More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3960 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_3960  GTP-binding protein, HSR1-related  100 
 
 		 482 aa  954    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.342247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12738  GTP-binding protein hflX  80.76 
 
 		 495 aa  692    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.324868 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2151  GTP-binding protein, HSR1-related  85.09 
 
 		 483 aa  745    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.464276  normal  0.0136453 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1800  GTP-binding proten HflX  73.5 
 
 		 479 aa  655    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2215  GTP-binding proten HflX  71.65 
 
 		 484 aa  639    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.166526  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2164  GTP-binding protein, HSR1-related  84.89 
 
 		 483 aa  745    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.951338  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2210  GTP-binding protein, HSR1-related  84.89 
 
 		 483 aa  745    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.60775  normal  0.0439435 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2436  GTP-binding protein, HSR1-related  86.51 
 
 		 482 aa  735    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.445847  normal  0.220236 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27610  GTP-binding proten HflX  68.56 
 
 		 482 aa  586  1e-166  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3905  GTP-binding proten HflX  69.02 
 
 		 512 aa  584  1.0000000000000001e-165  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.13556  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7080  GTP-binding proten HflX  68.06 
 
 		 502 aa  580  1e-164  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.750227 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1231  small GTP-binding protein  67.84 
 
 		 503 aa  568  1e-161  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.592117  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3269  GTP-binding proten HflX  67.38 
 
 		 485 aa  566  1e-160  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000617793  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1051  GTP-binding proten HflX  63.88 
 
 		 509 aa  560  1e-158  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.128813 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0820  small GTP-binding protein domain-containing protein  66.16 
 
 		 493 aa  556  1e-157  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1436  GTP-binding proten HflX  68.91 
 
 		 480 aa  554  1e-156  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3981  GTP-binding proten HflX  63.08 
 
 		 487 aa  553  1e-156  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0693971  normal  0.0467716 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1140  GTP-binding proten HflX  65.03 
 
 		 501 aa  549  1e-155  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.762868 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3511  small GTP-binding protein domain-containing protein  68.22 
 
 		 486 aa  548  1e-154  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.67992  normal  0.0915245 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1468  GTP-binding proten HflX  65.34 
 
 		 553 aa  541  1e-153  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000115477 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0684  GTP-binding proten HflX  65.58 
 
 		 512 aa  538  9.999999999999999e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.518988  normal  0.674112 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2263  GTP-binding family protein ; K03665 GTP-binding protein HflX  64.26 
 
 		 494 aa  537  1e-151  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0586252 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1466  small GTP-binding protein  65.2 
 
 		 522 aa  533  1e-150  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00807526  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10600  GTP-binding proten HflX  66.3 
 
 		 521 aa  531  1e-149  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.697427  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17490  GTP-binding proten HflX  66.07 
 
 		 517 aa  531  1e-149  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106124  normal  0.236778 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1482  small GTP-binding protein  68.01 
 
 		 524 aa  525  1e-148  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.578947  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1562  GTP-binding proten HflX  65.43 
 
 		 505 aa  523  1e-147  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.410019  hitchhiker  0.00407104 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23070  GTP-binding proten HflX  64.37 
 
 		 515 aa  520  1e-146  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0748737 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3837  GTP-binding protein, HSR1-related  62.26 
 
 		 493 aa  521  1e-146  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2436  GTP-binding proten HflX  64.93 
 
 		 493 aa  514  1e-144  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.292704  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1255  GTP-binding proten HflX  64.25 
 
 		 515 aa  511  1e-143  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1449  GTP-binding protein, HSR1-related  64.5 
 
 		 494 aa  503  1e-141  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.062201  normal  0.276789 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1407  small GTP-binding protein  64.49 
 
 		 515 aa  503  1e-141  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000155427 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07300  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein TIGR00650  63.84 
 
 		 546 aa  498  1e-140  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4564  GTP-binding proten HflX  66.24 
 
 		 466 aa  494  9.999999999999999e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.631716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1503  small GTP-binding protein  62.19 
 
 		 530 aa  486  1e-136  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0726763  normal  0.6234 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0164  GTPase  57.43 
 
 		 501 aa  458  1e-127  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0583  GTP-binding protein HflX  56.29 
 
 		 512 aa  456  1e-127  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.622699 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10790  GTP-binding proten HflX  47.54 
 
 		 433 aa  343  5e-93  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000931239  unclonable  0.00000000274038 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1612  GTP-binding proten HflX  47.93 
 
 		 436 aa  339  5e-92  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000211402  unclonable  5.44053e-16 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0772  GTP-binding proten HflX  43.19 
 
 		 437 aa  326  5e-88  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.426006  normal  0.338027 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  43.59 
 
 		 441 aa  320  3e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1259  GTP-binding protein, HSR1-related  44.26 
 
 		 421 aa  318  1e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027448  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11140  small GTP-binding protein  44.06 
 
 		 395 aa  317  3e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3611  GTP-binding proten HflX  46.02 
 
 		 414 aa  317  3e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0108116  normal  0.379187 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2926  GTP1/OBG protein  44.99 
 
 		 444 aa  315  9.999999999999999e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0180067  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1110  GTP-binding protein, HSR1-related  48.92 
 
 		 422 aa  315  9.999999999999999e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000612987  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0528  GTP-binding proten HflX  56.87 
 
 		 384 aa  311  1e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.270654  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2081  small GTP-binding protein  45.22 
 
 		 582 aa  306  7e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00812611  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3097  GTP-binding proten HflX  45.45 
 
 		 461 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000356343  normal  0.400149 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3241  GTP-binding proten HflX  46.51 
 
 		 553 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300166  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32115  predicted protein  41.51 
 
 		 519 aa  301  1e-80  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0250041 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3144  small GTP-binding protein  44.06 
 
 		 454 aa  301  2e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000830464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2334  small GTP-binding protein  43.49 
 
 		 454 aa  299  6e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_1719  predicted protein  42.86 
 
 		 415 aa  298  1e-79  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0658  GTP-binding proten HflX  48.74 
 
 		 425 aa  297  3e-79  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  43.22 
 
 		 442 aa  294  2e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4111  GTP-binding proten HflX  44.58 
 
 		 425 aa  295  2e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2012  GTP-binding proten HflX  43.42 
 
 		 440 aa  291  2e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0178  GTP-binding proten HflX  44.13 
 
 		 596 aa  290  5.0000000000000004e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.22171  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1441  small GTP-binding protein  40.78 
 
 		 413 aa  287  2e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1834  GTP-binding protein, HSR1-related  46.36 
 
 		 528 aa  287  2.9999999999999996e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0275  GTP-binding proten HflX  45.43 
 
 		 564 aa  286  4e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0275  GTP-binding proten HflX  45.43 
 
 		 564 aa  286  5e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1906  GTP-binding proten HflX  46.36 
 
 		 583 aa  285  9e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1434  GTP-binding protein HSR1-related  38.98 
 
 		 419 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3259  GTP-binding proten HflX  45.61 
 
 		 450 aa  284  2.0000000000000002e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0957781 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1731  GTP-binding proten HflX  42.41 
 
 		 434 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0879  GTP-binding proten HflX  48.55 
 
 		 561 aa  284  3.0000000000000004e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1737  GTP-binding protein, HSR1-related  45.41 
 
 		 434 aa  284  3.0000000000000004e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.260139  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0534  GTP-binding proten HflX  42.07 
 
 		 420 aa  283  5.000000000000001e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000187355  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0536  putative GTPase HflX  43.22 
 
 		 426 aa  283  5.000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000302275  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1081  GTP-binding proten HflX  40.51 
 
 		 405 aa  282  8.000000000000001e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0783851  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3820  GTP-binding proten HflX  41.59 
 
 		 426 aa  281  1e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0373648  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4759  putative GTPase HflX  41.59 
 
 		 426 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3508  GTP-binding protein  38.69 
 
 		 419 aa  282  1e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00154  GTP-binding protein  44.85 
 
 		 428 aa  282  1e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2262  GTP-binding proten HflX  41.46 
 
 		 435 aa  282  1e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4630  putative GTPase HflX  41.35 
 
 		 426 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.048412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4208  GTP-binding protein, HSR1-related  46.34 
 
 		 574 aa  280  3e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.552873 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4640  putative GTPase HflX  41.35 
 
 		 426 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.208484  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4780  putative GTPase HflX  41.35 
 
 		 426 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0452958  normal  0.331117 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4723  putative GTPase HflX  41.35 
 
 		 426 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2768  GTP-binding protein, HSR1-related  42.96 
 
 		 432 aa  280  3e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0396  GTP-binding protein, HSR1-related  41.73 
 
 		 489 aa  280  4e-74  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4704  putative GTPase HflX  41.59 
 
 		 426 aa  280  4e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04040  predicted GTPase  41.59 
 
 		 426 aa  280  5e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.188583  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4415  putative GTPase HflX  41.59 
 
 		 426 aa  280  5e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.446722  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3840  putative GTPase HflX  41.59 
 
 		 426 aa  280  5e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.209609  hitchhiker  0.000000230034 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4731  putative GTPase HflX  41.59 
 
 		 426 aa  280  5e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04002  hypothetical protein  41.59 
 
 		 426 aa  280  5e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.170688  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4644  putative GTPase HflX  41.59 
 
 		 426 aa  280  5e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0602066 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0394  small GTP-binding protein  42.38 
 
 		 406 aa  280  5e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000766043  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3720  putative GTPase HflX  42.34 
 
 		 426 aa  280  5e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00523075  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5689  putative GTPase HflX  41.59 
 
 		 426 aa  280  5e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0600434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1355  GTP-binding protein HflX  46.07 
 
 		 435 aa  280  6e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1689  GTP1/OBG protein  38.52 
 
 		 419 aa  280  6e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1951  GTP-binding protein  38.69 
 
 		 419 aa  279  6e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.697887  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0057  GTP-binding proten HflX  42.42 
 
 		 450 aa  279  8e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.583436  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0477  GTP-binding proten HflX  45.54 
 
 		 401 aa  279  8e-74  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00918489  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>