More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4009 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4009  HpcH/HpaI aldolase  100 
 
 
306 aa  621  1e-177  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.783796  decreased coverage  0.00557053 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2378  HpcH/HpaI aldolase  91.83 
 
 
306 aa  581  1e-165  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0643496  normal  0.0302108 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5292  HpcH/HpaI aldolase  81.41 
 
 
310 aa  503  1e-141  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5584  HpcH/HpaI aldolase  81.41 
 
 
310 aa  503  1e-141  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.331432  normal  0.321338 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5204  HpcH/HpaI aldolase  81.41 
 
 
310 aa  503  1e-141  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13092  hypothetical protein  81.05 
 
 
307 aa  498  1e-140  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00883789  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4467  HpcH/HpaI aldolase  80.26 
 
 
307 aa  489  1e-137  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.99201  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0181  HpcH/HpaI aldolase  77.46 
 
 
281 aa  424  1e-117  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.530388  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00870  citrate lyase beta subunit  68.42 
 
 
321 aa  409  1e-113  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0531316  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4340  HpcH/HpaI aldolase  52.92 
 
 
277 aa  272  6e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0552046  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2742  HpcH/HpaI aldolase  49.81 
 
 
287 aa  264  1e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00490393 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3032  HpcH/HpaI aldolase  49.44 
 
 
289 aa  264  2e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.752925  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2688  HpcH/HpaI aldolase  49.26 
 
 
283 aa  263  4e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4282  HpcH/HpaI aldolase  50 
 
 
280 aa  254  1e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.41121  normal  0.174407 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0204  HpcH/HpaI aldolase  45.52 
 
 
311 aa  229  4e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.446132  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19950  citrate lyase beta subunit  48.31 
 
 
281 aa  219  5e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.251575  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2654  HpcH/HpaI aldolase  45.08 
 
 
267 aa  193  3e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4082  citrate lyase  40.45 
 
 
270 aa  152  8e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0618  Citrate (pro-3S)-lyase  40.07 
 
 
270 aa  148  9e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0840536 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4946  HpcH/HpaI aldolase  34.22 
 
 
269 aa  142  7e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6255  HpcH/HpaI aldolase  32.71 
 
 
291 aa  134  2e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.76273 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6127  HpcH/HpaI aldolase  34.96 
 
 
294 aa  132  8e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.986067 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3810  HpcH/HpaI aldolase  36.1 
 
 
279 aa  132  9e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5950  HpcH/HpaI aldolase  33.46 
 
 
291 aa  131  2e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392121  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6415  HpcH/HpaI aldolase  34.96 
 
 
294 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0149  putative citrate lyase, beta subunit  38.31 
 
 
274 aa  129  6e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.678865  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0168  citrate lyase, beta subunit, putative  38.31 
 
 
274 aa  129  6e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0332252  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0669  putative HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase  33.46 
 
 
274 aa  128  1e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0106618  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0560  putative HpcH/HpaI aldolase  33.46 
 
 
277 aa  125  7e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00111477  normal  0.30107 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4556  HpcH/HpaI aldolase  34.45 
 
 
274 aa  125  9e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.936359  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3539  HpcH/HpaI aldolase  34.17 
 
 
279 aa  125  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.974431  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1243  HpcH/HpaI aldolase  34.2 
 
 
282 aa  124  2e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.31934  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6652  HpcH/HpaI aldolase  34.98 
 
 
275 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.647972  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1348  HpcH/HpaI aldolase  36.47 
 
 
276 aa  121  1e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3907  HpcH/HpaI aldolase  30.53 
 
 
293 aa  119  6e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2139  HpcH/HpaI aldolase  37.75 
 
 
290 aa  119  7e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.747659  decreased coverage  0.00493167 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6171  citrate (pro-3S)-lyase  35.25 
 
 
267 aa  117  2e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5807  citrate lyase  35.25 
 
 
267 aa  117  2e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4110  HpcH/HpaI aldolase  39.15 
 
 
266 aa  117  2e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6600  HpcH/HpaI aldolase  33.46 
 
 
270 aa  115  6e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186422  normal  0.0929834 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0865  HpcH/HpaI aldolase  29.17 
 
 
276 aa  114  2e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.903723  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6108  HpcH/HpaI aldolase  34.6 
 
 
268 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  9.04095e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2534  Citryl-CoA lyase  35.18 
 
 
274 aa  112  7e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.426943  normal  0.459191 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3486  HpcH/HpaI aldolase  30.97 
 
 
279 aa  111  1e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2581  putative citrate lyase beta subunit  33.33 
 
 
278 aa  110  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18610  citrate lyase beta subunit  34.6 
 
 
278 aa  110  4e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6894  Citryl-CoA lyase  34.34 
 
 
273 aa  109  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2417  HpcH/HpaI aldolase  34.04 
 
 
271 aa  109  6e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.21523 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0366  Citryl-CoA lyase  34.45 
 
 
286 aa  108  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4801  HpcH/HpaI aldolase  33.19 
 
 
289 aa  105  8e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.147355 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7302  HpcH/HpaI aldolase  33.87 
 
 
283 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.488108  normal  0.498 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2028  HpcH/HpaI aldolase  35.29 
 
 
295 aa  104  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0511  HpcH/HpaI aldolase  29.15 
 
 
293 aa  103  5e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2717  citrate lyase  31.48 
 
 
275 aa  101  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2171  HpcH/HpaI aldolase  32.96 
 
 
271 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0989  putative citrate lyase, beta subunit  29.92 
 
 
274 aa  100  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.911423 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0580  HpcH/HpaI aldolase  34.42 
 
 
297 aa  100  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1653  putative citrate lyase, beta subunit  32.37 
 
 
293 aa  99.8  5e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0608  putative citrate lyase, beta subunit  32.37 
 
 
293 aa  99.8  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.46771  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1725  putative citrate lyase, beta subunit  32.37 
 
 
293 aa  99.8  5e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1932  putative citrate lyase, beta subunit  32.37 
 
 
293 aa  99.8  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1045  HpcH/HpaI aldolase  35.16 
 
 
281 aa  99.4  7e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00200106  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0233  Citryl-CoA lyase  29.32 
 
 
292 aa  98.2  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.020258 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3049  HpcH/HpaI aldolase  31.48 
 
 
272 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.100849  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1194  HpcH/HpaI aldolase  33.46 
 
 
289 aa  98.2  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.355955  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0232  Citryl-CoA lyase  29.5 
 
 
292 aa  96.7  5e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2222  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  31.95 
 
 
293 aa  95.1  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0703  citrate lyase, beta subunit, putative  31.95 
 
 
293 aa  95.1  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2118  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  29.46 
 
 
280 aa  91.7  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.397559 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2156  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  29.46 
 
 
280 aa  92  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.928394  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2266  HpcH/HpaI aldolase  29.46 
 
 
280 aa  92  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0539  Citryl-CoA lyase  30.86 
 
 
292 aa  91.3  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730056  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0496  Citryl-CoA lyase  30.2 
 
 
292 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1689  HpcH/HpaI aldolase  35.95 
 
 
268 aa  90.9  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.69146  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2305  hypothetical protein  31.54 
 
 
293 aa  90.5  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.500849  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6334  Citrate (pro-3S)-lyase  32.27 
 
 
277 aa  90.1  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.133288  normal  0.682082 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1580  Citryl-CoA lyase  30.3 
 
 
303 aa  90.1  5e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.264708  hitchhiker  0.00335996 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2556  HpcH/HpaI aldolase  29.37 
 
 
267 aa  89.4  6e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.404937 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1154  Citrate (pro-3S)-lyase  33.45 
 
 
288 aa  87.8  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0202  HpcH/HpaI aldolase  31.97 
 
 
290 aa  87.8  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0341  Citryl-CoA lyase  33.86 
 
 
292 aa  88.2  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3200  HpcH/HpaI aldolase  30.82 
 
 
274 aa  87.4  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0114  HpcH/HpaI aldolase  32.01 
 
 
289 aa  87  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.345812 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1192  Citrate (pro-3S)-lyase  33.96 
 
 
313 aa  87  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.151099  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0082  citrate (pro-3S)-lyase  31.82 
 
 
285 aa  87  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0799  citrate (pro-3S)-lyase  31.37 
 
 
341 aa  87  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.105286  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3913  HpcH/HpaI aldolase  29.85 
 
 
282 aa  86.7  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.939389  normal  0.094583 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2874  putative citrate lyase subunit beta  30.36 
 
 
295 aa  85.9  9e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4087  HpcH/HpaI aldolase  31.27 
 
 
271 aa  85.5  1e-15  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.106602  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1719  HpcH/HpaI aldolase  33.33 
 
 
281 aa  85.1  1e-15  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.422564 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04680  Citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  30.77 
 
 
294 aa  84.7  2e-15  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0803  HpcH/HpaI aldolase  31.97 
 
 
293 aa  84.3  2e-15  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0969  Citrate (pro-3S)-lyase  32.51 
 
 
282 aa  84.7  2e-15  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2481  citrate (pro-3S)-lyase  30.86 
 
 
379 aa  84  3e-15  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.565353  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2630  citrate (pro-3S)-lyase  30.42 
 
 
285 aa  84  3e-15  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3050  citrate lyase subunit beta  28.2 
 
 
318 aa  84  3e-15  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3115  Citrate (pro-3S)-lyase  34.07 
 
 
276 aa  84  3e-15  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0131  HpcH/HpaI aldolase  31.14 
 
 
289 aa  84  3e-15  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3295  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  30.11 
 
 
280 aa  84  3e-15  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.820787 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3369  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  30.11 
 
 
280 aa  83.6  4e-15  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal  0.440795 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>