More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4474 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4474  regulatory protein, LuxR  100 
 
 
977 aa  1909  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0017385 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1863  regulatory protein, LuxR  43.93 
 
 
919 aa  585  1e-165  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12017  normal  0.973352 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5653  regulatory protein, LuxR  45.09 
 
 
921 aa  579  1e-164  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794643  normal  0.376605 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4504  regulatory protein, LuxR  43.68 
 
 
929 aa  577  1e-163  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0780  LuxR family transcriptional regulator  42.17 
 
 
921 aa  553  1e-156  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0776  regulatory protein, LuxR  42.07 
 
 
921 aa  552  1e-156  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0795  regulatory protein, LuxR  42.17 
 
 
921 aa  553  1e-156  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397823  normal  0.131546 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0566  LuxR family transcriptional regulator  40.24 
 
 
919 aa  524  1e-147  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0578  regulatory protein, LuxR  40.24 
 
 
919 aa  524  1e-147  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353611  normal  0.0294129 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0556  regulatory protein, LuxR  40.02 
 
 
919 aa  521  1e-146  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1156  regulatory protein, LuxR  42.27 
 
 
900 aa  507  1e-142  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0131958 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  39.09 
 
 
919 aa  131  5e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0968  transcriptional regulator, LuxR family  28.9 
 
 
938 aa  127  8e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9261  ATPase-like protein  33.76 
 
 
884 aa  126  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5515  response regulator receiver protein  34.18 
 
 
879 aa  121  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0430285  normal  0.701277 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0222  transcriptional regulator, LuxR family  28.31 
 
 
918 aa  112  2e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.847237  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0012  transcriptional regulator, LuxR family  34.28 
 
 
928 aa  110  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111668  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1892  transcriptional regulator, LuxR family  32.81 
 
 
997 aa  106  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2085  LuxR family ATP-dependent transcriptional regulator  35.27 
 
 
913 aa  102  4e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.741908 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27950  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  30.37 
 
 
923 aa  102  5e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.81499  normal  0.031015 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4197  transcriptional regulator, LuxR family  30.71 
 
 
998 aa  101  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5780  ATPase-like protein  32.92 
 
 
884 aa  101  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.673084  normal  0.283038 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1706  transcriptional regulator, LuxR family  33.49 
 
 
913 aa  99.8  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1778  regulatory protein, LuxR  36.05 
 
 
917 aa  99.8  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4682  transcriptional regulator, LuxR family  37.69 
 
 
940 aa  99  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1300  transcriptional regulator, LuxR family  36.99 
 
 
910 aa  98.6  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2594  transcriptional regulator, LuxR family  36.29 
 
 
920 aa  97.8  8e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1351  response regulator receiver protein  40.97 
 
 
189 aa  97.8  8e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  0.574707 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3625  transcriptional regulator, LuxR family  30.55 
 
 
925 aa  96.7  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1388  LuxR family transcriptional regulator  40.28 
 
 
881 aa  95.9  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315811  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1404  LuxR family transcriptional regulator  40.28 
 
 
876 aa  95.5  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1370  LuxR family transcriptional regulator  40.28 
 
 
881 aa  95.9  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2323  regulatory protein LuxR  38.05 
 
 
955 aa  95.5  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6795  LuxR family transcriptional regulator  45.11 
 
 
889 aa  95.1  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.26152  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4229  transcriptional regulator, LuxR family  36.23 
 
 
923 aa  94.4  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.099423 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4595  transcriptional regulator, LuxR family  39.34 
 
 
995 aa  94  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131343  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3616  transcriptional regulator, LuxR family  33.57 
 
 
923 aa  93.6  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2311  regulatory protein LuxR  29.67 
 
 
922 aa  93.6  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3871  regulatory protein, LuxR  39.77 
 
 
913 aa  92.8  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.760244  normal  0.907756 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5019  transcriptional regulator, LuxR family  39.01 
 
 
916 aa  92.8  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.385321 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4161  regulatory protein LuxR  33.64 
 
 
893 aa  89.4  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.339617  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2325  regulatory protein LuxR  37.93 
 
 
923 aa  89.4  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5142  transcriptional regulator, LuxR family  35.29 
 
 
953 aa  89  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2729  regulatory protein LuxR  29.46 
 
 
892 aa  88.6  6e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.805372  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0135  transcriptional regulator, LuxR family  36.56 
 
 
1052 aa  87.8  1e-15  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8709  ATPase-like protein  34.87 
 
 
928 aa  87.4  1e-15  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  27.6 
 
 
1006 aa  86.7  2e-15  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0388  transcriptional regulator, LuxR family  39.51 
 
 
916 aa  85.9  3e-15  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0286476 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  41.27 
 
 
894 aa  85.9  4e-15  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1970  transcriptional regulator, LuxR family  33.24 
 
 
835 aa  85.9  4e-15  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  1.57383e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3894  transcriptional regulator, LuxR family  35.71 
 
 
897 aa  85.1  6e-15  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2697  transcriptional regulator, LuxR family  33.43 
 
 
910 aa  84.7  7e-15  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.280211 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2417  transcriptional regulator, LuxR family  37.31 
 
 
998 aa  82  5e-14  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0109186  decreased coverage  0.00199562 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3419  transcriptional regulator, LuxR family  34.47 
 
 
909 aa  81.3  8e-14  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00522021 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4236  transcriptional regulator, LuxR family  31.92 
 
 
905 aa  80.9  1e-13  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427598  normal  0.524249 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3893  transcriptional regulator, LuxR family  45.04 
 
 
904 aa  80.9  1e-13  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0415  transcriptional regulator, LuxR family  34.72 
 
 
911 aa  80.5  1e-13  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5305  regulatory protein, LuxR  34.38 
 
 
937 aa  79.7  2e-13  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4923  LuxR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
937 aa  80.1  2e-13  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.360996  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5012  regulatory protein, LuxR  34.38 
 
 
937 aa  80.1  2e-13  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2276  transcriptional regulator, LuxR family  39.83 
 
 
928 aa  79.3  3e-13  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.169085  normal  0.573117 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0265  transcriptional regulator, LuxR family  43.9 
 
 
946 aa  78.2  7e-13  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693441  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2291  regulatory protein LuxR  29.28 
 
 
934 aa  78.2  8e-13  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5333  transcriptional regulator, LuxR family  29.2 
 
 
992 aa  77.8  8e-13  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3624  transcriptional regulator, LuxR family  36.72 
 
 
927 aa  77.4  1e-12  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0361  LuxR family transcriptional regulator  29.74 
 
 
973 aa  77.4  1e-12  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2467  transcriptional regulator, LuxR family  33.72 
 
 
915 aa  76.6  2e-12  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000112421  hitchhiker  0.00668806 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5449  regulatory protein, LuxR  32.66 
 
 
929 aa  76.3  3e-12  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.651418  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3277  transcriptional regulator, LuxR family  26.39 
 
 
970 aa  75.5  4e-12  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.737282  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0437  LuxR family transcriptional regulator  35.37 
 
 
544 aa  74.7  7e-12  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.139362  normal  0.0303285 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0427  LuxR family transcriptional regulator  35.37 
 
 
544 aa  74.7  7e-12  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1214  regulatory protein, LuxR  29.11 
 
 
930 aa  74.7  9e-12  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.428987 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0414  LuxR family transcriptional regulator  35.37 
 
 
544 aa  74.3  9e-12  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.865726 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3297  transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 
908 aa  74.3  1e-11  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.19391  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5782  transcriptional regulator, LuxR family  42.15 
 
 
974 aa  73.9  1e-11  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.239906  normal  0.713448 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5023  transcriptional regulator, LuxR family  29.83 
 
 
982 aa  73.2  2e-11  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1126  transcriptional regulator, LuxR family  40.5 
 
 
951 aa  73.6  2e-11  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.590234  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3668  response regulator receiver protein  32.26 
 
 
541 aa  73.6  2e-11  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.563914  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4086  transcriptional regulator, LuxR family  36.18 
 
 
959 aa  72.8  3e-11  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.105743  hitchhiker  0.000559176 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1757  transcriptional regulator, LuxR family  24.93 
 
 
993 aa  72.4  4e-11  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.790916  normal  0.333807 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1559  ATPase-like protein  28.4 
 
 
916 aa  72.4  4e-11  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1429  transcriptional regulator, LuxR family  38.21 
 
 
932 aa  71.6  6e-11  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4205  ATPase-like protein  32.35 
 
 
963 aa  71.2  9e-11  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181289  hitchhiker  0.00519851 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5002  regulatory protein, LuxR  38.79 
 
 
940 aa  71.2  1e-10  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2609  transcriptional regulator, LuxR family  29.17 
 
 
562 aa  70.9  1e-10  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  3.0036e-05  hitchhiker  0.00837555 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1890  transcriptional regulator, LuxR family  39.5 
 
 
929 aa  69.7  2e-10  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506714  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6796  transcriptional regulator  27.51 
 
 
1118 aa  69.7  2e-10  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5144  transcriptional regulator, LuxR family  36.52 
 
 
918 aa  69.3  3e-10  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0156919  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2286  regulatory protein LuxR  39.68 
 
 
961 aa  69.3  3e-10  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0281  transcriptional regulator, LuxR family  38.84 
 
 
947 aa  68.9  5e-10  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2326  ATP-dependent transcription regulator LuxR  43.69 
 
 
981 aa  68.6  6e-10  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00645479 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3533  transcriptional regulator, LuxR family  29.68 
 
 
1064 aa  68.6  6e-10  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3490  LuxR family transcriptional regulator  30.73 
 
 
950 aa  68.2  7e-10  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.123756  normal  0.368778 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7187  transcriptional regulator  29.38 
 
 
1198 aa  68.2  8e-10  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3038  LuxR family transcriptional regulator  29.69 
 
 
950 aa  67.8  9e-10  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4558  transcriptional regulator, LuxR family  32.16 
 
 
952 aa  67.8  9e-10  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.025168  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4559  LuxR family transcriptional regulator  38.33 
 
 
877 aa  67.4  1e-09  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4724  transcriptional activator domain-containing protein  25.71 
 
 
713 aa  66.6  2e-09  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8714  response regulator receiver protein  35.83 
 
 
936 aa  65.9  3e-09  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2041  transcriptional regulator, LuxR family  32.99 
 
 
927 aa  66.2  3e-09  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111867  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>