1614  AMP-dependent synthetase and ligase  44.88 
 
 
509 aa  399  1e-109  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  43.05 
 
 
520 aa  387  1e-106  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4902  AMP-dependent synthetase and ligase  44.51 
 
 
501 aa  388  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0814  AMP-dependent synthetase and ligase  42.52 
 
 
508 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4072  AMP-dependent synthetase and ligase  42.38 
 
 
508 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3808  AMP-dependent synthetase and ligase  41.67 
 
 
508 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.762435  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0667  putative O-succinylbenzoate--CoA ligase  42.29 
 
 
516 aa  369  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.604577  normal  0.0579833 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1964  acyl-CoA synthetase  38.61 
 
 
496 aa  366  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.41031e-13 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3819  O-succinylbenzoate-CoA ligase  41.07 
 
 
529 aa  365  1e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1928  acyl-CoA synthetase  38.22 
 
 
496 aa  364  2e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.132163  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1789  acyl-CoA synthetase  38.22 
 
 
496 aa  364  2e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0554946  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0115  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.23 
 
 
556 aa  362  8e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0124  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.23 
 
 
556 aa  362  8e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.514213  normal  0.109541 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.23 
 
 
556 aa  362  9e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.356608  normal  0.265858 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  40.62 
 
 
525 aa  361  2e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1746  acyl-CoA synthetase  36.88 
 
 
496 aa  360  3e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  40 
 
 
520 aa  358  1e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4008  AMP-dependent synthetase and ligase  42.04 
 
 
1043 aa  358  2e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1488  AMP-dependent synthetase and ligase  41.26 
 
 
525 aa  357  4e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0982209  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3129  AMP-dependent synthetase and ligase  41.31 
 
 
534 aa  350  2e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.64 
 
 
514 aa  351  2e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2447  AMP-dependent synthetase and ligase  42.24 
 
 
505 aa  349  6e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4181  AMP-dependent synthetase and ligase  40.43 
 
 
527 aa  349  7e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0714  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.31 
 
 
579 aa  347  2e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  40.88 
 
 
521 aa  347  3e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5944  AMP-dependent synthetase and ligase  40.08 
 
 
532 aa  346  6e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420174  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0367  AMP-dependent synthetase and ligase  40.12 
 
 
513 aa  345  1e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.379931 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1225  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.22 
 
 
519 aa  344  2e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.399435  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08640  acyl-CoA synthetase  40.31 
 
 
516 aa  345  2e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.310549  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0415  AMP-dependent synthetase and ligase  39.62 
 
 
515 aa  343  5e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.866195  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0415  AMP-dependent synthetase and ligase  42.8 
 
 
620 aa  341  2e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.784497  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  39.6 
 
 
512 aa  340  3e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5453  AMP-dependent synthetase and ligase  38.69 
 
 
554 aa  340  4e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.400076 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4613  AMP-dependent synthetase and ligase  40.67 
 
 
512 aa  340  4e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.499912 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2522  AMP-dependent synthetase and ligase  41.47 
 
 
534 aa  340  5e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0131  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.59 
 
 
570 aa  339  7e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.85 
 
 
524 aa  338  2e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0843  acyl-CoA synthetase  40.28 
 
 
513 aa  336  5e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.333452  normal  0.193709 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1133  AMP-dependent synthetase and ligase  39.45 
 
 
518 aa  333  3e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.508244  normal  0.50206 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2406  AMP-dependent synthetase and ligase  40.2 
 
 
509 aa  333  5e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0466191 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10167  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.63 
 
 
554 aa  333  5e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  40.04 
 
 
516 aa  329  6e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1052  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.04 
 
 
518 aa  329  6e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4080  AMP-dependent synthetase and ligase  39.88 
 
 
518 aa  329  6e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.656205  normal  0.161644 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0965  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.04 
 
 
518 aa  329  8e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0779  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.95 
 
 
518 aa  328  2e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.746675  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3993  AMP-dependent synthetase and ligase  40.12 
 
 
524 aa  328  2e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.968795  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13106  fatty-acid-CoA ligase fadD13  37.89 
 
 
503 aa  327  2e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0927  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.7 
 
 
518 aa  328  2e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.15 
 
 
512 aa  327  3e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1569  long-chain fatty-acid-CoA ligase, putative  40.41 
 
 
510 aa  327  3e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.890411  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  36.22 
 
 
539 aa  327  4e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4826  AMP-dependent synthetase and ligase  39.92 
 
 
520 aa  326  5e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0178748  normal  0.551416 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4238  AMP-dependent synthetase and ligase  37.67 
 
 
527 aa  326  7e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2377  AMP-dependent synthetase and ligase  39 
 
 
530 aa  325  1e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.581612  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1604  AMP-dependent synthetase and ligase  39.75 
 
 
540 aa  325  2e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0707  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.52 
 
 
518 aa  325  2e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.413153  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4202  acyl-CoA synthetase  40.31 
 
 
534 aa  324  2e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.269622  hitchhiker  0.00584314 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2323  AMP-dependent synthetase and ligase  37.09 
 
 
511 aa  325  2e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3720  AMP-dependent synthetase and ligase  39.69 
 
 
518 aa  324  3e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.189603  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5827  AMP-dependent synthetase and ligase  39.14 
 
 
518 aa  324  3e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.671788  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5438  AMP-dependent synthetase and ligase  40.32 
 
 
515 aa  323  5e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427259  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3747  AMP-dependent synthetase and ligase  39.77 
 
 
514 aa  322  1e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4403  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.25 
 
 
518 aa  322  1e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  6.50953e-07 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2335  AMP-dependent synthetase and ligase  40.36 
 
 
509 aa  321  2e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4684  AMP-dependent synthetase and ligase  42 
 
 
526 aa  321  2e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0894  acyl-CoA synthetase  39.48 
 
 
520 aa  321  2e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.493906  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4075  AMP-dependent synthetase and ligase  41.18 
 
 
521 aa  320  5e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6878  AMP-dependent synthetase and ligase  36.99 
 
 
509 aa  319  6e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615245  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0102  AMP-dependent synthetase and ligase  39.38 
 
 
520 aa  318  1e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3772  putative O-succinylbenzoate--CoA ligase  37.1 
 
 
531 aa  318  1e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.910601 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3158  AMP-dependent synthetase and ligase  38.52 
 
 
515 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0319  acyl-CoA synthetase  39 
 
 
537 aa  317  3e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.43856 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0300  acyl-CoA synthetase  39 
 
 
537 aa  317  3e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0309  acyl-CoA synthetase  39 
 
 
537 aa  317  3e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0965  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.36 
 
 
518 aa  316  5e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0047  AMP-dependent synthetase and ligase  39.33 
 
 
517 aa  316  7e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0606  AMP-dependent synthetase and ligase  40.38 
 
 
560 aa  316  7e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0135962 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.77 
 
 
513 aa  315  1e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0832  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.36 
 
 
518 aa  315  1e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0876  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.36 
 
 
518 aa  315  1e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0778  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.14 
 
 
518 aa  315  1e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0779  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.14 
 
 
518 aa  315  1e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2432  AMP-dependent synthetase and ligase  41.08 
 
 
508 aa  314  2e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1595  AMP-dependent synthetase and ligase  38.39 
 
 
519 aa  315  2e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2038  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  37.48 
 
 
565 aa  314  3e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3704  AMP-dependent synthetase and ligase  37.48 
 
 
515 aa  314  3e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0990866  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1605  AMP-dependent synthetase and ligase  37.52 
 
 
526 aa  314  3e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1367  AMP-dependent synthetase and ligase  38.88 
 
 
502 aa  312  9e-84  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.439129  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  36.74 
 
 
662 aa  312  1e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3816  AMP-dependent synthetase and ligase  39.07 
 
 
518 aa  312  1e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0163789  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0610  AMP-binding domain protein  36.84 
 
 
570 aa  311  2e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.920315  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1467  AMP-binding domain protein  36.5 
 
 
578 aa  311  2e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  36.45 
 
 
520 aa  311  2e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>