282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4278 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4278  periplasmic binding protein  100 
 
 
405 aa  800    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.170406  normal  0.771045 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2081  periplasmic binding protein  80.16 
 
 
380 aa  563  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.754693 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1832  periplasmic binding protein  64.2 
 
 
353 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.136123  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1851  periplasmic binding protein  64.2 
 
 
353 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1898  periplasmic binding protein  64.2 
 
 
353 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13060  Fe(III)-dicitrate-binding periplasmic lipoprotein fecB  59.6 
 
 
359 aa  388  1e-106  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0425065 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3525  periplasmic binding protein  35.25 
 
 
310 aa  140  4.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.476755  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1784  hypothetical protein  34.52 
 
 
309 aa  136  8e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.933909 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3282  periplasmic binding protein  32.28 
 
 
329 aa  129  7.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4123  periplasmic binding protein  32.44 
 
 
346 aa  124  3e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0413  periplasmic binding protein  30.8 
 
 
319 aa  119  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2283  substrate-binding family protein, putative  28.43 
 
 
321 aa  117  5e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00918063  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2078  periplasmic binding protein  28.16 
 
 
320 aa  116  6e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0923581  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2011  periplasmic binding protein  29.93 
 
 
662 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00756421  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2422  periplasmic binding protein  33.57 
 
 
300 aa  114  3e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1987  periplasmic binding protein  24.92 
 
 
324 aa  113  6e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125239  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2036  iron(III) dicitrate-binding protein  27.48 
 
 
320 aa  113  6e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000010516  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2038  iron(III) dicitrate-binding protein  27.22 
 
 
320 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000324878  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0778  lipoprotein  27.4 
 
 
316 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.662712  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2099  substrate-binding family protein  26.9 
 
 
320 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000270129  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2280  putative iron compound-binding protein  26.9 
 
 
320 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1737099999999999e-45 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2255  substrate-binding family protein  26.9 
 
 
320 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00818777  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2264  periplasmic binding protein  26.91 
 
 
324 aa  111  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2365  putative iron compound-binding protein  26.58 
 
 
320 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00267184  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2237  putative iron compound-binding protein  27.46 
 
 
305 aa  108  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0793747  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3087  putative iron compound-binding protein  26.35 
 
 
320 aa  107  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.32473  hitchhiker  9.18537e-17 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0743  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.18 
 
 
321 aa  101  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4685  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.18 
 
 
322 aa  100  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0132289  hitchhiker  2.7045999999999996e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0652  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.18 
 
 
322 aa  100  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000476646  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2122  periplasmic binding protein  30.07 
 
 
298 aa  100  7e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10692  normal  0.278949 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0525  iron(III) dicitrate ABC transporter, periplasmic protein  25.18 
 
 
321 aa  99.8  8e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.3382899999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0670  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.18 
 
 
321 aa  99.8  8e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.07774e-37 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0683  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.82 
 
 
321 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0529  periplasmic binding protein  24.82 
 
 
322 aa  97.8  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00029355  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0581  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  24.82 
 
 
321 aa  96.7  6e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673134  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0615  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  24.82 
 
 
321 aa  96.7  6e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282355  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0525  iron(III) dicitrate ABC transporter, periplasmic protein  24.82 
 
 
321 aa  96.3  8e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000268482  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3654  periplasmic binding protein  33.92 
 
 
329 aa  95.9  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.841476  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2943  periplasmic binding protein  29.43 
 
 
305 aa  95.5  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.382264  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5759  periplasmic binding protein  29.41 
 
 
331 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30510  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  30.42 
 
 
326 aa  93.2  7e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.163783  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2440  periplasmic binding protein  28.62 
 
 
348 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000012115 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3865  periplasmic binding protein  30.8 
 
 
329 aa  90.5  4e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.900175  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7985  substrate-binding family protein, putative  30.11 
 
 
336 aa  89.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.428373  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2940  periplasmic binding protein  28.29 
 
 
316 aa  85.1  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1523  periplasmic binding protein  27.63 
 
 
313 aa  85.5  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0640  periplasmic binding protein  28 
 
 
337 aa  82.8  0.000000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.451068  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0133  periplasmic binding protein  26.45 
 
 
306 aa  82.8  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2699  periplasmic binding protein  27.21 
 
 
305 aa  76.3  0.0000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.885635  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1097  periplasmic binding protein  25.43 
 
 
319 aa  75.9  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000153945  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1119  periplasmic binding protein  25.43 
 
 
319 aa  75.9  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000565066  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2064  periplasmic binding protein  26.01 
 
 
313 aa  75.1  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2757  periplasmic binding protein  29.64 
 
 
309 aa  73.9  0.000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0106  periplasmic binding protein  26.85 
 
 
330 aa  73.2  0.000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100605  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0102  periplasmic binding protein  26.85 
 
 
330 aa  73.2  0.000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000014163  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0550  periplasmic binding protein  24.31 
 
 
313 aa  72.8  0.000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4780  periplasmic binding protein  27.27 
 
 
305 aa  72.8  0.000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06007  iron-dicitrate transporter substrate-binding subunit  28.37 
 
 
298 aa  72.4  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2754  periplasmic binding protein  29.21 
 
 
312 aa  72.8  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1806  periplasmic binding protein  26.6 
 
 
358 aa  72  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.455628  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2670  periplasmic binding protein  24.91 
 
 
272 aa  70.9  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4041  periplasmic binding protein  29.21 
 
 
341 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001069  iron(III) dicitrate transport system iron-binding protein fecB  27.56 
 
 
307 aa  69.7  0.00000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4510  periplasmic binding protein  24.36 
 
 
317 aa  69.7  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.145248 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0949  transferrin receptor  22.16 
 
 
336 aa  68.9  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0298481  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1777  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  22.51 
 
 
331 aa  69.3  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5173  periplasmic binding protein  24.49 
 
 
312 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0693  periplasmic binding protein  26.1 
 
 
306 aa  68.9  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5503  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.4 
 
 
312 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5448  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.4 
 
 
312 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4269  periplasmic binding protein  27.12 
 
 
314 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0364817  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2409  periplasmic binding protein  25.72 
 
 
333 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0140485  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3771  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  22.53 
 
 
321 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2207  periplasmic binding protein  27.92 
 
 
335 aa  68.2  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000185763 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3483  iron(III) dicitrate-binding protein  22.53 
 
 
321 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.243562  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3495  iron(III) dicitrate-binding protein  22.53 
 
 
321 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.889326  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3749  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  22.53 
 
 
321 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000167124 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1043  periplasmic binding protein  28.28 
 
 
340 aa  67.4  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2409  periplasmic binding protein  23.41 
 
 
322 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00436362  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3837  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  22.13 
 
 
321 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3787  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  22.53 
 
 
321 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.713768  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1462  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  22.13 
 
 
321 aa  67  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000294179 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3583  periplasmic binding protein (iron-binding protein)  22.64 
 
 
265 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3506  periplasmic binding protein  22.83 
 
 
321 aa  66.2  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474135  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5558  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.32 
 
 
311 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5229  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  25.2 
 
 
314 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5060  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.2 
 
 
314 aa  65.1  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.320975  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5077  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.2 
 
 
314 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1001  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, periplasmic vibriobactin/enterobactin-binding protein  32.6 
 
 
333 aa  65.5  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000270207  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5628  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  25.2 
 
 
314 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  26.07 
 
 
478 aa  65.5  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2413  periplasmic binding protein  34.04 
 
 
351 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.456703 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3188  iron compound ABC transporter, substrate-binding protein  28.21 
 
 
299 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.232401  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3038  periplasmic binding protein  26.95 
 
 
365 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2753  periplasmic binding protein  32.89 
 
 
315 aa  63.2  0.000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2416  periplasmic binding protein  26.94 
 
 
311 aa  63.2  0.000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2246  periplasmic binding protein  24.72 
 
 
327 aa  62.8  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.13483  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4069  periplasmic binding protein  31.32 
 
 
342 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.423894 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2208  periplasmic binding protein  24.72 
 
 
327 aa  62.8  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.970371  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  25.35 
 
 
483 aa  62  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>