More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4482 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4482  NADH dehydrogenase subunit B  100 
 
 
184 aa  378  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00198426 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1884  NADH dehydrogenase subunit B  97.83 
 
 
184 aa  372  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1579  NADH dehydrogenase subunit B  94.02 
 
 
184 aa  361  3e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1549  NADH dehydrogenase subunit B  94.02 
 
 
184 aa  361  3e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0528108  normal  0.21195 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13167  NADH dehydrogenase subunit B  91.85 
 
 
184 aa  333  7e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0400  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  84.24 
 
 
184 aa  328  3e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2694  NADH dehydrogenase subunit B  80.9 
 
 
185 aa  310  1e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3169  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  83.7 
 
 
184 aa  307  7e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.242992  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7690  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  81.52 
 
 
184 aa  305  2e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2715  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  76.09 
 
 
183 aa  299  1e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0268  NADH dehydrogenase subunit B  76.63 
 
 
184 aa  298  3e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.220523  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0521  NADH dehydrogenase subunit B  75.54 
 
 
184 aa  297  5e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0585  NADH dehydrogenase (quinone)  76.4 
 
 
183 aa  293  9e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0282  NADH-quinone oxidoreductase subunit B  76.4 
 
 
183 aa  293  9e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5054  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  79.17 
 
 
181 aa  291  2e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1275  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  79.76 
 
 
216 aa  290  1e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99313  normal  0.170871 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0470  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  76.09 
 
 
183 aa  289  2e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.677887  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4417  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  74.86 
 
 
183 aa  288  3e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07390  NADH dehydrogenase subunit B  77.17 
 
 
183 aa  286  1e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03170  NADH dehydrogenase subunit B  75.57 
 
 
182 aa  281  4e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.739873 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0540  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  69.95 
 
 
183 aa  278  3e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.687461  normal  0.404608 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3228  NADH dehydrogenase subunit B  74.32 
 
 
184 aa  278  4e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.64554  normal  0.0125062 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4557  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  71.74 
 
 
226 aa  277  7e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.770439  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0975  NADH dehydrogenase subunit B  79.01 
 
 
199 aa  275  3e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6093  NADH dehydrogenase subunit B  82.67 
 
 
264 aa  272  2e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.024124 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6681  NADH dehydrogenase subunit B  78.62 
 
 
182 aa  272  2e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0539  NADH dehydrogenase subunit B  80 
 
 
271 aa  271  5e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.573079  normal  0.187495 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4064  NADH dehydrogenase subunit B  77.85 
 
 
226 aa  266  1e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.108394 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4462  NADH dehydrogenase subunit B  77.22 
 
 
226 aa  266  1e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0364  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  68.87 
 
 
180 aa  231  5e-60  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1876  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  67.61 
 
 
179 aa  223  1e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.522368  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0910  NADH dehydrogenase subunit B  66.9 
 
 
178 aa  222  2e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.617047 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1282  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  66.9 
 
 
179 aa  222  3e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2252  NADH dehydrogenase subunit B  65.49 
 
 
213 aa  216  2e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3677  NADH dehydrogenase subunit B  58.79 
 
 
167 aa  215  3e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974896 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1323  NADH dehydrogenase subunit B  61.11 
 
 
167 aa  214  4e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1048  NADH dehydrogenase subunit B  60.61 
 
 
174 aa  214  7e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.675921  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3080  NADH dehydrogenase subunit B  64.71 
 
 
179 aa  213  1e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0688011  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3358  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  60.39 
 
 
202 aa  207  7e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3137  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  57.24 
 
 
169 aa  202  3e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  7.06512e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0924  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  61.33 
 
 
200 aa  201  4e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_795  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  61.07 
 
 
200 aa  201  4e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0808  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  61.07 
 
 
200 aa  201  6e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3925  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  56.67 
 
 
170 aa  197  7e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000298768  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3750  NADH dehydrogenase subunit B  61.11 
 
 
173 aa  197  8e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.75959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4009  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  56 
 
 
170 aa  196  1e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.02735e-29 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4243  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  55.92 
 
 
170 aa  196  2e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  1.57448e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1150  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  52.81 
 
 
229 aa  195  4e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0339  NADH dehydrogenase I, B subunit  54.61 
 
 
170 aa  194  6e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000262724  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1630  NADH dehydrogenase subunit B  52.87 
 
 
264 aa  194  6e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.298148  normal  0.626931 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0978  NADH dehydrogenase subunit B  59.46 
 
 
166 aa  192  2e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3354  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 20 kDa subunit  54.61 
 
 
170 aa  192  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.91107e-12  hitchhiker  0.00879289 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0158  NADH-quinone oxidoreductase chain b  51.97 
 
 
168 aa  191  6e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3412  NADH dehydrogenase subunit B  57.43 
 
 
170 aa  190  8e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2990  NADH dehydrogenase subunit B  51.72 
 
 
268 aa  190  8e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.484766  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2812  NADH dehydrogenase subunit B  53.64 
 
 
159 aa  190  9e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.252149 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0485  NADH dehydrogenase subunit B  54.84 
 
 
171 aa  189  2e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.130232 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0139  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  57.43 
 
 
169 aa  189  2e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2089  NADH dehydrogenase subunit B  53.75 
 
 
268 aa  189  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.580688  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7018  NADH dehydrogenase subunit B  51.28 
 
 
187 aa  189  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5390  NADH dehydrogenase subunit B  56.46 
 
 
172 aa  188  4e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90605e-23 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5530  NADH dehydrogenase subunit B  56.46 
 
 
172 aa  188  4e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000187843 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5420  NADH dehydrogenase subunit B  56.46 
 
 
172 aa  188  4e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.73799  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5541  NADH dehydrogenase subunit B  56.46 
 
 
172 aa  188  4e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.511689  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3818  NADH dehydrogenase subunit B  55.03 
 
 
172 aa  188  4e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4999  NADH dehydrogenase subunit B  56.46 
 
 
179 aa  188  4e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5475  NADH dehydrogenase subunit B  56.46 
 
 
172 aa  188  4e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4981  NADH dehydrogenase subunit B  56.46 
 
 
179 aa  188  4e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5149  NADH dehydrogenase subunit B  56.46 
 
 
179 aa  188  4e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5424  NADH dehydrogenase subunit B  56.46 
 
 
172 aa  188  4e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0160  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  51.66 
 
 
794 aa  187  5e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.155081 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5097  NADH dehydrogenase subunit B  56.46 
 
 
172 aa  188  5e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3622  NADH dehydrogenase subunit B  52.67 
 
 
167 aa  187  6e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.623908  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2157  NADH dehydrogenase subunit B  52.1 
 
 
193 aa  187  7e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00451511 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1264  NADH dehydrogenase subunit B  52.98 
 
 
159 aa  187  7e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.233516 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0873  NADH dehydrogenase subunit B  52.98 
 
 
159 aa  187  8e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.650133  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0178  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  51.66 
 
 
794 aa  187  8e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0958  NADH dehydrogenase subunit B  52.98 
 
 
159 aa  187  8e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000268179 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3857  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  53.69 
 
 
230 aa  187  9e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1502  NADH dehydrogenase subunit B  56.21 
 
 
158 aa  187  9e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0088151 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5179  NADH dehydrogenase subunit B  52.32 
 
 
159 aa  186  1e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1404  NADH dehydrogenase subunit B  55.56 
 
 
158 aa  187  1e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0763346  normal  0.811517 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2060  NADH dehydrogenase subunit B  54.25 
 
 
158 aa  187  1e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3300  NADH dehydrogenase subunit B  54.3 
 
 
170 aa  186  1e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0987  NADH dehydrogenase subunit B  54.9 
 
 
158 aa  187  1e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.739675  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1381  NADH dehydrogenase subunit B  52 
 
 
181 aa  186  2e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.186905  normal  0.991286 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1963  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  54.25 
 
 
159 aa  186  2e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  5.04024e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2835  NADH dehydrogenase subunit B  53.21 
 
 
158 aa  185  3e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2704  NADH dehydrogenase subunit B  53.21 
 
 
158 aa  185  3e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2564  NADH dehydrogenase subunit B  53.59 
 
 
158 aa  185  3e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0818  NADH dehydrogenase subunit B  52.94 
 
 
158 aa  185  3e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00543659  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0744  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  66.92 
 
 
191 aa  185  3e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.167949 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1664  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.5 
 
 
183 aa  185  4e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1245  NADH dehydrogenase subunit B  51.05 
 
 
182 aa  185  4e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4981  NADH dehydrogenase subunit B  55.92 
 
 
250 aa  184  5e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  4.83357e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4081  NADH dehydrogenase subunit B  49.69 
 
 
180 aa  184  7e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.343571  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0950  NADH dehydrogenase subunit B  52.94 
 
 
158 aa  184  9e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0972476  normal  0.726219 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0822  NADH dehydrogenase subunit B  53.59 
 
 
160 aa  183  1e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0153  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  51.68 
 
 
791 aa  183  1e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1050  NADH dehydrogenase subunit B  53.59 
 
 
160 aa  183  1e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>