58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3720 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3720  hypothetical protein  100 
 
 
458 aa  902    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.079292 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0041  hypothetical protein  51.12 
 
 
494 aa  239  5.999999999999999e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2825  PE-PPE-like protein  44.24 
 
 
542 aa  219  6e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0670236  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2852  hypothetical protein  44.24 
 
 
542 aa  219  6e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.493175  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2869  hypothetical protein  44.24 
 
 
542 aa  219  6e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.826193  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1714  hypothetical protein  35.68 
 
 
307 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1735  PE-PPE-like protein  35.68 
 
 
307 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.672251  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1782  hypothetical protein  35.68 
 
 
307 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0582943  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11459  PE family protein  37.21 
 
 
528 aa  98.2  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.114453 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4281  PE-PPE-like protein  35.06 
 
 
517 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.55456  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4660  hypothetical protein  35.06 
 
 
517 aa  95.9  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.741942  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4367  hypothetical protein  35.06 
 
 
517 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.100384 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4726  hypothetical protein  32.39 
 
 
526 aa  90.5  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0761  hypothetical protein  36.41 
 
 
401 aa  89  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.482624  normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11831  PPE family protein  30.87 
 
 
655 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4030  PE-PPE domain protein  30.51 
 
 
540 aa  85.5  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.276755  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12627  PPE family protein  31.76 
 
 
580 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000062358  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1011  hypothetical protein  30.13 
 
 
427 aa  77.4  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0659585 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10161  PE family protein  27.56 
 
 
502 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00736493  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10152  PE family protein  30.14 
 
 
588 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3106  hypothetical protein  29.92 
 
 
411 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.929764  normal  0.572466 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0967  hypothetical protein  27.52 
 
 
529 aa  70.1  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0508627 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0949  PE-PPE-like protein  27.52 
 
 
529 aa  70.1  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0407  hypothetical protein  35.64 
 
 
499 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0427492  normal  0.291032 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3378  hypothetical protein  29.44 
 
 
783 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.420884 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1918  hypothetical protein  32.27 
 
 
533 aa  67.8  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.777477  normal  0.457029 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4815  hypothetical protein  34.55 
 
 
517 aa  67.8  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.036701  normal  0.942051 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3250  hypothetical protein  29.83 
 
 
391 aa  67  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.353838  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0970  hypothetical protein  28.68 
 
 
527 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4951  PE-PPE-like protein  29.02 
 
 
433 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0809948  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5039  hypothetical protein  29.02 
 
 
413 aa  64.3  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0487726  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5332  hypothetical protein  29.02 
 
 
433 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0419  PE-PPE-like protein  35.53 
 
 
341 aa  60.5  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0428  hypothetical protein  35.53 
 
 
341 aa  60.5  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0973739  normal  0.522988 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10153  PE family protein  30.04 
 
 
533 aa  60.1  0.00000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5244  hypothetical protein  29.74 
 
 
433 aa  60.1  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1597  hypothetical protein  30.65 
 
 
898 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.489596 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3374  hypothetical protein  30.8 
 
 
421 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.7916 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5374  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 
469 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00219714 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10160  PE family protein  26.72 
 
 
468 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0401  hypothetical protein  28.76 
 
 
380 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.530994  normal  0.562815 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0276  hypothetical protein  28.51 
 
 
388 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33965  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2967  hypothetical protein  29.38 
 
 
401 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550701  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3110  hypothetical protein  31.5 
 
 
768 aa  53.5  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3371  hypothetical protein  31.15 
 
 
431 aa  53.5  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.21394  normal  0.757107 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0248  PE-PPE-like protein  27.16 
 
 
377 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158139  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0258  hypothetical protein  27.16 
 
 
377 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0307728 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0238  hypothetical protein  27.16 
 
 
377 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.107724  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4723  hypothetical protein  30.68 
 
 
416 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.795811  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13856  hypothetical protein  27.7 
 
 
404 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.784877 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13572  PPE family protein  30.65 
 
 
479 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000542589 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3102  hypothetical protein  32.8 
 
 
410 aa  47  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0057545  normal  0.238846 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11208  hypothetical protein  34.55 
 
 
359 aa  46.6  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4518  hypothetical protein  28.8 
 
 
423 aa  45.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1838  hypothetical protein  31.36 
 
 
435 aa  45.1  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.896009 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1238  hypothetical protein  23.63 
 
 
518 aa  44.7  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.207514 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3103  hypothetical protein  28.48 
 
 
413 aa  43.5  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0463748  normal  0.241935 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4081  hypothetical protein  26.38 
 
 
461 aa  43.1  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0716576  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>