More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3403 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3403  glycine cleavage system protein H  100 
 
 
131 aa  261  2e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0792246  normal  0.940944 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3136  glycine cleavage system protein H  84.73 
 
 
131 aa  228  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323825  normal  0.0420611 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2845  glycine cleavage system protein H  77.86 
 
 
131 aa  207  4e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2876  glycine cleavage system protein H  77.86 
 
 
131 aa  207  4e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2889  glycine cleavage system protein H  77.86 
 
 
131 aa  207  4e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.486572  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11856  glycine cleavage system protein H  68.66 
 
 
134 aa  192  2e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.795989 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2340  glycine cleavage system H protein  62.02 
 
 
134 aa  166  1e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.391703  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2776  glycine cleavage system H protein  63.49 
 
 
134 aa  159  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0264905  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3127  glycine cleavage system H protein  61.72 
 
 
126 aa  157  6e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5357  glycine cleavage system H protein  60.98 
 
 
126 aa  155  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4998  glycine cleavage system protein H  60.16 
 
 
126 aa  143  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1227  glycine cleavage system H protein  56.91 
 
 
130 aa  141  2e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2383  glycine cleavage system H protein  58.87 
 
 
126 aa  141  3e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1467  glycine cleavage system protein H  58.59 
 
 
126 aa  139  9.999999999999999e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0733861 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1540  glycine cleavage system H protein  56.15 
 
 
133 aa  137  4.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.186555  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13860  glycine cleavage system H protein  56.82 
 
 
128 aa  137  4.999999999999999e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3591  glycine cleavage system protein H  51.94 
 
 
129 aa  136  7.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.961592  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3097  glycine cleavage system H protein  55.04 
 
 
127 aa  136  8.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.215874  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1541  glycine cleavage system H protein  57.14 
 
 
128 aa  136  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001692 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00862  glycine cleavage system protein H  51.94 
 
 
129 aa  135  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3743  glycine cleavage system H protein  57.98 
 
 
125 aa  135  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14980  glycine cleavage system H protein  55.28 
 
 
129 aa  134  3.0000000000000003e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0575486  normal  0.572027 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3363  glycine cleavage system H protein  57.55 
 
 
127 aa  134  5e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.722606 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1812  glycine cleavage system protein H  51.54 
 
 
131 aa  133  7.000000000000001e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4011  glycine cleavage system H protein  55.38 
 
 
134 aa  132  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.109498  normal  0.181592 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1124  glycine cleavage system H protein  54.84 
 
 
129 aa  133  9.999999999999999e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2521  glycine cleavage system H protein  54.84 
 
 
126 aa  132  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.344987  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1612  glycine cleavage system protein H  54.26 
 
 
127 aa  131  3e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.645617  normal  0.608002 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2621  glycine cleavage system protein H  52.34 
 
 
128 aa  131  3e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.233728  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2715  glycine cleavage system protein H  52.34 
 
 
128 aa  131  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0960  glycine cleavage system H protein  51.54 
 
 
130 aa  130  7.999999999999999e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1915  glycine cleavage system H protein  59.81 
 
 
124 aa  130  7.999999999999999e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0014329 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0717  glycine cleavage system H protein  53.91 
 
 
128 aa  129  1.0000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1244  glycine cleavage system protein H  51.56 
 
 
128 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1275  glycine cleavage system H protein  48.06 
 
 
129 aa  128  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.421201  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2933  glycine cleavage system protein H  50 
 
 
127 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00141908  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0252  glycine cleavage system H protein  57.94 
 
 
129 aa  128  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.801737  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1698  glycine cleavage system H protein  52.76 
 
 
126 aa  129  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2055  glycine cleavage system H protein  53.12 
 
 
127 aa  129  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2714  glycine cleavage system H protein  53.6 
 
 
128 aa  128  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0651249  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3915  glycine cleavage system H protein  48.06 
 
 
128 aa  128  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2758  glycine cleavage system protein H  51.94 
 
 
130 aa  128  3e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2720  glycine cleavage system protein H  48.82 
 
 
129 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0615009  normal  0.778842 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3183  glycine cleavage system protein H  56.6 
 
 
126 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000182392  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0290  glycine cleavage system protein H  46.03 
 
 
130 aa  127  6e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.148153  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1903  glycine cleavage system protein H  46.03 
 
 
130 aa  127  6e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13340  glycine cleavage system H protein  50.81 
 
 
127 aa  127  7.000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3436  glycine cleavage system protein H  49.21 
 
 
135 aa  127  7.000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1893  glycine cleavage system protein H  51.16 
 
 
127 aa  125  1.0000000000000001e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.262641 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2523  glycine cleavage system protein H  49.22 
 
 
127 aa  125  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.85836  normal  0.122501 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2869  glycine cleavage system protein H  48.09 
 
 
129 aa  126  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5135  glycine cleavage system protein H  50.82 
 
 
127 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00103553  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0623  glycine cleavage system protein H  49.61 
 
 
130 aa  125  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3150  glycine cleavage system protein H  48.82 
 
 
129 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000198497  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01205  glycine cleavage system protein H  48.78 
 
 
125 aa  125  2.0000000000000002e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0862464  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0839  glycine cleavage system protein H  48.82 
 
 
130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5130  glycine cleavage system protein H  50.82 
 
 
127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365083  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3586  glycine cleavage system protein H  51.64 
 
 
127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000166607  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5133  glycine cleavage system protein H  50.82 
 
 
127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000135708  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0780  glycine cleavage system protein H  48.82 
 
 
129 aa  125  3e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3323  glycine cleavage system protein H  48.41 
 
 
129 aa  125  3e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1944  glycine cleavage system H protein  52.46 
 
 
130 aa  125  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000190356 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0953  glycine cleavage system protein H  48.36 
 
 
126 aa  125  3e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3330  glycine cleavage system protein H  48.82 
 
 
129 aa  125  3e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.277505  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0623  glycine cleavage system protein H  48.82 
 
 
129 aa  124  3e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0735032  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0766  glycine cleavage system H protein  53.21 
 
 
127 aa  124  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0105  glycine cleavage system protein H  50.82 
 
 
127 aa  125  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000835004  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3500  glycine cleavage system protein H  48.82 
 
 
129 aa  125  3e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.497243  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3210  glycine cleavage system protein H  48.82 
 
 
129 aa  124  3e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0184338  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3674  glycine cleavage system protein H  48.03 
 
 
129 aa  124  3e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4859  glycine cleavage system protein H  50.82 
 
 
127 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000908449  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4700  glycine cleavage system protein H  50.82 
 
 
127 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213752  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4716  glycine cleavage system protein H  50.82 
 
 
127 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000916909  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3676  glycine cleavage system protein H  48.82 
 
 
129 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134478  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5097  glycine cleavage system protein H  50.82 
 
 
127 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3618  glycine cleavage system protein H  48.82 
 
 
129 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5228  glycine cleavage system protein H  50.82 
 
 
127 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000143615  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0834  glycine cleavage system protein H  48.82 
 
 
129 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3800  glycine cleavage system protein H  48.82 
 
 
129 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0618  glycine cleavage system protein H  48.82 
 
 
129 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.475927  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3310  glycine cleavage system protein H  47.2 
 
 
136 aa  124  4.0000000000000003e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02736  glycine cleavage system protein H  45.8 
 
 
129 aa  124  5e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0429973  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0788  glycine cleavage system H protein  45.8 
 
 
129 aa  124  5e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471951  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3224  glycine cleavage system protein H  45.8 
 
 
129 aa  124  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226187  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0805  glycine cleavage system protein H  45.8 
 
 
129 aa  124  5e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0782061  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02699  hypothetical protein  45.8 
 
 
129 aa  124  5e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0553776  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3325  glycine cleavage system protein H  45.8 
 
 
129 aa  124  5e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4195  glycine cleavage system protein H  45.8 
 
 
129 aa  124  5e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3036  glycine cleavage system protein H  45.8 
 
 
129 aa  124  5e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.197625  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3212  glycine cleavage system protein H  45.8 
 
 
129 aa  124  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0254293  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3391  glycine cleavage system protein H  45.8 
 
 
129 aa  124  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.317969  normal  0.844228 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3063  glycine cleavage system protein H  45.8 
 
 
129 aa  124  5e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1719  glycine cleavage system H protein  46.15 
 
 
130 aa  124  5e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.891721 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3286  glycine cleavage system protein H  45.8 
 
 
129 aa  124  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3289  glycine cleavage system protein H  45.8 
 
 
129 aa  124  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1497  glycine cleavage system H protein  48.84 
 
 
126 aa  124  5e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0485  glycine cleavage system protein H  43.75 
 
 
126 aa  124  6e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3608  glycine cleavage system H protein  51.75 
 
 
140 aa  123  6e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.039586  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4814  glycine cleavage system protein H  50.82 
 
 
127 aa  123  7e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00016491  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0247  glycine cleavage system protein H  48.09 
 
 
128 aa  123  8.000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>