More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4260 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4260  methyltransferase type 11  100 
 
 
261 aa  525  1e-148  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2098  methyltransferase type 11  82.95 
 
 
263 aa  425  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1849  methyltransferase type 11  78.87 
 
 
259 aa  404  1e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1869  methyltransferase type 11  78.49 
 
 
259 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.235933  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1915  methyltransferase type 11  78.49 
 
 
259 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.107391  normal  0.797863 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13046  hypothetical protein  69.23 
 
 
274 aa  339  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0765338  hitchhiker  0.00655804 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3261  Methyltransferase type 11  62.85 
 
 
264 aa  314  9e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2918  Methyltransferase type 11  61.45 
 
 
248 aa  302  3.0000000000000004e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0444641  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6056  Methyltransferase type 11  60.8 
 
 
248 aa  288  7e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28280  methyltransferase family protein  58.55 
 
 
258 aa  273  1.0000000000000001e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.639383  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4654  Methyltransferase type 11  39.2 
 
 
257 aa  125  5e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.302301  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  49.31 
 
 
1106 aa  122  5e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4218  methyltransferase type 11  38.41 
 
 
261 aa  81.3  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3138  Methyltransferase type 11  38.58 
 
 
255 aa  80.1  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.893116  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2267  Methyltransferase type 11  31.29 
 
 
208 aa  80.5  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  33.72 
 
 
634 aa  76.3  0.0000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4088  glycosyl transferase family protein  35.38 
 
 
1032 aa  76.3  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  31.9 
 
 
258 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3272  methyltransferase type 11  36.99 
 
 
202 aa  72.8  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.554198  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3067  methyltransferase type 11  27.44 
 
 
369 aa  70.1  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1483  methyltransferase type 11  31.06 
 
 
885 aa  69.3  0.00000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4089  ABC transporter related  35.77 
 
 
870 aa  68.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.591422  normal  0.870036 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1113  methyltransferase type 11  33.83 
 
 
319 aa  67.4  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0629842  normal  0.748747 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0944  hypothetical protein  36.89 
 
 
242 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.162173  normal  0.410696 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4238  Methyltransferase type 11  28.74 
 
 
237 aa  66.6  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0707  methyltransferase type 11  31.14 
 
 
250 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2514  methyltransferase type 11  29.94 
 
 
359 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.775917 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3858  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  34.31 
 
 
260 aa  65.5  0.0000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000301378 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1298  Methyltransferase type 11  30.91 
 
 
210 aa  65.1  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.356445  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2610  transcriptional regulator, ArsR family  32.39 
 
 
309 aa  64.7  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.184924 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  34.48 
 
 
345 aa  63.9  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3819  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.29 
 
 
248 aa  63.5  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3724  methyltransferase type 11  37.23 
 
 
240 aa  63.2  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3047  Methyltransferase type 11  33.98 
 
 
244 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0374295  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1112  methyltransferase type 11  25.64 
 
 
246 aa  63.2  0.000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0760451  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1398  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  37.74 
 
 
237 aa  62.4  0.000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2364  Methyltransferase type 11  41.94 
 
 
245 aa  62.8  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.695358  decreased coverage  0.00329401 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2462  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  37.74 
 
 
237 aa  62.4  0.000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.331199 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3965  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.38 
 
 
260 aa  62.4  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1719  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.19 
 
 
234 aa  62.4  0.000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.815395  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2234  Methyltransferase type 11  31.4 
 
 
255 aa  62.4  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.227715  hitchhiker  0.000669188 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3903  methyltransferase type 11  33.51 
 
 
198 aa  62  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.808495 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3895  methyltransferase type 11  33.51 
 
 
198 aa  62  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0303  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  27.95 
 
 
256 aa  62  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0289  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  27.95 
 
 
256 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.911114 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  32.76 
 
 
319 aa  61.6  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0297  UbiE/COQ5 family methyltransferase  27.95 
 
 
256 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378405  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0834  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.4 
 
 
237 aa  61.6  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293263  normal  0.0185746 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3425  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  31.03 
 
 
258 aa  61.2  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129288 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3574  methyltransferase type 11  35.04 
 
 
235 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00761  hypothetical protein  30.28 
 
 
246 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286204  normal  0.107855 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0284  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  27.95 
 
 
256 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  34.45 
 
 
258 aa  60.8  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4499  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  35.09 
 
 
266 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000152328 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0721  hypothetical protein  37.5 
 
 
225 aa  60.8  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.856031 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3527  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.31 
 
 
252 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.204476  normal  0.816598 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00659  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1,4- benzoquinol methylase  33.33 
 
 
250 aa  61.2  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0757  methyltransferase type 11  33.55 
 
 
442 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1559  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
233 aa  60.8  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0523794  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4283  methyltransferase type 11  29.9 
 
 
257 aa  60.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.706274  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01234  transcriptional regulator  38.38 
 
 
331 aa  60.1  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250381  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1474  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  34.78 
 
 
255 aa  60.1  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.760771  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6865  Methyltransferase type 11  32.14 
 
 
282 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0282  UbiE/COQ5 family methyltransferase  27.88 
 
 
256 aa  60.1  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.986318 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2130  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.81 
 
 
241 aa  60.1  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.874721 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0658  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
233 aa  59.7  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.382141  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2260  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.02 
 
 
254 aa  59.7  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0516247  normal  0.429891 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4502  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.19 
 
 
244 aa  59.3  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.166087 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0908  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase /2-octaprenyl-6-hydroxy phenol methylase  30.84 
 
 
260 aa  59.3  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4717  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.7 
 
 
240 aa  59.3  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.970873 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0034  ArsR family transcriptional regulator  30.97 
 
 
328 aa  59.3  0.00000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0629975 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  31.33 
 
 
335 aa  58.9  0.00000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3676  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.1 
 
 
230 aa  58.9  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0791082 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0606  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 
254 aa  58.9  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0138058  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3615  methyltransferase type 11  33 
 
 
239 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.106494  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  35.58 
 
 
291 aa  58.5  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2175  Methyltransferase type 11  28.19 
 
 
221 aa  58.5  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.300294  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1714  arsenite S-adenosylmethyltransferase  32.45 
 
 
248 aa  58.5  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.019439  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4274  methyltransferase type 11  29.88 
 
 
222 aa  58.5  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.254306  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21420  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  31.07 
 
 
233 aa  58.5  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0478514  hitchhiker  0.0000156795 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4090  methyltransferase type 11  33.66 
 
 
239 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.999549 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3002  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.22 
 
 
253 aa  58.5  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2589  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.08 
 
 
262 aa  58.2  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.672659 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3046  Methyltransferase type 11  35.37 
 
 
295 aa  57.4  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2022  hypothetical protein  38.61 
 
 
261 aa  57.8  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891913  normal  0.0390381 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3550  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.11 
 
 
248 aa  57.4  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2034  methyltransferase  36.46 
 
 
202 aa  57.4  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00341547  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2154  methyltransferase type 11  23.74 
 
 
291 aa  57  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2506  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.33 
 
 
248 aa  57  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.117869  normal  0.18577 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0298  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.31 
 
 
254 aa  57  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6253  methyltransferase domain-containing protein  30.77 
 
 
276 aa  57  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.812952  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  34.55 
 
 
349 aa  57  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0458  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.04 
 
 
234 aa  57  0.0000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1083  hypothetical protein  26.32 
 
 
254 aa  56.6  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.85 
 
 
243 aa  57  0.0000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2596  biotin biosynthesis protein bioC  31 
 
 
265 aa  56.6  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.093326  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  34.55 
 
 
354 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1748  hypothetical protein  31.39 
 
 
253 aa  56.6  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.707104 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6705  Methyltransferase type 11  29.45 
 
 
810 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1742  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  30.36 
 
 
253 aa  56.6  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.581641 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>