196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4181 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4181  amidohydrolase  100 
 
 
362 aa  715    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2182  amidohydrolase  78.39 
 
 
360 aa  565  1e-160  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.322343  normal  0.931322 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12929  hypothetical protein  73.11 
 
 
370 aa  511  1e-144  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0687  normal  0.519945 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1960  amidohydrolase  72.9 
 
 
368 aa  500  1e-140  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2006  amidohydrolase  72.9 
 
 
368 aa  500  1e-140  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0811412  normal  0.722686 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1940  amidohydrolase  73.17 
 
 
368 aa  500  1e-140  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.864175 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5929  amidohydrolase  62.36 
 
 
356 aa  431  1e-120  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117607  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09720  Pro-Hyp dipeptidase  58.87 
 
 
354 aa  382  1e-105  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.885607 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4010  amidohydrolase  60.82 
 
 
361 aa  366  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11020  amidohydrolase, imidazolonepropionase  56.02 
 
 
366 aa  356  3.9999999999999996e-97  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.161229  normal  0.0546284 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3262  amidohydrolase  52.79 
 
 
361 aa  340  2e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1281  amidohydrolase  56.2 
 
 
364 aa  340  2.9999999999999998e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2082  amidohydrolase  53.26 
 
 
357 aa  330  2e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3142  amidohydrolase  55.87 
 
 
359 aa  322  6e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000508689  normal  0.129698 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1562  amidohydrolase 3  48.75 
 
 
362 aa  321  1.9999999999999998e-86  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.345787  normal  0.0640888 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2226  amidohydrolase  52 
 
 
360 aa  318  1e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000139869 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1191  amidohydrolase  52.51 
 
 
359 aa  310  2e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.251504  normal  0.0810275 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2486  amidohydrolase  51.15 
 
 
360 aa  309  4e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.445092  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3462  amidohydrolase 3  53.87 
 
 
365 aa  309  5e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23760  amidohydrolase, imidazolonepropionase  47.56 
 
 
378 aa  306  3e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.318525 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1397  amidohydrolase  52.66 
 
 
359 aa  306  3e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.503845  decreased coverage  0.00549847 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1302  amidohydrolase  51.67 
 
 
359 aa  303  3.0000000000000004e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1612  amidohydrolase  48.53 
 
 
358 aa  301  2e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0569822  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1166  amidohydrolase  49.18 
 
 
373 aa  296  5e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2244  amidohydrolase  48.1 
 
 
367 aa  285  1.0000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.244187  normal  0.209508 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1469  amidohydrolase  48.41 
 
 
362 aa  276  4e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.145414 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09960  amidohydrolase, imidazolonepropionase  45.58 
 
 
388 aa  256  6e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0916327  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0984  amidohydrolase  45.16 
 
 
358 aa  248  1e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000713577  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  29.46 
 
 
445 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  33.17 
 
 
440 aa  100  5e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  28.01 
 
 
426 aa  100  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2978  amidohydrolase  30.93 
 
 
429 aa  99  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3308  amidohydrolase  29.56 
 
 
419 aa  97.4  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692035  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  28.38 
 
 
438 aa  96.7  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  28.13 
 
 
430 aa  95.5  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  27.45 
 
 
426 aa  94.7  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0935  amidohydrolase  28.69 
 
 
428 aa  94.7  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.755972  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  27.55 
 
 
426 aa  95.1  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3749  amidohydrolase  28.57 
 
 
408 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3822  amidohydrolase  28.57 
 
 
408 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1408  amidohydrolase  30.97 
 
 
402 aa  94.7  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.321357  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3761  amidohydrolase  28.57 
 
 
408 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225154  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1219  amidohydrolase  28.81 
 
 
390 aa  94.7  2e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.82253  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  28.45 
 
 
412 aa  92  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  29.46 
 
 
433 aa  91.3  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4292  amidohydrolase  36.5 
 
 
402 aa  91.7  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3368  amidohydrolase  32.95 
 
 
414 aa  90.9  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.929128  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  27.2 
 
 
437 aa  90.9  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1413  amidohydrolase  29.7 
 
 
423 aa  90.1  5e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  25.19 
 
 
430 aa  89.7  7e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2609  amidohydrolase  29.26 
 
 
396 aa  89  1e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  29.13 
 
 
407 aa  89  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3715  amidohydrolase  33.04 
 
 
417 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355417  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3788  amidohydrolase  33.04 
 
 
417 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.463322  normal  0.142834 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3728  amidohydrolase  33.04 
 
 
417 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  29.4 
 
 
433 aa  88.6  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4565  amidohydrolase  26.47 
 
 
423 aa  87.4  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.244661  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1967  amidohydrolase  25.99 
 
 
405 aa  87.8  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4188  amidohydrolase  30.94 
 
 
421 aa  87  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2437  amidohydrolase  29.01 
 
 
411 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4855  amidohydrolase  33.15 
 
 
403 aa  86.7  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.165345  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2093  amidohydrolase  25.42 
 
 
431 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.885062  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  26.96 
 
 
407 aa  85.1  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2466  amidohydrolase  34.97 
 
 
424 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.357249  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3237  amidohydrolase  33.15 
 
 
404 aa  85.1  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136124  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  27.93 
 
 
459 aa  85.1  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  33.33 
 
 
423 aa  84  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2368  amidohydrolase  23.82 
 
 
441 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  26.7 
 
 
444 aa  83.2  0.000000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  28.19 
 
 
433 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2711  amidohydrolase  26.96 
 
 
400 aa  82  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959959  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5427  amidohydrolase  26.55 
 
 
432 aa  80.9  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0808338 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0420  amidohydrolase  27.2 
 
 
418 aa  79.7  0.00000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2515  amidohydrolase  27.68 
 
 
426 aa  79.3  0.00000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3597  amidohydrolase  31.82 
 
 
445 aa  78.6  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  25.85 
 
 
434 aa  77.8  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5037  amidohydrolase  25.19 
 
 
432 aa  78.6  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  26.2 
 
 
431 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5618  amidohydrolase  31.07 
 
 
422 aa  77.8  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.313113  normal  0.102085 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2377  amidohydrolase  26.99 
 
 
421 aa  77.8  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.134161  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0479  amidohydrolase  27.22 
 
 
401 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  27.48 
 
 
432 aa  76.6  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  27.2 
 
 
455 aa  74.7  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  26.06 
 
 
444 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2115  amidohydrolase  27.45 
 
 
426 aa  73.9  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2318  amidohydrolase  27.12 
 
 
428 aa  73.6  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.0431533 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02779  conserved hypothetical protein  27.14 
 
 
493 aa  72.4  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.243832  normal  0.291851 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2221  hypothetical protein  24.14 
 
 
412 aa  72  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3036  amidohydrolase  25.85 
 
 
407 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2941  amidohydrolase  27.84 
 
 
390 aa  71.6  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.270763  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3650  amidohydrolase  27.44 
 
 
428 aa  71.2  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0432  amidohydrolase  26.88 
 
 
421 aa  70.5  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0258  amidohydrolase  26.49 
 
 
441 aa  70.1  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0639139  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2992  amidohydrolase  29.23 
 
 
489 aa  69.7  0.00000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.278958 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2193  hypothetical protein  24.14 
 
 
412 aa  68.9  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1571  amidohydrolase  28.01 
 
 
392 aa  69.3  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0206923  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  23.5 
 
 
413 aa  68.9  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3194  hypothetical protein  24.79 
 
 
447 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.352282  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2823  amidohydrolase  25.91 
 
 
422 aa  68.2  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.750141  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2275  amidohydrolase  23.42 
 
 
450 aa  68.6  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.776694  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>