23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4012 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4012  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
155 aa  308  2e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.678483  decreased coverage  0.00532252 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2375  tetratricopeptide TPR_2  82.58 
 
 
155 aa  259  1e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0445663 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2091  TPR repeat-containing protein  70.78 
 
 
154 aa  211  4e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.100902 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2108  tetratricopeptide TPR_2  70.78 
 
 
154 aa  210  6e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2154  TPR repeat-containing protein  70.78 
 
 
154 aa  210  6e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.289892 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12785  transmembrane protein  66.67 
 
 
157 aa  184  3e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.443244 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2173  hypothetical protein  61.48 
 
 
169 aa  164  4e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.142438  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1757  hypothetical protein  53.47 
 
 
158 aa  147  7e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2228  hypothetical protein  48.98 
 
 
160 aa  137  4e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00165353  normal  0.456563 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14720  hypothetical protein  51.11 
 
 
153 aa  137  4e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.100012  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5820  hypothetical protein  49.62 
 
 
150 aa  132  2e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1451  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.14 
 
 
159 aa  110  8e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.99447e-12 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1449  TPR repeat-containing protein  38.78 
 
 
157 aa  104  4e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.262816  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7873  hypothetical protein  36.76 
 
 
149 aa  103  9e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.157939 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3552  hypothetical protein  36.36 
 
 
166 aa  93.6  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.497079  normal  0.345074 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23340  hypothetical protein  40.56 
 
 
152 aa  76.3  1e-13  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.863031  normal  0.0195601 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1220  hypothetical protein  42.06 
 
 
155 aa  70.9  5e-12  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2471  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.04 
 
 
147 aa  69.7  1e-11  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.514415  normal  0.576006 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1469  conserved hypothetical secreted protein  41.1 
 
 
149 aa  62.4  2e-09  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.22177 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07130  hypothetical protein  33.33 
 
 
172 aa  62  3e-09  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.183807  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1028  hypothetical protein  37.5 
 
 
167 aa  59.7  1e-08  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1522  hypothetical protein  40.98 
 
 
164 aa  56.2  2e-07  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10410  hypothetical protein  29.08 
 
 
133 aa  48.9  3e-05  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0104588  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>