89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3406 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3406  hypothetical protein  100 
 
 
296 aa  580  1e-164  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.529097  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3139  hypothetical protein  80.68 
 
 
297 aa  429  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.739735  normal  0.0458483 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2879  hypothetical protein  68.47 
 
 
304 aa  347  1e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2892  hypothetical protein  68.47 
 
 
304 aa  347  1e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.619599  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2848  hypothetical protein  68.47 
 
 
304 aa  347  1e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11853  hypothetical protein  62.67 
 
 
307 aa  325  8.000000000000001e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2730  protein of unknown function DUF881  39.25 
 
 
306 aa  123  4e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.242021  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1230  hypothetical protein  34.25 
 
 
301 aa  115  7.999999999999999e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3123  protein of unknown function DUF881  32.85 
 
 
292 aa  114  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1305  protein of unknown function DUF881  33.56 
 
 
286 aa  108  1e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.498875  normal  0.86691 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4014  protein of unknown function DUF881  43.15 
 
 
299 aa  107  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.328568  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2386  hypothetical protein  31.02 
 
 
309 aa  99  8e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18230  hypothetical protein  32.04 
 
 
288 aa  98.2  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.509539  normal  0.646857 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2105  protein of unknown function DUF881  31.73 
 
 
273 aa  91.7  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.489208  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1889  protein of unknown function DUF881  33.77 
 
 
306 aa  90.5  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.193869 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2524  hypothetical protein  31.72 
 
 
316 aa  89.7  5e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1735  protein of unknown function DUF881  31.19 
 
 
290 aa  88.6  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.980276  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3100  protein of unknown function DUF881  38.41 
 
 
290 aa  87.8  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0127395 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15490  hypothetical protein  29.27 
 
 
315 aa  85.1  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0476  hypothetical protein  28.83 
 
 
325 aa  85.5  0.000000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.75906  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1464  hypothetical protein  31.58 
 
 
300 aa  77  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.420029  normal  0.0366488 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5001  hypothetical protein  37.24 
 
 
297 aa  77  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0214  hypothetical protein  31.19 
 
 
245 aa  76.3  0.0000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2717  hypothetical protein  34.29 
 
 
286 aa  75.9  0.0000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.270572  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0014  protein of unknown function DUF881  38.78 
 
 
257 aa  75.9  0.0000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0830  hypothetical protein  28.51 
 
 
239 aa  73.2  0.000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0105495  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0147  protein of unknown function DUF881  32.14 
 
 
236 aa  73.6  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2249  hypothetical protein  27.63 
 
 
244 aa  72.4  0.000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1557  protein of unknown function DUF881  31.78 
 
 
234 aa  70.9  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000499262  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0132  hypothetical protein  38 
 
 
296 aa  68.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0808473  normal  0.140959 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15010  hypothetical protein  32.39 
 
 
276 aa  67.8  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.290964  normal  0.849672 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0781  protein of unknown function DUF881  32 
 
 
247 aa  67.8  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000128964  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0028  hypothetical protein  29.79 
 
 
251 aa  67.4  0.0000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0801  hypothetical protein  35.14 
 
 
349 aa  67  0.0000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0026  protein of unknown function DUF881  31.72 
 
 
249 aa  66.6  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.131728  normal  0.126643 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0072  protein of unknown function DUF881  32.67 
 
 
242 aa  66.2  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2006  hypothetical protein  27.41 
 
 
240 aa  66.2  0.0000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.124974  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0015  hypothetical protein  32.47 
 
 
263 aa  66.2  0.0000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1430  hypothetical protein  33.18 
 
 
234 aa  65.9  0.0000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0373579  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0167  protein of unknown function DUF881  36.45 
 
 
253 aa  65.9  0.0000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.942049  normal  0.647694 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0052  hypothetical protein  35.48 
 
 
309 aa  65.1  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.274482  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27030  hypothetical protein  28.45 
 
 
252 aa  65.5  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.99659  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0057  hypothetical protein  38.2 
 
 
267 aa  64.7  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.573043 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0814  hypothetical protein  32.53 
 
 
253 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.244335  normal  0.77774 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0022  protein of unknown function DUF881  30.22 
 
 
243 aa  64.3  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2283  hypothetical protein  29.25 
 
 
249 aa  63.9  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0076216  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0042  protein of unknown function DUF881  28.33 
 
 
270 aa  63.9  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00160  hypothetical protein  32.85 
 
 
250 aa  63.2  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0680  hypothetical protein  27.15 
 
 
233 aa  62.8  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.196339  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0020  hypothetical protein  31.29 
 
 
272 aa  62.8  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.987463 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2250  hypothetical protein  31.63 
 
 
242 aa  61.2  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1060  protein of unknown function DUF881  30.77 
 
 
243 aa  61.6  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0681  hypothetical protein  31.54 
 
 
230 aa  61.2  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0718153  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0148  protein of unknown function DUF881  31.84 
 
 
230 aa  61.2  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0021  hypothetical protein  29.21 
 
 
273 aa  60.8  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1558  protein of unknown function DUF881  28.16 
 
 
215 aa  59.7  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0909499  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10012  hypothetical protein  30.87 
 
 
262 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0013  hypothetical protein  29.87 
 
 
278 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.447564 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1386  hypothetical protein  26.95 
 
 
266 aa  57.8  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00318701  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0021  hypothetical protein  29.87 
 
 
278 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0210861 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0013  hypothetical protein  29.87 
 
 
278 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2103  protein of unknown function DUF881  28.9 
 
 
246 aa  54.7  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2109  hypothetical protein  26.67 
 
 
243 aa  54.7  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0163543  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0021  protein of unknown function DUF881  28.19 
 
 
280 aa  54.7  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00170  hypothetical protein  30.17 
 
 
234 aa  53.9  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0524836  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4438  hypothetical protein  30.77 
 
 
329 aa  53.5  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.226653  normal  0.348599 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1061  protein of unknown function DUF881  27.73 
 
 
234 aa  53.1  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1075  hypothetical protein  27.97 
 
 
233 aa  53.5  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0799  hypothetical protein  25.9 
 
 
278 aa  52.8  0.000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1823  hypothetical protein  26.75 
 
 
243 aa  52.4  0.000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00133406  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0033  protein of unknown function DUF881  29.32 
 
 
255 aa  52  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.249833  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1285  protein of unknown function DUF881  31.55 
 
 
246 aa  51.2  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4012  protein of unknown function DUF881  32.99 
 
 
255 aa  51.2  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.033042  normal  0.20128 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11855  hypothetical protein  31.08 
 
 
292 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12540  hypothetical protein  27.21 
 
 
331 aa  49.7  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1284  protein of unknown function DUF881  27.88 
 
 
234 aa  49.3  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.954105  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2715  hypothetical protein  36.04 
 
 
245 aa  49.3  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0632611  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1431  hypothetical protein  23.64 
 
 
238 aa  47.8  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.17919  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2728  protein of unknown function DUF881  30 
 
 
309 aa  48.1  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.428607  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3098  protein of unknown function DUF881  32.67 
 
 
258 aa  47.4  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0474  hypothetical protein  24.41 
 
 
273 aa  46.6  0.0005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.166474  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3137  hypothetical protein  26.97 
 
 
254 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.428458  normal  0.0440298 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3404  hypothetical protein  27.45 
 
 
254 aa  45.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227023  normal  0.997243 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1737  protein of unknown function DUF881  29.24 
 
 
383 aa  44.7  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.588526  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0569  protein of unknown function DUF881  24.16 
 
 
243 aa  43.9  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.787113  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3126  protein of unknown function DUF881  31.3 
 
 
571 aa  43.1  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2890  hypothetical protein  29.22 
 
 
270 aa  42.7  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2846  hypothetical protein  29.22 
 
 
270 aa  42.7  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2877  hypothetical protein  29.22 
 
 
270 aa  42.7  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>