More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4545 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4545  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
261 aa  525  1e-148  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.384179 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0285  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  77.01 
 
 
264 aa  413  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0294  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  76.63 
 
 
264 aa  412  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0304  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  76.63 
 
 
264 aa  412  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.20364 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2633  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.08 
 
 
276 aa  341  8e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.364215  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3511  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.99 
 
 
264 aa  316  2e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.531457  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.78 
 
 
256 aa  210  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7149  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.39 
 
 
265 aa  191  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0163274 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.83 
 
 
270 aa  181  8.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.155625 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.4 
 
 
270 aa  178  9e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.442455  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0053  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.4 
 
 
270 aa  178  9e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0110329  normal  0.0245266 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1940  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.78 
 
 
275 aa  151  8.999999999999999e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.320564  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2380  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.95 
 
 
271 aa  139  6e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2996  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.99 
 
 
268 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.056073 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3576  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.18 
 
 
276 aa  122  6e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6445  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.35 
 
 
272 aa  120  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0523  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.44 
 
 
255 aa  119  3e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.77 
 
 
266 aa  115  6e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3574  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.68 
 
 
267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.259441  normal  0.335877 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5590  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.78 
 
 
266 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.263195  hitchhiker  0.00574732 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5904  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.86 
 
 
265 aa  108  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.708406  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.86 
 
 
271 aa  105  6e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708878  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2362  short chain oxidoreductase  50 
 
 
128 aa  105  6e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0558565 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.92 
 
 
261 aa  105  6e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5585  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.09 
 
 
265 aa  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.892025  normal  0.853623 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0906  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.44 
 
 
273 aa  103  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.127379  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1011  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.57 
 
 
258 aa  103  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.968961  hitchhiker  0.00922057 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0124  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.32 
 
 
269 aa  102  6e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1224  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.64 
 
 
261 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000362575 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.32 
 
 
269 aa  100  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000288771 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_79198  beta-hydroxysteroid dehydrogenase type 3  34.74 
 
 
346 aa  100  3e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.103283  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0445  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.02 
 
 
267 aa  99.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  0.221701 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6941  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.74 
 
 
259 aa  99.4  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0177  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.92 
 
 
262 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.721122 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2063  short-chain dehydrogenase  31.6 
 
 
261 aa  97.4  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0247773  normal  0.17766 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3329  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.02 
 
 
256 aa  96.7  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.227726  hitchhiker  0.00265893 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.54 
 
 
261 aa  97.1  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0188  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.92 
 
 
262 aa  96.3  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.92 
 
 
262 aa  96.3  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0137  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.33 
 
 
261 aa  96.3  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000076045 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2064  oxidoreductase ( short-chain dehydrogenase)  29 
 
 
264 aa  95.5  8e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.694867  normal  0.0846624 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1795  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.21 
 
 
264 aa  94.7  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.711928  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6133  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.62 
 
 
263 aa  94.7  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4202  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.94 
 
 
344 aa  94  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1006  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.96 
 
 
257 aa  94  2e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2478  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.34 
 
 
262 aa  94  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35320  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  32.88 
 
 
249 aa  94  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.135035  normal  0.316469 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0350  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.18 
 
 
259 aa  94  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000771311  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5008  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.6 
 
 
298 aa  94  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0468951  hitchhiker  0.00252787 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.78 
 
 
261 aa  93.2  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.11 
 
 
259 aa  92.8  4e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.82399  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3857  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.69 
 
 
263 aa  92.8  5e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1836  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.16 
 
 
260 aa  92.8  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5163  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.14 
 
 
258 aa  91.3  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3579  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.78 
 
 
258 aa  91.7  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.392131  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1341  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.97 
 
 
268 aa  91.3  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 
255 aa  90.5  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.505504 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0423  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
259 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.83571  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1015  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  29.47 
 
 
263 aa  90.5  2e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.34 
 
 
264 aa  90.1  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000179752 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1889  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.57 
 
 
264 aa  89.7  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0188274  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1145  short chain dehydrogenase  29.47 
 
 
321 aa  89.4  5e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0351  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.32 
 
 
291 aa  89.4  5e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4572  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.2 
 
 
258 aa  89  6e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05256  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.78 
 
 
259 aa  89.4  6e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0516  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
263 aa  88.6  9e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.98 
 
 
264 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.576998  normal  0.0165353 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.51 
 
 
260 aa  88.6  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.756544 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.5 
 
 
261 aa  88.6  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000113464  decreased coverage  0.000120518 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1556  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.75 
 
 
261 aa  88.6  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.596662  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.15 
 
 
255 aa  88.2  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000634692  hitchhiker  0.00117931 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3647  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.78 
 
 
255 aa  87.8  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08440  putative short chain alcohol dehydrogenase  31.76 
 
 
266 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000229698 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0497  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.57 
 
 
360 aa  87  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2426  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.63 
 
 
269 aa  86.7  3e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.316114 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2703  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.02 
 
 
264 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0799  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.47 
 
 
266 aa  87  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.76 
 
 
272 aa  86.3  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.605078  normal  0.514892 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6420  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.1 
 
 
259 aa  86.7  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4523  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.99 
 
 
266 aa  86.7  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.642907  decreased coverage  0.0040913 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4735  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.67 
 
 
262 aa  86.7  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1466  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.35 
 
 
253 aa  86.7  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0605466  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38500  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  32.88 
 
 
253 aa  85.9  5e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0666  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.12 
 
 
343 aa  85.9  5e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.019294  hitchhiker  0.000464867 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25790  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  33.78 
 
 
282 aa  85.9  5e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2989  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.02 
 
 
264 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0851531 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1864  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  33.01 
 
 
262 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5270  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.67 
 
 
262 aa  85.9  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2321  dehydrogenase/reductase oxidoreductase protein  35.64 
 
 
275 aa  85.5  7e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.195083 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2195  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.96 
 
 
250 aa  85.5  9e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.92313 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2014  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.26 
 
 
268 aa  85.1  9e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.700313  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4228  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.49 
 
 
254 aa  85.5  9e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3538  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.66 
 
 
259 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0177311  normal  0.151964 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4199  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.87 
 
 
266 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.308915  normal  0.0922746 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3723  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.08 
 
 
266 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.662669  normal  0.858524 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.1 
 
 
277 aa  84.7  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.29 
 
 
273 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3183  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.52 
 
 
260 aa  84  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1572  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.96 
 
 
263 aa  84.3  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.577459 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.82 
 
 
269 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.377978 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>