More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4013 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4013  dihydrodipicolinate reductase  100 
 
 
245 aa  487  1e-137  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.944692  decreased coverage  0.00563446 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2374  dihydrodipicolinate reductase  91.8 
 
 
245 aa  451  1e-126  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.049694 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2107  dihydrodipicolinate reductase  87.3 
 
 
245 aa  430  1e-120  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.826821  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2153  dihydrodipicolinate reductase  87.3 
 
 
245 aa  430  1e-120  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.214546 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2090  dihydrodipicolinate reductase  86.89 
 
 
245 aa  429  1e-119  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.102525 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12786  dihydrodipicolinate reductase  81.97 
 
 
245 aa  404  1e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.506442 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1756  dihydrodipicolinate reductase  73.98 
 
 
247 aa  359  2e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2172  dihydrodipicolinate reductase  72.36 
 
 
249 aa  348  6e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.178425  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2134  Dihydrodipicolinate reductase  64.63 
 
 
245 aa  313  1e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.115039  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3167  dihydrodipicolinate reductase  63.82 
 
 
247 aa  313  1e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5110  dihydrodipicolinate reductase  62.04 
 
 
253 aa  310  1e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.188253  normal  0.135082 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1341  dihydrodipicolinate reductase  62.45 
 
 
256 aa  305  5e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000215564 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14710  dihydrodipicolinate reductase  61.79 
 
 
256 aa  305  6e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191684  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1191  dihydrodipicolinate reductase  63.67 
 
 
247 aa  303  1e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0118297  normal  0.0633468 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3321  dihydrodipicolinate reductase  62.35 
 
 
246 aa  302  4e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.240589  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3951  dihydrodipicolinate reductase  61.07 
 
 
268 aa  298  6e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1070  dihydrodipicolinate reductase  63.2 
 
 
231 aa  296  2e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00416614 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0786  dihydrodipicolinate reductase  62.35 
 
 
246 aa  295  4e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.773473  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1506  dihydrodipicolinate reductase  61.89 
 
 
252 aa  291  7e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.195551  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1383  dihydrodipicolinate reductase  60.41 
 
 
260 aa  290  2e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.71662  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0641  dihydrodipicolinate reductase  59.27 
 
 
247 aa  288  7e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.682115 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3553  dihydrodipicolinate reductase  62.86 
 
 
244 aa  285  3e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.460519  normal  0.378798 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5821  dihydrodipicolinate reductase  59.57 
 
 
235 aa  282  3e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.908653  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1521  dihydrodipicolinate reductase  57.72 
 
 
252 aa  258  5e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.97008  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1027  dihydrodipicolinate reductase  55.47 
 
 
251 aa  258  6e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10400  dihydrodipicolinate reductase  53.88 
 
 
256 aa  256  2e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0154197  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2472  dihydrodipicolinate reductase  55.28 
 
 
247 aa  254  8e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.448881  normal  0.609009 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0952  dihydrodipicolinate reductase  56.18 
 
 
251 aa  251  8e-66  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2227  dihydrodipicolinate reductase  56.97 
 
 
252 aa  250  1e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00180899  normal  0.489753 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7874  dihydrodipicolinate reductase  54.94 
 
 
261 aa  250  2e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.867901  normal  0.122831 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1448  dihydrodipicolinate reductase  55.69 
 
 
252 aa  244  1e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.62245  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1450  dihydrodipicolinate reductase  55.1 
 
 
256 aa  242  4e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.98229e-12 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23350  dihydrodipicolinate reductase  55.47 
 
 
245 aa  239  2e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.821091  normal  0.0199255 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1468  Dihydrodipicolinate reductase  52.85 
 
 
246 aa  238  6e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1219  dihydrodipicolinate reductase  54.12 
 
 
258 aa  236  3e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3058  dihydrodipicolinate reductase  46.94 
 
 
248 aa  226  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1627  dihydrodipicolinate reductase  48.05 
 
 
255 aa  225  4e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.106572  hitchhiker  4.65979e-05 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07120  dihydrodipicolinate reductase  50.61 
 
 
263 aa  210  1e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.45507  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0460  dihydrodipicolinate reductase  45.95 
 
 
255 aa  207  1e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07590  dihydrodipicolinate reductase  49.02 
 
 
255 aa  206  2e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.736666  normal  0.996553 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08640  dihydrodipicolinate reductase  45.8 
 
 
263 aa  206  4e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3663  dihydrodipicolinate reductase  41.51 
 
 
267 aa  204  1e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  9.98818e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2136  dihydrodipicolinate reductase  42.91 
 
 
273 aa  204  1e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.337218  normal  0.177934 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0347  dihydrodipicolinate reductase  42.59 
 
 
265 aa  204  1e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1063  dihydrodipicolinate reductase  42.26 
 
 
267 aa  203  2e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000472206  hitchhiker  0.00178207 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0942  dihydrodipicolinate reductase  52.13 
 
 
254 aa  202  5e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1655  dihydrodipicolinate reductase  43.36 
 
 
260 aa  200  2e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1442  dihydrodipicolinate reductase  40.91 
 
 
266 aa  199  2e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0101605  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1555  dihydrodipicolinate reductase  40.91 
 
 
266 aa  199  2e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.769504  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1414  dihydrodipicolinate reductase  40.91 
 
 
266 aa  199  3e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0832957  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1626  dihydrodipicolinate reductase  40.91 
 
 
266 aa  199  3e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.261081 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1699  dihydrodipicolinate reductase  40.53 
 
 
266 aa  199  4e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.044918  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0495  dihydrodipicolinate reductase  43.45 
 
 
265 aa  198  7e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1415  dihydrodipicolinate reductase  40.53 
 
 
266 aa  197  1e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  6.79486e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1148  dihydrodipicolinate reductase  42.31 
 
 
268 aa  196  2e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0297  dihydrodipicolinate reductase  42.8 
 
 
239 aa  196  2e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.320787  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3169  dihydrodipicolinate reductase  42.8 
 
 
266 aa  197  2e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.151717  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1896  dihydrodipicolinate reductase  42.8 
 
 
239 aa  196  2e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1661  dihydrodipicolinate reductase  40.15 
 
 
266 aa  196  3e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.414457  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1458  dihydrodipicolinate reductase  45.18 
 
 
266 aa  195  5e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0186004  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1944  dihydrodipicolinate reductase  41.83 
 
 
265 aa  195  5e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0489859  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1273  dihydrodipicolinate reductase  41.6 
 
 
266 aa  194  1e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.124784  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3623  dihydrodipicolinate reductase  41.57 
 
 
275 aa  192  3e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.295207 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0311  dihydrodipicolinate reductase  40.98 
 
 
275 aa  192  5e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0616212 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1588  dihydrodipicolinate reductase  39.77 
 
 
266 aa  191  8e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3757  dihydrodipicolinate reductase  39.77 
 
 
266 aa  191  8e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.970638  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3234  dihydrodipicolinate reductase  46.15 
 
 
218 aa  191  8e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.802216  normal  0.68901 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1909  dihydrodipicolinate reductase  40.89 
 
 
278 aa  191  9e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1256  dihydrodipicolinate reductase  39.39 
 
 
266 aa  191  1e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0330544  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0616  dihydrodipicolinate reductase  47.03 
 
 
259 aa  190  2e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2124  dihydrodipicolinate reductase  41.51 
 
 
266 aa  189  3e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0763016  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3555  Dihydrodipicolinate reductase  41.35 
 
 
275 aa  188  8e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.526529  normal  0.518947 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1680  dihydrodipicolinate reductase  40.45 
 
 
275 aa  186  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1698  dihydrodipicolinate reductase  40.45 
 
 
275 aa  186  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3648  dihydrodipicolinate reductase  42.92 
 
 
243 aa  182  3e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0474  dihydrodipicolinate reductase  39.78 
 
 
278 aa  182  4e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.760412  normal  0.0967493 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0146  dihydrodipicolinate reductase  40.91 
 
 
243 aa  181  7e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0131  dihydrodipicolinate reductase  40.5 
 
 
243 aa  180  2e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09071  dihydrodipicolinate reductase  38.89 
 
 
282 aa  175  7e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0862  dihydrodipicolinate reductase  37.97 
 
 
263 aa  172  3e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1829  dihydrodipicolinate reductase  39.63 
 
 
277 aa  172  3e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0826  dihydrodipicolinate reductase  38.52 
 
 
277 aa  171  7e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10381  dihydrodipicolinate reductase  37.78 
 
 
282 aa  171  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0602305  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10381  dihydrodipicolinate reductase  37.78 
 
 
282 aa  170  2e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_844  dihydrodipicolinate reductase  37.26 
 
 
263 aa  169  4e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0968  dihydrodipicolinate reductase  44.39 
 
 
282 aa  169  5e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0671  dihydrodipicolinate reductase  42.29 
 
 
240 aa  167  1e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10611  dihydrodipicolinate reductase  36.03 
 
 
282 aa  167  1e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0309689 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0379  dihydrodipicolinate reductase  35.29 
 
 
282 aa  166  2e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0971  dihydrodipicolinate reductase  35.74 
 
 
263 aa  165  7e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13941  dihydrodipicolinate reductase  37.36 
 
 
283 aa  164  2e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.101233 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1656  dihydrodipicolinate reductase  38.55 
 
 
242 aa  161  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0645  dihydrodipicolinate reductase  40.07 
 
 
266 aa  156  3e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09351  dihydrodipicolinate reductase  36.76 
 
 
283 aa  155  7e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.029054  hitchhiker  0.000319573 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0775  dihydrodipicolinate reductase  36.95 
 
 
252 aa  132  4e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3053  dihydrodipicolinate reductase  32.95 
 
 
269 aa  127  2e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0707  dihydrodipicolinate reductase  34.14 
 
 
267 aa  120  1e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165217  hitchhiker  0.00943126 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1593  Dihydrodipicolinate reductase  34.6 
 
 
261 aa  119  4e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3210  dihydrodipicolinate reductase  31.44 
 
 
269 aa  119  4e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3622  dihydrodipicolinate reductase  33.87 
 
 
267 aa  119  6e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>