49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4268 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4268  hypothetical protein  100 
 
 
372 aa  725  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229972  normal  0.945024 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2091  hypothetical protein  76.61 
 
 
381 aa  554  1e-156  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1860  hypothetical protein  70.35 
 
 
412 aa  512  1e-144  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.181101  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1907  hypothetical protein  70.35 
 
 
412 aa  512  1e-144  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1841  hypothetical protein  71.35 
 
 
369 aa  510  1e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13053  hypothetical protein  67.23 
 
 
358 aa  447  1e-124  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.150174 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6063  hypothetical protein  56.39 
 
 
383 aa  350  2e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28440  hypothetical protein  57.03 
 
 
399 aa  345  6e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3266  hypothetical protein  49.73 
 
 
399 aa  332  4e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2934  hypothetical protein  50.27 
 
 
382 aa  326  4e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3087  hypothetical protein  45.97 
 
 
416 aa  249  4e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000449393  hitchhiker  3.64534e-05 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1152  hypothetical protein  40.56 
 
 
388 aa  168  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3648  hypothetical protein  40.23 
 
 
388 aa  165  1e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4027  hypothetical protein  38.24 
 
 
428 aa  161  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0077  hypothetical protein  34.62 
 
 
392 aa  155  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2590  hypothetical protein  39.88 
 
 
400 aa  152  1e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.709956  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0971  hypothetical protein  34.2 
 
 
385 aa  151  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4454  hypothetical protein  36.17 
 
 
407 aa  151  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0734  hypothetical protein  38.86 
 
 
396 aa  150  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.386022  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1663  hypothetical protein  37.13 
 
 
396 aa  150  5e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08510  hypothetical protein  38.48 
 
 
422 aa  148  1e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0634  hypothetical protein  33.71 
 
 
412 aa  147  4e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2600  hypothetical protein  38.16 
 
 
423 aa  145  9e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.590151  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1085  hypothetical protein  38.31 
 
 
403 aa  140  5e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.643719  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4259  hypothetical protein  35.98 
 
 
415 aa  138  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2888  hypothetical protein  36.45 
 
 
414 aa  135  2e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00389281  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29160  hypothetical protein  33.58 
 
 
438 aa  132  1e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2598  hypothetical protein  34.75 
 
 
411 aa  130  5e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.82332e-08 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0682  hypothetical protein  36.57 
 
 
418 aa  127  5e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.601703  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3060  hypothetical protein  36.09 
 
 
400 aa  125  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.849253  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3843  hypothetical protein  35.39 
 
 
428 aa  122  9e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2351  hypothetical protein  30.9 
 
 
407 aa  107  5e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.175675  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5789  hypothetical protein  34.29 
 
 
487 aa  98.2  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.712723  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4233  hypothetical protein  35.59 
 
 
411 aa  96.3  7e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.118857 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16610  hypothetical protein  32.8 
 
 
443 aa  91.3  3e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0802  hypothetical protein  31.44 
 
 
477 aa  87  5e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2182  hypothetical protein  26.72 
 
 
401 aa  82.4  1e-14  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2452  hypothetical protein  24.23 
 
 
402 aa  81.6  2e-14  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.280378  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2063  hypothetical protein  26.75 
 
 
417 aa  78.6  2e-13  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2423  hypothetical protein  23.34 
 
 
419 aa  76.6  7e-13  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2587  hypothetical protein  26.18 
 
 
444 aa  73.6  6e-12  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1249  Methyltransferase type 11  25.1 
 
 
385 aa  63.9  4e-09  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.419487  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13168  hypothetical protein  21.07 
 
 
396 aa  63.2  7e-09  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0021  hypothetical protein  23.1 
 
 
399 aa  61.6  2e-08  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0629415  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2822  hypothetical protein  23.61 
 
 
420 aa  60.1  6e-08  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1360  hypothetical protein  21.9 
 
 
375 aa  58.5  2e-07  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1929  hypothetical protein  21.57 
 
 
383 aa  50.8  4e-05  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0557173  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2926  hypothetical protein  24.12 
 
 
394 aa  49.3  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.812191  hitchhiker  0.000139992 
 
 
-
 
NC_002950  PG1098  hypothetical protein  23.1 
 
 
407 aa  44.7  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.697484 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>