231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3924 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_2253  pH-dependent sodium/proton antiporter  75.73 
 
 
450 aa  641  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254168  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2476  pH-dependent sodium/proton antiporter  88.34 
 
 
464 aa  715  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.946252  normal  0.639371 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2196  pH-dependent sodium/proton antiporter  75.51 
 
 
450 aa  640  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.045378  normal  0.0524961 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3924  pH-dependent sodium/proton antiporter  100 
 
 
447 aa  865  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00452006  normal  0.998293 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2207  pH-dependent sodium/proton antiporter  75.96 
 
 
441 aa  642  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0345  Na+/H+ antiporter NhaA  64.92 
 
 
434 aa  535  1e-151  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2105  Na+/H+ antiporter NhaA  65.12 
 
 
462 aa  513  1e-144  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4630  Na+/H+ antiporter NhaA  65.52 
 
 
461 aa  499  1e-140  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.726539  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3027  pH-dependent sodium/proton antiporter  59.87 
 
 
449 aa  485  1e-136  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.751517 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0203  Na+/H+ antiporter NhaA  63.07 
 
 
434 aa  474  1e-132  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0229594  normal  0.01526 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6928  Na+/H+ antiporter NhaA  58.56 
 
 
446 aa  470  1e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126973  normal  0.148656 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2920  Na+/H+ antiporter NhaA  64.24 
 
 
463 aa  470  1e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.410818  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12160  Na+/H+ antiporter NhaA  61.03 
 
 
436 aa  470  1e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2118  pH-dependent sodium/proton antiporter  62.39 
 
 
436 aa  468  1e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0195602 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1657  Na+/H+ antiporter NhaA  62.73 
 
 
432 aa  466  1e-130  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.017914 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0107  pH-dependent sodium/proton antiporter  59.21 
 
 
461 aa  466  1e-130  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2583  pH-dependent sodium/proton antiporter  63.07 
 
 
442 aa  468  1e-130  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.281476 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2262  pH-dependent sodium/proton antiporter  61.3 
 
 
436 aa  465  1e-130  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.50629  normal  0.0112773 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0405  Na+/H+ antiporter NhaA  62.59 
 
 
437 aa  463  1e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3507  Na+/H+ antiporter NhaA  60.19 
 
 
429 aa  449  1e-125  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.486632  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1152  Na+/H+ antiporter NhaA  54.87 
 
 
453 aa  428  1e-119  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2512  Na+/H+ antiporter NhaA  55.12 
 
 
451 aa  418  1e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0116131  normal  0.0122824 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4510  Na+/H+ antiporter NhaA  51.15 
 
 
422 aa  357  3e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2573  Na+/H+ antiporter NhaA  52.37 
 
 
539 aa  337  2e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.109155  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2301  Na+/H+ antiporter NhaA  49.88 
 
 
414 aa  335  1e-90  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30430  Na+/H+ antiporter NhaA  49.74 
 
 
440 aa  332  8e-90  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27000  Na+/H+ antiporter NhaA  50.23 
 
 
429 aa  330  2e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.358876  normal  0.743342 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1238  Na+/H+ antiporter NhaA  56.51 
 
 
431 aa  330  3e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0880  Na+/H+ antiporter NhaA  50.75 
 
 
401 aa  311  1e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0066  Na+/H+ antiporter NhaA  44.8 
 
 
433 aa  308  2e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0476  Na+/H+ antiporter NhaA  48.89 
 
 
408 aa  308  2e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0261  Na+/H+ antiporter NhaA  50.12 
 
 
390 aa  299  8e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.947479  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1410  Na+/H+ antiporter NhaA  49.15 
 
 
442 aa  297  3e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3924  Na+/H+ antiporter NhaA  45.59 
 
 
402 aa  295  9e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0288538  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0925  Na+/H+ antiporter NhaA  48.85 
 
 
436 aa  280  4e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4842  Na+/H+ antiporter NhaA  44.17 
 
 
413 aa  279  6e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0868  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.93 
 
 
391 aa  267  3e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.128339 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2941  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.57 
 
 
394 aa  263  4e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.135486  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2616  Na+/H+ antiporter NhaA  44.18 
 
 
391 aa  258  2e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.536675  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1390  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.4 
 
 
391 aa  257  3e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000519432  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3091  Na+/H+ antiporter NhaA  52.78 
 
 
447 aa  257  3e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.904983  hitchhiker  1.7266e-05 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5677  Na+/H+ antiporter NhaA  43.77 
 
 
404 aa  252  1e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.575468  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1756  Na+/H+ antiporter NhaA  37.62 
 
 
394 aa  252  1e-65  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0842  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.75 
 
 
390 aa  251  2e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1336  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.07 
 
 
389 aa  250  4e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7296  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.51 
 
 
399 aa  250  4e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.059957  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1896  pH-dependent sodium/proton antiporter  35.19 
 
 
400 aa  248  2e-64  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3347  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.28 
 
 
407 aa  247  4e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1147  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.92 
 
 
391 aa  246  5e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1189  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.4 
 
 
389 aa  246  9e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.685573  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1266  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.4 
 
 
389 aa  245  9e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3124  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.4 
 
 
389 aa  245  1e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.646901  normal  0.440513 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.4 
 
 
389 aa  245  1e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4069  Na+/H+ antiporter NhaA  40.71 
 
 
455 aa  245  1e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.16071 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0407  Na+/H+ antiporter NhaA  41.25 
 
 
425 aa  244  2e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3699  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.69 
 
 
397 aa  244  2e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.262179 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  40.25 
 
 
396 aa  244  2e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.168803  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0732  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.57 
 
 
409 aa  244  3e-63  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  37.59 
 
 
391 aa  243  4e-63  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3038  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.59 
 
 
389 aa  243  4e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.474949 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2026  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.05 
 
 
382 aa  243  5e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.470958  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6044  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.12 
 
 
400 aa  242  8e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.227636  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2860  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.33 
 
 
389 aa  242  8e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.611153  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3264  sodium-proton antiporter NhaA  38.42 
 
 
382 aa  241  1e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000713954 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2277  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.45 
 
 
397 aa  241  1e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00329368  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2942  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.12 
 
 
389 aa  241  1e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0919251  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2666  Na+/H+ antiporter NhaA  42.93 
 
 
445 aa  241  2e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.657461  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00573  Na+/H+ antiporter, NhaA  40.25 
 
 
424 aa  241  3e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2307  Na+/H+ antiporter NhaA  39.05 
 
 
455 aa  241  3e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0364  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.72 
 
 
391 aa  240  4e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0869  putative Na+/H+ antiporter NhaA  39.11 
 
 
419 aa  238  1e-61  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3089  Na+/H+ antiporter NhaA  39.3 
 
 
406 aa  238  2e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.761361  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5991  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.84 
 
 
399 aa  238  2e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.688009  normal  0.157669 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3135  Na+/H+ antiporter NhaA  38.82 
 
 
398 aa  237  3e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0694  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.67 
 
 
398 aa  237  4e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000263731  hitchhiker  0.00301245 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0963  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.36 
 
 
395 aa  236  5e-61  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  1.93238e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3851  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.58 
 
 
398 aa  236  5e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.79655  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4405  Na+/H+ antiporter NhaA  38 
 
 
408 aa  236  6e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.05 
 
 
382 aa  236  9e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  5.35639e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4283  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.55 
 
 
391 aa  235  1e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.01 
 
 
388 aa  233  4e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0042  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.01 
 
 
388 aa  233  4e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975088  hitchhiker  0.00613874 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.01 
 
 
388 aa  233  4e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.01 
 
 
388 aa  233  4e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.01 
 
 
388 aa  233  4e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.62168  normal  0.149849 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1025  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.44 
 
 
391 aa  233  6e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5174  sodium-proton antiporter NhaA  42.12 
 
 
391 aa  233  7e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2582  Na+/H+ antiporter NhaA  39.65 
 
 
393 aa  232  8e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0683  Kef-type K+ transport system membrane protein  36.18 
 
 
472 aa  232  9e-60  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1563  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.81 
 
 
421 aa  231  2e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.172648  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1488  Na+/H+ antiporter  37.28 
 
 
386 aa  230  4e-59  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1168  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.81 
 
 
397 aa  230  4e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4197  Na+/H+ antiporter NhaA  38.97 
 
 
401 aa  230  4e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.917396  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02646  pH-dependent sodium/proton antiporter  36.01 
 
 
391 aa  229  7e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1132  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.35 
 
 
397 aa  229  8e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.422688  normal  0.012742 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4598  Na+/H+ antiporter NhaA  41.98 
 
 
408 aa  229  8e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0028  Na+/H+ antiporter NhaA  36.92 
 
 
396 aa  228  1e-58  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3022  Na+/H+ antiporter NhaA  37.12 
 
 
395 aa  228  1e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.396021  normal  0.0264038 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3610  Na+/H+ antiporter NhaA  41.19 
 
 
413 aa  229  1e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.150292  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003767  Na+/H+ antiporter NhaA type  37.08 
 
 
383 aa  229  1e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>