More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4507 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4507  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
295 aa  584  1e-166  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1862  alpha/beta hydrolase fold  82.94 
 
 
301 aa  490  9.999999999999999e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308971  normal  0.897259 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13510  peroxidase bpoA (non-haem peroxidase)  70.67 
 
 
289 aa  402  1e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1777  alpha/beta hydrolase fold  50.72 
 
 
291 aa  261  6.999999999999999e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0284717 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5402  alpha/beta hydrolase fold  46.26 
 
 
286 aa  247  2e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5311  alpha/beta hydrolase fold  46.91 
 
 
285 aa  239  4e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.106317 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2766  non-heme peroxidase  46.74 
 
 
293 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.28291 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4458  alpha/beta hydrolase fold  48.72 
 
 
302 aa  231  8.000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2250  alpha/beta hydrolase fold protein  45.07 
 
 
292 aa  222  4e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4609  alpha/beta hydrolase fold  42.41 
 
 
294 aa  219  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.235001  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7313  Alpha/beta hydrolase fold  45.99 
 
 
303 aa  219  5e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1365  alpha/beta hydrolase  45.82 
 
 
290 aa  215  5.9999999999999996e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3907  alpha/beta hydrolase fold  42.86 
 
 
294 aa  215  5.9999999999999996e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2096  alpha/beta hydrolase fold  39.66 
 
 
290 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.52093  normal  0.167785 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0994  alpha/beta hydrolase fold  45.26 
 
 
285 aa  214  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131767  normal  0.180783 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4320  alpha/beta hydrolase fold  44.61 
 
 
312 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.194736 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4090  alpha/beta hydrolase fold  44.61 
 
 
312 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0153093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4166  alpha/beta hydrolase fold  44.61 
 
 
312 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11146  peroxidase bpoB (non-haem peroxidase)  40.42 
 
 
302 aa  204  2e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.354208  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4592  alpha/beta hydrolase fold  44.72 
 
 
296 aa  199  5e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3232  alpha/beta hydrolase fold  44.52 
 
 
303 aa  199  5e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118412  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3221  alpha/beta hydrolase fold  44.52 
 
 
303 aa  199  5e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3283  alpha/beta hydrolase fold  44.52 
 
 
303 aa  199  5e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.115306  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3026  alpha/beta hydrolase fold  44.95 
 
 
299 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281875  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0315  alpha/beta hydrolase fold  43.79 
 
 
300 aa  196  3e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4622  alpha/beta hydrolase fold  43.06 
 
 
299 aa  192  8e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.772942 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5259  alpha/beta hydrolase fold  42.4 
 
 
288 aa  191  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.956924  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1033  alpha/beta hydrolase fold  40.51 
 
 
280 aa  180  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0702791 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7311  Alpha/beta hydrolase  40.5 
 
 
303 aa  177  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.602855  normal  0.723346 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3063  alpha/beta hydrolase fold  43.19 
 
 
305 aa  171  1e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.41057  normal  0.789243 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01664  hydrolase, alpha/beta fold family, putative  41.26 
 
 
272 aa  156  4e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.178176  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0890  flavin reductase-like, FMN-binding  32.61 
 
 
408 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5586  alpha/beta hydrolase fold  35.71 
 
 
326 aa  110  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5753  alpha/beta hydrolase fold  31.32 
 
 
298 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.766272  normal  0.921974 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5466  alpha/beta hydrolase fold  30.96 
 
 
298 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0306241 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5377  alpha/beta hydrolase fold  30.96 
 
 
298 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5071  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 
258 aa  89  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.1456  normal  0.556154 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0691  alpha/beta hydrolase  27.47 
 
 
290 aa  87.8  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.363782  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3012  alpha/beta hydrolase fold protein  28.36 
 
 
257 aa  86.3  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0865  alpha/beta hydrolase fold  31 
 
 
298 aa  85.5  9e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2704  alpha/beta hydrolase fold  28.71 
 
 
309 aa  84  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0111794  normal  0.0557038 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6042  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
298 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.567915  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10044  hydrolase  29.97 
 
 
298 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0871  alpha/beta fold family hydrolase  24.52 
 
 
285 aa  79.7  0.00000000000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0195486  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2070  alpha/beta hydrolase  29.35 
 
 
299 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.169747  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1573  hypothetical protein  28.57 
 
 
323 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2538  alpha/beta hydrolase fold  28.37 
 
 
306 aa  77.4  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.257766  normal  0.634786 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0389  alpha/beta hydrolase fold  25.89 
 
 
327 aa  76.3  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.362666  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  28.91 
 
 
285 aa  75.9  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1272  Alpha/beta hydrolase fold  26.46 
 
 
294 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6488  alpha/beta hydrolase fold  32.25 
 
 
299 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1898  alpha/beta hydrolase fold  29.78 
 
 
300 aa  74.3  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.033526 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6723  alpha/beta hydrolase fold  32.25 
 
 
299 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4612  Alpha/beta hydrolase  29.47 
 
 
298 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00157572  normal  0.939787 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1561  alpha/beta hydrolase fold protein  27.52 
 
 
306 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0621  alpha/beta hydrolase fold  27.87 
 
 
277 aa  73.6  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.600914  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2586  alpha/beta hydrolase fold protein  28.67 
 
 
319 aa  73.2  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0132974  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28822  predicted protein  29.32 
 
 
386 aa  72.8  0.000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1396  alpha/beta hydrolase fold  28.06 
 
 
298 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340628  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1577  putative hydrolase protein  29.14 
 
 
296 aa  72  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4943  alpha/beta hydrolase fold  29.17 
 
 
290 aa  72  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1337  alpha/beta hydrolase fold  27.05 
 
 
289 aa  71.6  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.432487  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4821  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 
277 aa  70.9  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1650  alpha/beta hydrolase fold protein  26.32 
 
 
289 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547681  normal  0.133919 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1980  alpha/beta hydrolase fold  26.69 
 
 
289 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  29.17 
 
 
289 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1449  alpha/beta hydrolase fold  28.67 
 
 
298 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00111957  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0989  alpha/beta hydrolase fold  28.67 
 
 
298 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.160444  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1471  alpha/beta hydrolase fold  28.67 
 
 
298 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1368  putative hydrolase  26.64 
 
 
304 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04345  alpha/beta superfamily hydrolase  24.05 
 
 
253 aa  70.5  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.660124  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  26.87 
 
 
300 aa  69.7  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0351  putative hydrolase/acyltransferase  29.57 
 
 
259 aa  69.7  0.00000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2855  alpha/beta hydrolase fold  30.53 
 
 
335 aa  69.7  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0521635  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3996  alpha/beta hydrolase fold  26.91 
 
 
277 aa  68.6  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  27.99 
 
 
267 aa  68.6  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2781  alpha/beta hydrolase fold  29.12 
 
 
261 aa  68.6  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4365  alpha/beta hydrolase fold  30.71 
 
 
292 aa  68.6  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.127883 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1790  alpha/beta hydrolase fold  29.85 
 
 
268 aa  68.2  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.911201  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2707  Alpha/beta hydrolase fold  28.73 
 
 
264 aa  67.8  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0492  alpha/beta hydrolase fold  36.03 
 
 
313 aa  67.4  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1356  alpha/beta hydrolase fold  28.37 
 
 
297 aa  67  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0785  alpha/beta hydrolase fold  28.79 
 
 
302 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3150  alpha/beta hydrolase fold  28.83 
 
 
311 aa  66.2  0.0000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2058  alpha/beta hydrolase fold protein  31.4 
 
 
292 aa  66.2  0.0000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0070331  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1782  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 
298 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.7573  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2701  putative hydrolase / acyltransferase  27.8 
 
 
274 aa  64.3  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0043  alpha/beta hydrolase fold  35.09 
 
 
301 aa  64.7  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2497  alpha/beta hydrolase fold protein  28.1 
 
 
311 aa  63.9  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1659  alpha/beta hydrolase  29.34 
 
 
277 aa  63.9  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0254328  normal  0.757582 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  27.47 
 
 
266 aa  63.5  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0263  Alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 
266 aa  63.5  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191481  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0827  cation diffusion facilitator family transporter  25.3 
 
 
626 aa  63.5  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3317  putative hydrolase or acyltransferase  24.91 
 
 
296 aa  63.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2243  alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 
274 aa  63.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.134722  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1012  cation diffusion facilitator family transporter  24.62 
 
 
607 aa  62.8  0.000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1692  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 
239 aa  62.8  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.155751 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3421  putative hydrolase or acyltransferase  24.91 
 
 
296 aa  62.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0121666 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1646  alpha/beta hydrolase fold  30.86 
 
 
292 aa  62.4  0.000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.969824  normal  0.0462381 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1513  Alpha/beta hydrolase fold  26.37 
 
 
293 aa  62.4  0.000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>