More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3542 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_3542  initiation factor 3  100 
 
 		 175 aa  358  3e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.407448  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3328  translation initiation factor IF-3  96 
 
 		 243 aa  347  5e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.825238  normal  0.390058 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2981  translation initiation factor 3  96.15 
 
 		 238 aa  309  1e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3025  translation initiation factor 3  96.15 
 
 		 238 aa  309  1e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.335133 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2996  translation initiation factor 3  96.15 
 
 		 238 aa  308  2e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.171641  normal  0.0309942 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11658  translation initiation factor IF-3  92.05 
 
 		 201 aa  293  6e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2418  translation initiation factor IF-3  85.71 
 
 		 196 aa  282  2.0000000000000002e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25690  translation initiation factor 3  77.85 
 
 		 168 aa  262  2e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5473  translation initiation factor IF-3  75.97 
 
 		 204 aa  247  7e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4144  translation initiation factor IF-3  79.17 
 
 		 227 aa  243  9.999999999999999e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0415962  hitchhiker  0.000102893 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3182  translation initiation factor IF-3  78.17 
 
 		 205 aa  241  3.9999999999999997e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0466683  normal  0.175076 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1728  initiation factor 3  78.99 
 
 		 149 aa  239  2e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00351932  hitchhiker  0.00163995 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2042  translation initiation factor IF-3  71.34 
 
 		 199 aa  237  6.999999999999999e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0708817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1882  translation initiation factor IF-3  76.81 
 
 		 204 aa  234  6e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0284235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1875  translation initiation factor IF-3  76.81 
 
 		 239 aa  233  8e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.384688 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3052  translation initiation factor IF-3  77.7 
 
 		 182 aa  233  8e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6087  Translation initiation factor 3 (IF-3)-like protein  76.81 
 
 		 222 aa  230  9e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.897729  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3071  translation initiation factor IF-3  69.87 
 
 		 182 aa  227  5e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.427548  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2139  translation initiation factor IF-3  76.98 
 
 		 177 aa  227  6e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0045601  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2459  translation initiation factor 3  75 
 
 		 243 aa  227  6e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1269  translation initiation factor 3  75.18 
 
 		 225 aa  226  9e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.628011  normal  0.508823 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5483  translation initiation factor IF-3  65.68 
 
 		 250 aa  225  3e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3039  translation initiation factor IF-3  67.3 
 
 		 212 aa  223  7e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.271102  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1624  translation initiation factor IF-3  64.16 
 
 		 415 aa  221  3e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.640548 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12250  translation initiation factor 3  74 
 
 		 195 aa  221  3e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.109497  normal  0.154931 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2066  translation initiation factor 3  75.54 
 
 		 179 aa  221  4e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.383221  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3169  translation initiation factor IF-3  72.14 
 
 		 277 aa  220  9.999999999999999e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2385  translation initiation factor IF-3  72.34 
 
 		 192 aa  218  5e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.157849  normal  0.289584 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22440  translation initiation factor 3  63.22 
 
 		 329 aa  216  1e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1103  translation initiation factor IF-3  70.47 
 
 		 233 aa  215  2e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0433779  normal  0.928932 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1316  translation initiation factor IF-3  65.64 
 
 		 351 aa  212  1.9999999999999998e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1477  translation initiation factor 3  69.06 
 
 		 396 aa  207  9e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0613769  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1480  translation initiation factor IF-3  69.06 
 
 		 356 aa  205  3e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000187235 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14590  translation initiation factor 3  67.38 
 
 		 401 aa  202  2e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21910  translation initiation factor 3  65.25 
 
 		 208 aa  196  2.0000000000000003e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.559617  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05720  translation initiation factor 3  61.03 
 
 		 207 aa  177  8e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000188671  normal  0.0169059 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1233  translation initiation factor IF-3  60.74 
 
 		 198 aa  176  1e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000135112  normal  0.0984034 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0232  translation initiation factor 3  57.79 
 
 		 211 aa  176  1e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.627991  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0534  translation initiation factor IF-3  57.33 
 
 		 165 aa  176  2e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000758155  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1301  translation initiation factor 3  56.71 
 
 		 175 aa  174  4e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.444006  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3622  translation initiation factor IF-3  58.87 
 
 		 357 aa  174  8e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0913675  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15200  translation initiation factor 3  56.93 
 
 		 197 aa  172  9.999999999999999e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000028162  normal  0.0802518 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0475  translation initiation factor IF-3  56.13 
 
 		 253 aa  169  1e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0522  translation initiation factor IF-3  57.45 
 
 		 193 aa  169  1e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.0000000692532  hitchhiker  0.000000579185 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1419  translation initiation factor IF-3  51.77 
 
 		 146 aa  160  7e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000288109  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1613  translation initiation factor IF-3  56.83 
 
 		 145 aa  160  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000306668  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1758  translation initiation factor 3  54.81 
 
 		 154 aa  158  4e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000120038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1218  translation initiation factor IF-3  52.05 
 
 		 173 aa  157  7e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0326522  normal  0.465185 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0766  translation initiation factor IF-3  55.88 
 
 		 181 aa  157  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0215  translation initiation factor IF-3  56.12 
 
 		 198 aa  156  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.62616e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2642  translation initiation factor IF-3  53.28 
 
 		 178 aa  155  2e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2172  translation initiation factor IF-3  51.08 
 
 		 154 aa  155  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000864988  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2400  translation initiation factor IF-3  53.24 
 
 		 164 aa  156  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00646191  normal  0.390668 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2769  translation initiation factor IF-3  53.28 
 
 		 178 aa  155  3e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2218  translation initiation factor IF-3  50.35 
 
 		 182 aa  155  3e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00000264089  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1249  translation initiation factor IF-3  54.81 
 
 		 174 aa  154  4e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.246001 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1937  translation initiation factor IF-3  54.74 
 
 		 174 aa  155  4e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.0464847 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0803  translation initiation factor IF-3  53.28 
 
 		 178 aa  153  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1412  translation initiation factor IF-3  51.08 
 
 		 143 aa  153  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000852308  normal  0.493061 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1516  translation initiation factor IF-3  53.24 
 
 		 172 aa  152  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.027432  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0207  translation initiation factor IF-3  54.41 
 
 		 173 aa  153  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0713  translation initiation factor 3  51.85 
 
 		 249 aa  152  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.814826 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2109  translation initiation factor IF-3  54.74 
 
 		 219 aa  152  2e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000273336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1383  translation initiation factor IF-3  51.08 
 
 		 187 aa  150  7e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111233  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4639  translation initiation factor IF-3  45.75 
 
 		 219 aa  150  7e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000486529  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1032  translation initiation factor IF-3  50 
 
 		 238 aa  150  8e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0671  translation initiation factor IF-3  55.15 
 
 		 192 aa  150  8e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.395911  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1161  translation initiation factor 3  54.74 
 
 		 154 aa  150  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41261  normal  0.930143 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1149  translation initiation factor IF-3  51.85 
 
 		 202 aa  150  1e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4267  translation initiation factor IF-3  54.48 
 
 		 178 aa  149  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0221  translation initiation factor IF-3  50.36 
 
 		 186 aa  149  2e-35  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.00015702  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0200  translation initiation factor IF-3  54.48 
 
 		 151 aa  149  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0065  translation initiation factor IF-3  52.24 
 
 		 145 aa  149  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1763  translation initiation factor 3  52.63 
 
 		 137 aa  149  2e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0660  translation initiation factor IF-3  52.24 
 
 		 176 aa  149  2e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000367528  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2466  translation initiation factor IF-3  49.64 
 
 		 177 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00240261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1968  translation initiation factor IF-3  49.64 
 
 		 183 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00361564  hitchhiker  0.00796429 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3480  translation initiation factor IF-3  49.64 
 
 		 183 aa  148  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0422454  normal  0.0155112 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0341  initiation factor 3  54.2 
 
 		 132 aa  149  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3224  translation initiation factor IF-3  49.64 
 
 		 183 aa  148  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.51494 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2307  translation initiation factor IF-3  51.8 
 
 		 154 aa  148  3e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00282878  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4532  translation initiation factor IF-3  53.73 
 
 		 204 aa  148  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.199562 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0069  translation initiation factor IF-3  51.49 
 
 		 171 aa  147  6e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.097761 
 
 
-
 
NC_004310  BR2117  translation initiation factor IF-3  54.2 
 
 		 134 aa  147  7e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.998323  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0798  translation initiation factor IF-3  52.94 
 
 		 202 aa  147  7e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2538  translation initiation factor IF-3  51.8 
 
 		 173 aa  147  7e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.838605  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2002  translation initiation factor 3  50 
 
 		 153 aa  147  7e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112753  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2660  translation initiation factor IF-3  52.21 
 
 		 190 aa  147  7e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000648528  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2032  translation initiation factor IF-3  54.2 
 
 		 134 aa  147  7e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0218  translation initiation factor IF-3  52.24 
 
 		 200 aa  147  7e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3158  translation initiation factor IF-3  51.11 
 
 		 173 aa  147  8e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4232  translation initiation factor IF-3  51.85 
 
 		 173 aa  147  9e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00738998 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0641  translation initiation factor IF-3  53.33 
 
 		 175 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0129727 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1319  translation initiation factor IF-3  50.35 
 
 		 190 aa  147  1.0000000000000001e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0918782  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3024  translation initiation factor IF-3  52.21 
 
 		 173 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4742  translation initiation factor IF-3  51.11 
 
 		 176 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.676759  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0077  translation initiation factor IF-3  51.49 
 
 		 171 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.646828  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1678  translation initiation factor IF-3  55.47 
 
 		 170 aa  146  1.0000000000000001e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0127847  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0168  translation initiation factor IF-3  52.67 
 
 		 132 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4683  translation initiation factor IF-3  51.85 
 
 		 166 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000101645  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>