More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3952 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
340 aa  688    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  85.29 
 
 
340 aa  578  1e-164  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  83.53 
 
 
340 aa  561  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  83.82 
 
 
340 aa  563  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  83.53 
 
 
340 aa  561  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  74.49 
 
 
341 aa  536  1e-151  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  59.59 
 
 
350 aa  398  9.999999999999999e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  57.43 
 
 
361 aa  333  2e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  56.31 
 
 
350 aa  333  3e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  53.23 
 
 
309 aa  322  4e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  52.72 
 
 
333 aa  315  8e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  51.85 
 
 
314 aa  310  2.9999999999999997e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  52.26 
 
 
322 aa  300  3e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  52.82 
 
 
301 aa  298  7e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  47.37 
 
 
291 aa  238  2e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  47.18 
 
 
290 aa  236  4e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  47.14 
 
 
291 aa  235  6e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  47.14 
 
 
291 aa  235  6e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  47.14 
 
 
291 aa  235  6e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  46.37 
 
 
287 aa  234  1.0000000000000001e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  45.74 
 
 
295 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  46.29 
 
 
298 aa  226  6e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  30.68 
 
 
296 aa  132  6e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  31.16 
 
 
284 aa  116  5e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0994  alpha/beta hydrolase fold  29.64 
 
 
281 aa  114  3e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.795664 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0809  alpha/beta hydrolase fold  31.76 
 
 
283 aa  114  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 
275 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  29.71 
 
 
284 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  31.56 
 
 
286 aa  110  3e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  35.27 
 
 
290 aa  110  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.93 
 
 
372 aa  103  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  29.97 
 
 
271 aa  103  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3071  alpha/beta hydrolase fold  27.44 
 
 
290 aa  102  8e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.357729  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1459  alpha/beta hydrolase fold  28.67 
 
 
276 aa  102  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  28.47 
 
 
308 aa  101  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 
345 aa  101  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3858  alpha/beta hydrolase fold  28.85 
 
 
304 aa  100  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1030  alpha/beta hydrolase fold  28.93 
 
 
280 aa  100  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.999949  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0986  alpha/beta hydrolase fold protein  32.85 
 
 
279 aa  100  5e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2918  alpha/beta hydrolase fold protein  28.39 
 
 
310 aa  99  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000917268  normal  0.0712608 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22090  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  27.9 
 
 
285 aa  97.8  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00622193 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4430  alpha/beta fold family hydrolase  27.04 
 
 
287 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.12561  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  27.49 
 
 
275 aa  97.4  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0148  alpha/beta hydrolase fold  28.98 
 
 
266 aa  97.1  3e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.443703  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1331  Alpha/beta hydrolase fold  29.02 
 
 
278 aa  97.1  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000258733 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1186  hydrolase, alpha/beta fold family  26.24 
 
 
291 aa  96.7  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000004858  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  27.92 
 
 
271 aa  96.7  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2792  alpha/beta hydrolase fold protein  26.22 
 
 
260 aa  95.9  8e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.377437 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3307  alpha/beta fold family hydrolase  26.82 
 
 
300 aa  95.9  9e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1553  alpha/beta hydrolase fold protein  27.3 
 
 
286 aa  95.9  9e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000230075  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0939  alpha/beta hydrolase fold family lipase  25.86 
 
 
291 aa  95.5  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000150383  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  30.4 
 
 
264 aa  95.5  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  27.65 
 
 
339 aa  95.1  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1100  hydrolase, alpha/beta fold family  25.86 
 
 
291 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.59036e-57 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  28.28 
 
 
316 aa  95.5  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1120  alpha/beta fold family hydrolase  26.24 
 
 
291 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00823936  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2674  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  44.86 
 
 
282 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0953  alpha/beta fold family hydrolase  25.86 
 
 
291 aa  95.1  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0931  alpha/beta hydrolase fold family lipase  26.24 
 
 
291 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000302651  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2696  alpha/beta hydrolase fold protein  30.15 
 
 
268 aa  94.4  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.094894  normal  0.233594 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1019  alpha/beta fold family hydrolase  25.86 
 
 
291 aa  95.1  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00544898  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3011  alpha/beta hydrolase fold  27.15 
 
 
300 aa  95.1  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245192  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  39.13 
 
 
302 aa  95.1  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4246  alpha/beta hydrolase fold  26.07 
 
 
288 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.912428  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4241  hydrolase, alpha/beta fold family  25.55 
 
 
290 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0213697  hitchhiker  0.0000000245564 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4196  alpha/beta hydrolase fold  26.45 
 
 
294 aa  94.7  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1114  alpha/beta hydrolase fold  26.6 
 
 
405 aa  94.7  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.060895  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2270  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 
298 aa  94.4  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3756  alpha/beta hydrolase fold  27.69 
 
 
504 aa  95.1  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.740741  normal  0.0321393 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3844  alpha/beta hydrolase fold protein  31.29 
 
 
289 aa  94.7  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3581  alpha/beta hydrolase fold  39.13 
 
 
302 aa  94.7  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.950076 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1057  hydrolase, alpha/beta fold family  25.91 
 
 
290 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000161202  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3527  alpha/beta hydrolase fold  27.55 
 
 
257 aa  94.7  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.425595  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1023  alpha/beta hydrolase fold  30.11 
 
 
284 aa  94.4  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  30.4 
 
 
265 aa  94.4  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4481  hydrolase, alpha/beta fold family  26.97 
 
 
294 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0487  alpha/beta hydrolase fold  26.34 
 
 
240 aa  94  3e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0174  cyclic nucleotide-binding protein  26.62 
 
 
456 aa  94.4  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000271627  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3655  alpha/beta hydrolase fold  28.32 
 
 
312 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1760  alpha/beta hydrolase fold  40.16 
 
 
302 aa  94.4  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176394  normal  0.0428772 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5552  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.75 
 
 
370 aa  93.6  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.077135  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0273  alpha/beta fold family hydrolase  25 
 
 
258 aa  93.6  5e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000365907  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3083  alpha/beta hydrolase fold  28.41 
 
 
292 aa  93.6  5e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000632175  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1929  3-Oxoadipate enol-lactonase  26.82 
 
 
300 aa  93.2  6e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.878211  normal  0.500669 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2141  alpha/beta hydrolase fold  29.12 
 
 
284 aa  92.8  7e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0471  alpha/beta hydrolase fold protein  28.72 
 
 
267 aa  92.8  7e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  43.93 
 
 
277 aa  92.8  8e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  29.25 
 
 
287 aa  92.8  9e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  26.53 
 
 
275 aa  91.7  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  27.49 
 
 
309 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2400  alpha/beta hydrolase fold  25.81 
 
 
288 aa  92  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2200  alpha/beta hydrolase fold protein  28.94 
 
 
278 aa  92  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1509  alpha/beta hydrolase fold  28.12 
 
 
287 aa  91.3  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  27.27 
 
 
265 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4621  alpha/beta hydrolase fold  30.48 
 
 
283 aa  91.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0940  alpha/beta hydrolase fold  24.82 
 
 
290 aa  91.7  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.178351  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3545  alpha/beta hydrolase fold protein  30.48 
 
 
283 aa  91.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158387  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3303  3-Oxoadipate enol-lactonase  26.49 
 
 
300 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664184  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3338  alpha/beta hydrolase fold  25.27 
 
 
271 aa  91.3  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3320  hydrolase, alpha/beta fold family  26.91 
 
 
300 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>