More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3999 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_2191  beta-lactamase domain protein  63.41 
 
 
595 aa  709    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5806  beta-lactamase domain protein  64.08 
 
 
559 aa  726    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2104  beta-lactamase domain-containing protein  85.84 
 
 
558 aa  971    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.739055  normal  0.176892 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3999  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
558 aa  1115    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.818404  normal  0.115324 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1763  beta-lactamase domain protein  61.71 
 
 
650 aa  699    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2242  beta-lactamase domain protein  60.94 
 
 
580 aa  679    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.138314  normal  0.621627 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12765  hypothetical protein  83.69 
 
 
558 aa  964    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.868415 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3943  beta-lactamase domain protein  57.25 
 
 
566 aa  637    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.142082  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2117  beta-lactamase-like protein  85.84 
 
 
558 aa  971    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25240  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  60.43 
 
 
565 aa  681    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2163  beta-lactamase domain-containing protein  85.84 
 
 
558 aa  971    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.142592  normal  0.270544 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2388  beta-lactamase domain-containing protein  92.29 
 
 
558 aa  1050    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.801347  normal  0.0151024 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4272  beta-lactamase domain-containing protein  56.16 
 
 
568 aa  615  1e-175  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3309  beta-lactamase domain protein  56.14 
 
 
561 aa  616  1e-175  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0174304  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1530  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  56.33 
 
 
561 aa  613  9.999999999999999e-175  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.712095 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1348  beta-lactamase domain-containing protein  56.29 
 
 
562 aa  613  9.999999999999999e-175  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0621121  hitchhiker  0.000323796 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1390  beta-lactamase domain-containing protein  56.12 
 
 
562 aa  612  9.999999999999999e-175  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0647  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  54.71 
 
 
561 aa  606  9.999999999999999e-173  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1033  beta-lactamase domain protein  54.07 
 
 
561 aa  599  1e-170  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.76638  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1081  beta-lactamase domain-containing protein  56.51 
 
 
561 aa  601  1e-170  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0177081  hitchhiker  0.00575165 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2465  beta-lactamase domain protein  55.17 
 
 
561 aa  598  1e-170  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.867081  normal  0.655144 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3543  beta-lactamase-like  54.5 
 
 
561 aa  596  1e-169  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132705  normal  0.131405 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2169  hypothetical protein  56.43 
 
 
561 aa  596  1e-169  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1200  beta-lactamase domain-containing protein  53.76 
 
 
561 aa  594  1e-168  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.582889  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1230  beta-lactamase domain protein  53.71 
 
 
561 aa  592  1e-168  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.786128  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0792  metallo-beta-lactamase family hydrolase  54.23 
 
 
561 aa  591  1e-167  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.135441  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29160  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  51.9 
 
 
561 aa  588  1e-167  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.813951  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1789  beta-lactamase domain protein  54.63 
 
 
561 aa  585  1e-166  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.114581  normal  0.681062 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7858  beta-lactamase domain protein  54.53 
 
 
561 aa  587  1e-166  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.627673 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1480  beta-lactamase domain protein  55.52 
 
 
561 aa  583  1.0000000000000001e-165  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0694172  normal  0.195502 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1453  beta-lactamase domain-containing protein  53.69 
 
 
563 aa  583  1.0000000000000001e-165  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2316  beta-lactamase domain-containing protein  54.69 
 
 
561 aa  583  1.0000000000000001e-165  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.175765  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09390  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  53.54 
 
 
560 aa  575  1.0000000000000001e-163  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.293183  normal  0.492875 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06070  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  51.18 
 
 
556 aa  575  1.0000000000000001e-163  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.258358  normal  0.112018 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1502  beta-lactamase domain-containing protein  54.17 
 
 
561 aa  575  1.0000000000000001e-163  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.0000603701  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1455  beta-lactamase domain protein  52.35 
 
 
563 aa  576  1.0000000000000001e-163  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000013396 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07160  beta-lactamase domain protein  52.79 
 
 
561 aa  572  1.0000000000000001e-162  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0422873  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10470  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  51.43 
 
 
564 aa  553  1e-156  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.797206  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1150  hypothetical protein  48.19 
 
 
675 aa  540  9.999999999999999e-153  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.920604 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0950  putative metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  47.64 
 
 
616 aa  530  1e-149  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07540  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  43.07 
 
 
631 aa  452  1.0000000000000001e-126  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000160452  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1625  beta-lactamase domain protein  43.43 
 
 
590 aa  439  9.999999999999999e-123  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000210591  hitchhiker  0.00000143957 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0787  beta-lactamase domain protein  39.24 
 
 
554 aa  433  1e-120  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000129126  normal  0.323008 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08700  beta-lactamase domain protein  40.73 
 
 
558 aa  433  1e-120  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000465654  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3163  beta-lactamase domain protein  42.08 
 
 
554 aa  431  1e-119  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1938  beta-lactamase domain-containing protein  41.53 
 
 
554 aa  429  1e-119  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1268  metallo-beta-lactamase family protein  40.88 
 
 
553 aa  427  1e-118  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000954754  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1494  beta-lactamase domain-containing protein  40.62 
 
 
560 aa  425  1e-117  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000870726  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10660  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  41.32 
 
 
644 aa  422  1e-117  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000341022  unclonable  0.00000000210768 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3657  beta-lactamase domain protein  40.69 
 
 
554 aa  424  1e-117  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000145039  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3238  beta-lactamase domain protein  41.37 
 
 
556 aa  421  1e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.015572  normal  0.303561 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1772  beta-lactamase domain protein  40.44 
 
 
555 aa  421  1e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0198506  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1302  hypothetical protein  39.35 
 
 
555 aa  415  9.999999999999999e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0179  beta-lactamase domain protein  37.96 
 
 
591 aa  412  1e-114  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0366  hypothetical protein  40.58 
 
 
558 aa  412  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0664287  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4393  beta-lactamase domain-containing protein  40.91 
 
 
558 aa  412  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0728616  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3415  beta-lactamase domain protein  40.46 
 
 
593 aa  410  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1460  beta-lactamase domain protein  39.96 
 
 
551 aa  411  1e-113  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000017363  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1816  beta-lactamase domain-containing protein  39.34 
 
 
559 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000137497  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1460  beta-lactamase domain protein  38.18 
 
 
566 aa  407  1.0000000000000001e-112  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4057  beta-lactamase domain protein  40.55 
 
 
558 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0947  beta-lactamase domain-containing protein  40.88 
 
 
554 aa  403  1e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2294  beta-lactamase domain-containing protein  38.17 
 
 
618 aa  402  1e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2028  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  38.98 
 
 
555 aa  404  1e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1745  RNA-metabolizing metallo-beta-lactamase family protein  38.98 
 
 
555 aa  404  1e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3971  beta-lactamase domain protein  40 
 
 
558 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.313503  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3833  metallo-beta-lactamase family protein  38.43 
 
 
556 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000419922  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3567  beta-lactamase domain-containing protein  38.62 
 
 
556 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00558369  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3648  metallo-beta-lactamase family protein  38.43 
 
 
556 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3538  metallo-beta-lactamase family protein  38.62 
 
 
556 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0178756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3556  metallo-beta-lactamase family protein  38.43 
 
 
556 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3896  metallo-beta-lactamase family protein  38.8 
 
 
556 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0341705  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0645  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  40.69 
 
 
564 aa  400  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000101529  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3933  metallo-beta-lactamase family protein  38.43 
 
 
556 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00612119  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3845  metallo-beta-lactamase family protein  38.43 
 
 
556 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000592634  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1069  hypothetical protein  39.52 
 
 
555 aa  401  9.999999999999999e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000100194  normal  0.0563275 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2449  beta-lactamase domain-containing protein  38.25 
 
 
583 aa  402  9.999999999999999e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0351233  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1781  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  36.89 
 
 
557 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0160352  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1403  metallo-beta-lactamase family protein  38.62 
 
 
556 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0055609  hitchhiker  0.000000000000158477 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3809  metallo-beta-lactamase family protein  38.43 
 
 
556 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2993599999999999e-37 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3113  metallo-beta-lactamase family protein  40.26 
 
 
533 aa  396  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2447  beta-lactamase domain protein  39.14 
 
 
557 aa  395  1e-109  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1522  metallo-beta-lactamase family protein  36.53 
 
 
557 aa  397  1e-109  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0439193  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1494  Zn-dependent hydrolase  36.53 
 
 
557 aa  395  1e-109  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000794402  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1707  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  36.53 
 
 
557 aa  397  1e-109  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0383  beta-lactamase domain-containing protein  40.44 
 
 
569 aa  396  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0438  metallo-beta-lactamase family protein  39.06 
 
 
551 aa  393  1e-108  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.386369  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3668  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  36.53 
 
 
557 aa  393  1e-108  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000237244  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1730  metallo-beta-lactamase family protein  36.64 
 
 
557 aa  394  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.744262  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1484  Zn-dependent hydrolase  36.53 
 
 
557 aa  395  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000568728  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0941  beta-lactamase domain protein  38.18 
 
 
560 aa  392  1e-108  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1676  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  36.35 
 
 
557 aa  393  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0518689  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_380  metallo-beta-lactamase  39.24 
 
 
551 aa  394  1e-108  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0627  beta-lactamase domain protein  38.73 
 
 
555 aa  391  1e-107  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.223093  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1333  beta-lactamase domain-containing protein  36.15 
 
 
557 aa  391  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4416  beta-lactamase domain-containing protein  39.4 
 
 
569 aa  389  1e-107  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0415  beta-lactamase domain-containing protein  38.88 
 
 
551 aa  392  1e-107  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.223724  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1160  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  37.48 
 
 
555 aa  386  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.121903  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3804  beta-lactamase domain-containing protein  37.66 
 
 
555 aa  388  1e-106  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.199247  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2679  beta-lactamase domain-containing protein  36.38 
 
 
555 aa  383  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000157483  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>