More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4501 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4501  amine oxidase  100 
 
 
446 aa  883    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129259  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1866  amine oxidase  79.78 
 
 
447 aa  725    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.591896  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  72.52 
 
 
450 aa  622  1e-177  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  72.52 
 
 
450 aa  622  1e-177  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1526  amine oxidase (flavin-containing)  71.98 
 
 
439 aa  603  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.028024  normal  0.955332 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13191  flavin-containing monoamine oxidase aofH  65.14 
 
 
454 aa  536  1e-151  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.28865 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2472  amine oxidase  45.07 
 
 
459 aa  355  6.999999999999999e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3628  amine oxidase  42.35 
 
 
465 aa  316  6e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.533226  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0389  amine oxidase  39.6 
 
 
449 aa  297  3e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.22597  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4000  amine oxidase (flavin-containing)  39.08 
 
 
499 aa  270  4e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.812077  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2259  amine oxidase  37.84 
 
 
459 aa  254  2.0000000000000002e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00770255  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0141  amine oxidase (flavin-containing)  36.4 
 
 
452 aa  253  4.0000000000000004e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2005  amine oxidase  37.75 
 
 
492 aa  252  9.000000000000001e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4356  amine oxidase  37.05 
 
 
493 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5037  amine oxidase (flavin-containing)  37.28 
 
 
493 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5823  amine oxidase (flavin-containing)  37.28 
 
 
493 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105573  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4441  Amine oxidase (flavin-containing)  36.2 
 
 
498 aa  248  1e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.358617 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4331  Amine oxidase (flavin-containing)  36.2 
 
 
498 aa  248  1e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0789189 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6829  amine oxidase  37.03 
 
 
492 aa  248  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.423551  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  34.69 
 
 
456 aa  245  9.999999999999999e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4367  amine oxidase (flavin-containing)  37.03 
 
 
494 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1178  amine oxidase  35.37 
 
 
454 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0392628  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5048  twin-arginine translocation pathway signal  37.03 
 
 
578 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5812  amine oxidase; FAD dependent oxidoreductase  37.03 
 
 
494 aa  243  5e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.377478  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5578  amine oxidase (flavin-containing)  35.19 
 
 
456 aa  240  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1230  amine oxidase (flavin-containing)  35.07 
 
 
457 aa  239  8e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.333981  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2738  amine oxidase  34.86 
 
 
494 aa  237  3e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6401  twin-arginine translocation pathway signal  34.21 
 
 
493 aa  231  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6833  amine oxidase  34.97 
 
 
532 aa  231  3e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.574218  normal  0.40808 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4452  Amine oxidase (flavin-containing)  35.84 
 
 
498 aa  228  2e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.383006  normal  0.183412 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2742  twin-arginine translocation pathway signal  34.42 
 
 
490 aa  228  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00724146  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0369  putative flavin-containing monoamine oxidase  36.81 
 
 
484 aa  227  3e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.431172 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2278  amine oxidase  29.72 
 
 
464 aa  215  1.9999999999999998e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.381011  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  34.46 
 
 
463 aa  213  7.999999999999999e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0838  Putrescine oxidase  35.54 
 
 
463 aa  206  1e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272774  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2065  amine oxidase  34.25 
 
 
458 aa  203  5e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  33.26 
 
 
462 aa  202  8e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5789  amine oxidase  35.27 
 
 
444 aa  200  5e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1822  amine oxidase  35.31 
 
 
445 aa  192  1e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0745  amine oxidase (flavin-containing)  28.98 
 
 
469 aa  186  7e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1906  amine oxidase (flavin-containing)  31.01 
 
 
487 aa  175  9.999999999999999e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.46762  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10320  monoamine oxidase  29.11 
 
 
510 aa  169  1e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05890  conserved hypothetical protein  29.55 
 
 
492 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.314478  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03291  flavin-containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00100)  26.97 
 
 
457 aa  135  9.999999999999999e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0113455 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0682  Putrescine oxidase  30.66 
 
 
512 aa  134  3e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.016891  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  27.31 
 
 
479 aa  117  6e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7453  amine oxidase  32.1 
 
 
438 aa  114  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0863551  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3508  amine oxidase  26.83 
 
 
435 aa  105  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  24.67 
 
 
436 aa  104  3e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2975  amine oxidase  26.91 
 
 
480 aa  102  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2268  amine oxidase  25.94 
 
 
431 aa  95.9  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1155  hypothetical protein  24.39 
 
 
495 aa  92.4  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3776  amine oxidase  31.25 
 
 
352 aa  92  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.435082 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02566  conserved hypothetical protein  28.85 
 
 
510 aa  91.3  3e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.676497 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4388  amine oxidase  31.35 
 
 
445 aa  91.3  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48846  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1150  amine oxidase  25.36 
 
 
491 aa  90.9  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0586  amine oxidase  26.8 
 
 
427 aa  90.1  7e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5074  amine oxidase, flavin-containing protein  24.83 
 
 
625 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1160  hypothetical protein  24.39 
 
 
495 aa  89.7  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5286  amine oxidase  24.44 
 
 
592 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.456502  normal  0.921895 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2753  amine oxidase  30.17 
 
 
352 aa  87.4  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.394653  normal  0.0187617 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2278  amine oxidase  29.33 
 
 
435 aa  86.7  8e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.682646 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0455  amine oxidase  24.3 
 
 
624 aa  86.3  9e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5079  amine oxidase  23.6 
 
 
459 aa  86.7  9e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.392573 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0521  hypothetical protein  25.62 
 
 
496 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4699  amine oxidase  21.62 
 
 
445 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.472473 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6047  amine oxidase  25.9 
 
 
353 aa  84.3  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.629217  normal  0.078923 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0482  amine oxidase  24.89 
 
 
565 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5032  amine oxidase  24.39 
 
 
616 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05480  hypothetical protein  25.39 
 
 
496 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4856  amine oxidase  24.61 
 
 
619 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.314626  normal  0.125904 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4983  amine oxidase  24.61 
 
 
619 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5603  amine oxidase, flavin-containing  26.92 
 
 
492 aa  80.1  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.296815  normal  0.150795 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1319  amine oxidase  28.32 
 
 
470 aa  78.6  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4155  amine oxidase (flavin-containing)  27.52 
 
 
465 aa  77.8  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.326684  normal  0.0591967 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1799  amine oxidase  22.01 
 
 
482 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0946  UDP-galactopyranose mutase  24.45 
 
 
495 aa  77  0.0000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0266  amine oxidase  30.47 
 
 
361 aa  75.9  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000119304  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5977  amine oxidase  24.36 
 
 
350 aa  75.1  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2381  amine oxidase  25.22 
 
 
496 aa  75.1  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.325197  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1785  amine oxidase flavin-containing  22.15 
 
 
478 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.162076  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1924  amine oxidase, flavin-containing  22.15 
 
 
478 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00199174  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07013  oxidoreductase  21.93 
 
 
365 aa  72.8  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0981  putative flavin containing amine oxidoreductase  28.86 
 
 
368 aa  71.6  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2925  amine oxidase  27.59 
 
 
418 aa  71.6  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183611  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3289  amine oxidase, flavin-containing  22.76 
 
 
487 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1349  amine oxidase  28.1 
 
 
468 aa  70.5  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3839  amine oxidase  27.89 
 
 
367 aa  70.1  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05276  Putative monoamine oxidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B2F4]  24.03 
 
 
492 aa  70.1  0.00000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2020  amine oxidase, flavin-containing  22.34 
 
 
487 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4453  amine oxidase  25.46 
 
 
443 aa  69.3  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03220  flavin-containing mono amine oxidase  25.55 
 
 
491 aa  69.7  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.158318  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1742  amine oxidase, flavin-containing  21.87 
 
 
478 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5972  amine oxidase  24.69 
 
 
349 aa  68.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.824241  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1377  amine oxidase  30.04 
 
 
382 aa  68.6  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2710  twin-arginine translocation pathway signal  22.89 
 
 
469 aa  68.6  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1960  amine oxidase, flavin-containing  20.85 
 
 
478 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000207748 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23100  squalene-associated FAD-dependent desaturase  27.19 
 
 
439 aa  67  0.0000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.620646  normal  0.191871 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2053  amine oxidase, flavin-containing  21.71 
 
 
487 aa  67  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2018  amine oxidase, flavin-containing  21.71 
 
 
482 aa  67  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>