More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3544 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0064  lysyl-tRNA synthetase  52.42 
 
 		 1100 aa  1023    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.9544  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1737  lysyl-tRNA synthetase  47.7 
 
 		 1120 aa  808    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11657  lysyl-tRNA synthetase  74.34 
 
 		 1172 aa  1600    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.73947 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0906  lysyl-tRNA synthetase  51.47 
 
 		 1094 aa  922    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3544  lysyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 1101 aa  2219    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.899884 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0127  lysyl-tRNA synthetase  59.03 
 
 		 1138 aa  1240    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2983  lysyl-tRNA synthetase  82.59 
 
 		 1112 aa  1776    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11780  lysyl-tRNA synthetase (class II)  45.85 
 
 		 1147 aa  827    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.105343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3970  lysyl-tRNA synthetase  46.47 
 
 		 1113 aa  858    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2998  lysyl-tRNA synthetase  82.75 
 
 		 1111 aa  1782    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.604901  normal  0.107077 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2661  Lysyl-tRNA synthetase (class II)-like protein  50.58 
 
 		 1098 aa  1022    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0688281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3027  lysyl-tRNA synthetase  82.59 
 
 		 1112 aa  1776    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3330  lysyl-tRNA synthetase  88.2 
 
 		 1100 aa  1915    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.27282  normal  0.711465 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8377  lysyl-tRNA synthetase  56.62 
 
 		 506 aa  556  1e-157  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2881  lysyl-tRNA synthetase  55.92 
 
 		 496 aa  527  1e-148  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.075021  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4987  lysyl-tRNA synthetase  53.09 
 
 		 500 aa  514  1e-144  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.771259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16450  lysyl-tRNA synthetase  51.51 
 
 		 499 aa  494  9.999999999999999e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3422  lysyl-tRNA synthetase  52.44 
 
 		 499 aa  494  9.999999999999999e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.316072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9155  lysyl-tRNA synthetase  52.31 
 
 		 500 aa  494  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4482  lysyl-tRNA synthetase  52.03 
 
 		 499 aa  489  1e-136  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0216  lysyl-tRNA synthetase  51.93 
 
 		 501 aa  489  1e-136  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.404886  normal  0.127983 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0637  lysyl-tRNA synthetase  50.31 
 
 		 528 aa  458  1e-127  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4277  lysyl-tRNA synthetase  49.3 
 
 		 502 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.654573 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4711  lysyl-tRNA synthetase  49.09 
 
 		 502 aa  446  1e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.243441  hitchhiker  0.000510854 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0855  lysyl-tRNA synthetase  47.58 
 
 		 504 aa  441  9.999999999999999e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0329  lysyl-tRNA synthetase  48.31 
 
 		 503 aa  440  9.999999999999999e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4347  lysyl-tRNA synthetase  49.8 
 
 		 516 aa  441  9.999999999999999e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12890  lysyl-tRNA synthetase (class II)  48.37 
 
 		 502 aa  438  1e-121  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0133257  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0641  lysyl-tRNA synthetase  48.08 
 
 		 495 aa  434  1e-120  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.15563 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2977  lysyl-tRNA synthetase  47.33 
 
 		 504 aa  432  1e-119  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.120285  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31970  lysyl-tRNA synthetase (class II)  47.63 
 
 		 510 aa  430  1e-119  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24660  lysyl-tRNA synthetase  45.99 
 
 		 520 aa  420  1e-116  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4758  lysyl-tRNA synthetase  46.84 
 
 		 512 aa  421  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.38099  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4844  lysyl-tRNA synthetase  46.84 
 
 		 512 aa  421  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2092  lysyl-tRNA synthetase  47.34 
 
 		 515 aa  419  9.999999999999999e-116  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5144  lysyl-tRNA synthetase  46.64 
 
 		 512 aa  420  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0576  lysyl-tRNA synthetase  47.02 
 
 		 500 aa  419  9.999999999999999e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.1487  normal  0.0696554 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6309  lysyl-tRNA synthetase  43.48 
 
 		 501 aa  411  1e-113  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01510  lysyl-tRNA synthetase  45.95 
 
 		 504 aa  410  1e-113  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4000  lysyl-tRNA synthetase  45.04 
 
 		 507 aa  412  1e-113  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0720  lysyl-tRNA synthetase  47.04 
 
 		 503 aa  411  1e-113  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.574509  normal  0.145533 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0393  lysine--tRNA ligase  44.72 
 
 		 565 aa  411  1e-113  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5360  lysyl-tRNA synthetase  47.21 
 
 		 509 aa  410  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.370612  normal  0.216522 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13631  lysyl-tRNA synthetase  47.93 
 
 		 505 aa  403  1e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.57395e-59  normal  0.0200312 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0165  lysyl-tRNA synthetase  45.14 
 
 		 510 aa  405  1e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0329  lysyl-tRNA synthetase  46.15 
 
 		 512 aa  405  1e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6803  protein of unknown function DUF470  42.12 
 
 		 592 aa  396  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0883  lysyl-tRNA synthetase  43.51 
 
 		 573 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1428  lysyl-tRNA synthetase  46.79 
 
 		 501 aa  391  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.680622  normal  0.318104 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1777  lysyl-tRNA synthetase  43 
 
 		 560 aa  389  1e-106  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0105014  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0856  lysyl-tRNA synthetase  43.11 
 
 		 573 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1032  lysyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 		 501 aa  389  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.565305  normal  0.238368 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2515  lysyl-tRNA synthetase  43.7 
 
 		 1118 aa  382  1e-104  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.889838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1906  lysyl-tRNA synthetase  49.33 
 
 		 498 aa  381  1e-104  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1711  lysyl-tRNA synthetase  41.48 
 
 		 512 aa  377  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00750  Lysyl-tRNA synthetase  42.18 
 
 		 491 aa  379  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253681  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0190  lysyl-tRNA synthetase (class II)  41.05 
 
 		 496 aa  377  1e-103  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0659  lysyl-tRNA synthetase  41.43 
 
 		 497 aa  377  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000863751  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0345  lysyl-tRNA synthetase  41.48 
 
 		 573 aa  373  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1647  lysyl-tRNA synthetase  41.77 
 
 		 489 aa  370  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13230  lysyl-tRNA synthetase (class II)  41.68 
 
 		 771 aa  372  1e-101  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0295969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18281  lysyl-tRNA synthetase  41.6 
 
 		 488 aa  371  1e-101  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.505849  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18071  lysyl-tRNA synthetase  42.54 
 
 		 512 aa  373  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.66414  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04000  lysine tRNA synthetase, inducible  40.91 
 
 		 505 aa  367  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0209  lysyl-tRNA synthetase  42.45 
 
 		 495 aa  369  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000164497  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3862  lysyl-tRNA synthetase  40.91 
 
 		 505 aa  367  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3898  lysyl-tRNA synthetase  40.91 
 
 		 505 aa  367  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4684  lysyl-tRNA synthetase  40.91 
 
 		 505 aa  367  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2476  protein of unknown function DUF470  50.96 
 
 		 578 aa  368  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1485  lysyl-tRNA synthetase  41.28 
 
 		 562 aa  369  1e-100  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1357  lysyl-tRNA synthetase  41.58 
 
 		 501 aa  368  1e-100  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1187  lysyl-tRNA synthetase  42.94 
 
 		 533 aa  369  1e-100  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.33244  normal  0.0846582 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0384  lysyl-tRNA synthetase  42.01 
 
 		 509 aa  368  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.808438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18101  lysyl-tRNA synthetase  40.67 
 
 		 512 aa  370  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0116  lysyl-tRNA synthetase  40.16 
 
 		 493 aa  368  1e-100  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0354257  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03962  hypothetical protein  40.91 
 
 		 505 aa  367  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0251  lysyl-tRNA synthetase  41.87 
 
 		 499 aa  369  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000260184  normal  0.314985 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4370  lysyl-tRNA synthetase  40.91 
 
 		 505 aa  367  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.119358  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5645  lysyl-tRNA synthetase  40.91 
 
 		 505 aa  367  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4598  lysyl-tRNA synthetase  40.71 
 
 		 505 aa  365  2e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.221304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3150  lysyl-tRNA synthetase  41 
 
 		 561 aa  365  2e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000153086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2415  lysyl-tRNA synthetase  41.82 
 
 		 504 aa  365  3e-99  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0221722 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1477  lysyl-tRNA synthetase  41.62 
 
 		 502 aa  365  3e-99  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0701287  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1586  lysyl-tRNA synthetase  41.32 
 
 		 507 aa  364  6e-99  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1733  lysyl-tRNA synthetase  41.16 
 
 		 511 aa  363  7.0000000000000005e-99  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0007  lysyl-tRNA synthetase  41.46 
 
 		 497 aa  363  7.0000000000000005e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3308  lysyl-tRNA synthetase  40.56 
 
 		 505 aa  363  7.0000000000000005e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0810  lysyl-tRNA synthetase  38.38 
 
 		 499 aa  363  8e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000714975  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0503  lysyl-tRNA synthetase  40.43 
 
 		 504 aa  363  9e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01841  lysyl-tRNA synthetase  43.31 
 
 		 508 aa  363  9e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0154  lysyl-tRNA synthetase  42.77 
 
 		 502 aa  363  1e-98  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0152  lysyl-tRNA synthetase  41.49 
 
 		 489 aa  363  1e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000016249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17441  lysyl-tRNA synthetase  42.97 
 
 		 503 aa  363  1e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.553165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0888  lysyl-tRNA synthetase  40.08 
 
 		 501 aa  362  3e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1370  lysyl-tRNA synthetase  39.48 
 
 		 578 aa  361  4e-98  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.394303 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0110  lysyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 		 502 aa  361  4e-98  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.296046 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0009  lysyl-tRNA synthetase  42.28 
 
 		 489 aa  361  4e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00617172  hitchhiker  0.00000378083 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2993  lysyl-tRNA synthetase  40.49 
 
 		 501 aa  360  6e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2360  lysyl-tRNA synthetase, class-2  41.87 
 
 		 491 aa  360  8e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19490  lysyl-tRNA synthetase (class II)  42.28 
 
 		 499 aa  360  9e-98  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00347128  unclonable  0.00000000087404 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>